第一章 竹子分子生物学研究进展 1
第一节 分子标记辅助育种研究进展 1
第二节 竹类植物功能基因分离 3
一、细胞壁生物合成相关基因 4
二、光合作用相关基因 5
三、抗逆相关基因 5
四、开花相关基因 6
五、竹类植物开花基因克隆 7
六、竹类植物基因组研究 8
七、竹类植物功能基因组学研究发展前景 10
第二章 木质素相关合成酶基因克隆与转录调控研究 12
第一节 研究背景 12
第二节 植物木质素生物合成酶4CL基因的遗传进化分析 13
一、材料和方法 14
二、结果分析 16
三、展望 20
第三节 慈竹木质素关键酶基因克隆、生物信息学与组织表达 20
一、慈竹木质素关键酶4CL基因克隆及其生物信息学分析 21
二、慈竹C3H基因克隆及其生物信息学分析 27
三、慈竹CCoAOMT基因克隆及其生物信息学分析 36
四、慈竹C4H基因克隆及其生物信息学分析 45
五、慈竹COMT基因克隆及其生物信息学分析 53
六、肉桂酰辅酶A还原酶基因克隆及其生物信息学分析 60
七、慈竹木质素关键酶基因组织表达分析 67
第四节 慈竹木质素关键酶4CL基因功能验证 69
一、慈竹4CL基因RNAi表达载体的构建 69
二、pBI-4CL-RNAi转化烟草的研究 75
第五节 慈竹4CL基因农杆菌遗传转化梁山慈竹的研究 83
一、材料与方法 83
二、结果与分析 86
三、讨论与结论 90
第六节 植物木质素生物合成转录调控及生物信息学分析 91
一、材料与方法 91
二、结果与讨论 94
三、结论 100
第三章 纤维素相关合成酶基因研究 102
第一节 研究背景 102
第二节 绿竹与毛竹纤维素合成酶的生物信息学分析 103
一、材料与方法 103
二、结果与分析 104
三、讨论与结论 109
第三节 慈竹纤维素合成酶基因克隆、表达与生物信息学研究 110
一、试验材料 110
二、试验方法 110
三、结果与结论 114
第四章 SuSy基因研究 136
第一节 研究背景 136
第二节 慈竹SuSy基因克隆与生物信息学分析 137
一、试验材料与方法 137
二、结果分析 141
三、讨论与结论 155
第三节 慈竹与梁山慈竹UGP基因克隆与生物信息学分析 157
一、试验材料与方法 158
二、结果分析 161
三、讨论与结论 167
第四节 慈竹SUS和UGP基因的组织表达模式分析 170
一、试验材料与方法 170
二、结果与分析 172
三、讨论与结论 174
第五节 慈竹BeSUS3基因和梁山慈竹DfUGP基因植物过表达载体的构建 175
一、试验材料及方法 175
二、结果分析 176
三、结论 178
第六节 梁山慈竹pCAMBIA 1303-DfUGP质粒转化烟草 178
一、试验材料及方法 178
二、结果分析 181
三、讨论与结论 182
第五章 MYB和WRKY转录因子的克隆与胁迫诱导表达 185
第一节 研究背景 185
第二节 基于慈竹转录组的2个MBY转录因子的克隆及胁迫诱导表达分析 187
一、材料和方法 187
二、结果与分析 188
三、讨论与结论 193
第三节 慈竹WRKY转录因子的克隆及其胁迫诱导表达 194
一、材料与方法 194
二、结果分析 195
三、讨论与结论 198
第六章 慈竹转录组研究 201
第一节 研究背景 201
第二节 慈竹转录组分析 202
一、试验材料与方法 202
二、总RNA样品检测结果 203
三、测序数据质量评估与统计 206
四、组装结果统计 210
五、基因结构分析 213
六、基因的功能注释与表达分析 215
七、与其他物种的比对分析 240
参考文献 244
缩略语 255