第一章 数量性状的概念及研究进展 1
第一节 分子数量遗传学的研究简史 1
第二节 数量性状的概念和遗传特点 2
第三节 数量性状基因研究的工具 2
一、分子标记的种类 2
二、分子标记应用领域 3
第四节 数量性状基因（QTL）定位研究进展和展望 4
一、QTL分析方法 4
二、QTL定位研究进展 5
三、QTL定位的应用展望 6
参考文献 8
第二章 小麦数量性状遗传分析方法 9
第一节 遗传群体类型及群体质量 9
一、遗传群体类型 9
二、遗传群体构建方法及注意事项 13
三、遗传群体质量 17
第二节 遗传标记类型及其应用 18
一、形态标记 18
二、细胞学标记 18
三、生化标记 18
四、DNA分子标记 18
第三节 数量性状统计和定位方法 21
一、数量性状定位原理 22
二、数量性状定位方法 22
第四节 数量性状基因定位分析新进展 24
一、条件QTL定位及其研究内容 25
二、表达谱QTL（eQTL）定位方法 27
三、种质资源新基因发掘的QTL定位方法 27
参考文献 28
第三章 小麦分子遗传图的构建 31
第一节 遗传图及其构建方法 32
一、遗传图的概念 32
二、遗传图构建方法 32
第二节 遗传图的构建及图谱的特点 33
一、‘花培3号’ב豫麦57’DH群体的遗传图 33
二、‘糯麦1号’ב藁城8901’RIL群体的遗传图 43
三、‘山农01-35’ב藁城9411’RIL群体的遗传图 48
四、整合SNP标记的RIL群体高密度遗传图 52
五、小麦自然群体的SNP标记高密度遗传图 55
六、骨干亲本“矮孟牛”衍生系群体的遗传图 64
第三节 遗传图构建的研究进展 72
一、本课题组构建的遗传图与前人遗传图的比较分析 72
二、已发表的主要小麦分子遗传图汇总 73
参考文献 75
第四章 小麦主要产量性状的遗传解析 78
第一节 主要产量性状遗传解析的材料与方法 78
一、产量性状遗传解析的群体和种植 78
二、产量性状调查和数据处理 79
第二节 基于‘花培3号’ב豫麦57’DH群体的产量性状QTL定位和效应分析 80
一、籽粒产量和穗部性状的表型变异及相关性分析 80
二、籽粒产量和穗部性状的QTL定位及效应分析 82
第三节 基于‘糯麦1号’ב藁城8901’RIL群体产量性状的QTL定位和效应分析 86
一、穗部性状的表型变异及相关性分析 86
二、穗部性状的QTL定位及效应分析 87
第四节 基于‘山农01-35’ב藁城9411’RIL群体产量性状的QTL定位和效应分析 90
一、穗部性状的表型变异和QTL定位分析 90
二、籽粒性状的表型变异和QTL定位分析 94
第五节 三个群体产量性状QTL定位结果汇总与比较 96
第六节 基于DH群体和IF2群体穗部性状QTL及杂种优势位点（HL）分析 98
一、穗部性状QTL及杂种优势位点（HL）分析材料与方法 98
二、穗粒数QTL定位及杂种优势分析 99
三、穗粒重QTL定位及杂种优势分析 103
第七节 基于SNP高密度遗传图的千粒重的QTL分析 107
一、基于SNP高密度遗传图的千粒重的QTL分析材料与方法 107
二、SNP分子标记和遗传图 107
三、千粒重的QTL定位 108
四、关于小麦粒重QTL分析的讨论 110
第八节 基于小麦骨干亲本“矮孟牛”群体的穗部性状的关联分析 110
一、骨干亲本“矮孟牛”群体穗部性状的关联分析材料与方法 111
二、穗部性状——标记间的关联分析 111
第九节 产量性状QTL定位与前人结果的对比分析 117
一、小麦产量性状QTL研究进展概述 117
二、本课题组研究结果与前人研究的比较分析 124
参考文献 125
第五章 小麦主要品质性状的遗传解析 127
第一节 籽粒品质QTL的定位及效应分析 127
一、籽粒品质性状的QTL分析 127
二、籽粒特性QTL研究进展与本研究的比较分析 133
第二节 营养品质性状的QTL定位及效应分析 134
一、籽粒和面粉蛋白质含量的QTL分析 135
二、有益矿质元素的QTL分析 146
三、籽粒氨基酸含量及组分的QTL分析 154
四、类胡萝卜素和其他色素的QTL定位 161
第三节 面粉品质性状的QTL定位及效应分析 165
一、面筋含量和面筋指数的QTL分析 166
二、面粉白度、色泽、PPO活性的QTL分析 170
三、沉淀值的QTL分析 179
四、淀粉糊化特性（RVA）的QTL分析 185
五、降落值的QTL分析 199
六、淀粉含量及组分的QTL分析 202
第四节 面团品质性状的QTL定位及效应分析 206
一、粉质仪参数的QTL分析 206
二、揉混仪参数的QTL分析 212
三、面团吹泡仪参数的QTL分析 220
第五节 加工品质性状的QTL定位及效应分析 225
一、面条加工品质性状的QTL分析 225
二、面条质构分析（TPA）参数的QTL分析 229
三、馒头品质的QTL分析 235
参考文献 249
第六章 小麦主要生理和形态性状的遗传解析 255
第一节 小麦光合特性相关性状的QTL定位 255
一、田间小麦光合特性QTL定位 256
二、人工气候室苗期光合特性QTL定位 263
三、小麦光合特性QTL研究进展与本研究的比较分析 267
第二节 小麦茎秆显微解剖特性的QTL分析 271
一、茎秆基部第二节间显微解剖性状的QTL定位 271
二、穗下节间显微解剖性状的QTL定位 276
三、小麦茎秆显微解剖性状QTL研究进展与本研究的比较分析 284
第三节 小麦抽穗期的QTL定位及效应分析 286
一、小麦抽穗期QTL定位 286
二、小麦生育期QTL研究进展与本研究的比较分析 291
第四节 低温下小麦叶片细胞膜透性的QTL定位及效应分析 293
一、低温下小麦叶片细胞膜透性的QTL定位 293
二、小麦抗寒性QTL研究进展与本研究的比较分析 295
第五节 小麦根系性状QTL定位及效应分析 297
一、小麦根系性状QTL定位 297
二、小麦根系性状QTL研究进展与本研究的比较分析 303
第六节 小麦叶部形态性状QTL定位及效应分析 306
一、基于DH群体叶部形态的QTL定位 307
二、基于“矮孟牛”衍生系自然群体叶部形态的关联分析 313
三、小麦叶部形态QTL研究进展与本研究的比较分析 319
参考文献 320
第七章 小麦主要抗逆性状的遗传解析 323
第一节 抗旱性的QTL定位及效应分析 323
一、抗旱性QTL定位 324
二、抗旱性QTL研究进展与本研究的比较分析 329
第二节 抗重金属胁迫QTL定位及效应分析 330
一、耐镉（Cd）胁迫QTL定位 330
二、耐铬（Cr）胁迫QTL定位 338
三、小麦抗重金属QTL研究进展与本研究的比较分析 344
第三节 小麦抗穗发芽QTL定位及效应分析 346
一、抗穗发芽QTL定位 347
二、小麦抗穗发芽QTL研究进展与本研究的比较分析 350
第四节 小麦抗病性QTL定位及效应分析 352
一、小麦白粉病成株抗性的QTL分析 352
二、小麦赤霉病抗性的QTL分析 354
三、小麦抗病QTL研究进展及与本研究的比较分析 355
第五节 小麦耐盐性的QTL定位及效应分析 360
一、小麦耐盐性的QTL定位 361
二、小麦耐盐性的QTL研究进展与本研究的比较分析 370
第六节 小麦苗期抗钾胁迫QTL定位及效应分析 371
一、苗期抗钾胁迫QTL定位的材料和试验方法 372
二、苗期抗钾胁迫的QTL定位及效应分析 373
三、小麦抗钾胁迫的QTL定位进展与本研究的比较分析 380
参考文献 381
第八章 条件QTL分析及其在作物育种和栽培中的应用 385
第一节 小麦籽粒蛋白质积累动态的条件QTL分析 385
一、籽粒蛋白质积累动态的条件QTL定位结果 386
二、研究结果与前人同类研究的比较分析 391
第二节 小麦籽粒淀粉积累动态的条件QTL分析 392
一、小麦籽粒淀粉积累动态的条件QTL定位结果 393
二、研究结果与前人同类研究的比较分析 397
第三节 蛋白质和淀粉互为条件的QTL分析 398
一、蛋白质和淀粉互为条件的QTL定位结果 398
二、研究结果与前人同类研究的比较分析 407
第四节 小麦株高发育动态QTL定位 407
一、株高发育动态QTL的定位结果 407
二、研究结果与前人同类研究的比较分析 413
第五节 小麦穗干重和千粒重发育动态的QTL分析 414
一、穗干重和千粒重发育动态QTL分析结果 414
二、研究结果与前人同类研究的比较分析 424
第六节 基于粒长和粒宽的千粒重的条件QTL分析 425
一、千粒重的条件QTL分析结果 425
二、本研究结果与前人研究结果的比较分析 434
第七节 基于7个品质性状的沉淀值的条件QTL分析 435
一、沉淀值的条件QTL分析结果 435
二、研究结果与前人研究同类的比较分析 441
第八节 两种供氮水平下小麦冠层性状的条件和非条件QTL分析 441
一、不同氮素水平下小麦冠层性状的条件QTL定位结果 442
二、研究结果与前人同类研究的比较分析 448
第九节 小麦穗数、穗粒数和粒重相互关系的条件QTL分析 448
一、穗数、穗粒数和千粒重的条件QTL分析结果 449
二、研究结果与前人同类研究的比较分析 460
第十节 小麦产量与产量构成因素的条件QTL分析 460
一、产量与产量构成因素的条件QTL分析结果 461
二、研究结果与前人同类研究的比较分析 464
第十一节 条件QTL分析在分子育种和分子栽培中的作用 465
一、条件QTL在分子育种中的应用 465
二、条件QTL在分子栽培中的应用 465
参考文献 467
第九章 分子标记辅助育种 474
第一节 分子标记辅助育种的概念及其研究进展 475
一、分子标记辅助育种的概念和特点 475
二、分子标记辅助育种的重要性 475
三、小麦分子标记辅助育种研究进展 476
第二节 分子标记辅助选择育种的技术路线 479
一、分子标记辅助选择育种的目标性状 479
二、含有QTL优异等位基因的分子育种元件的创制及其应用 480
三、常规育种全程、多位点分子标记辅助选择技术路线 484
四、借助MAS实施基因/QTL转移的技术路线 487
五、借助MAS实施的基因/QTL聚合育种的技术路线 488
六、借助MAS实施品种设计的技术路线 489
第三节 主要产量性状的分子标记及其应用 491
一、主要产量性状的分子标记 492
二、主要产量性状分子标记的应用 499
第四节 主要品质性状的分子标记及其应用 506
一主要品质性状的分子标记 506
二、主要品质性状分子标记的应用 514
第五节 主要生理性状的分子标记及其应用 519
一、主要生理性状的分子标记 519
二、主要生理性状分子标记的应用 524
第六节 主要抗逆性状的分子标记及其应用 529
一、主要抗逆性状的分子标记 529
二、主要抗逆性状的分子标记及其应用 536
参考文献 549
索引 555
后记 567