第一篇 细胞自噬基因的结构与功能 3
第一章细胞自噬概论 3
第一节细胞自噬的定义 3
第二节细胞自噬的形式 3
第三节细胞自噬的诱导因子 4
第四节细胞自噬的分子基础 4
第五节细胞自噬的信号转导 7
第六节细胞自噬的生理意义 7
第七节细胞自噬与疾病 11
第八节本书内容 20
第二章细胞自噬的基本特征 24
第一节细胞死亡的分类及其特征 24
第二节自噬相关重要细胞器——溶酶体 27
第三节细胞自噬的诱导因素 29
第四节细胞自噬的发展过程 34
第五节细胞自噬的生物学功能 39
第三章Atg基因家族 45
第一节Atg基因结构与编码蛋白 45
第二节Atg蛋白的生物学功能 57
第四章细胞自噬相关基因 62
第一节细胞自噬相关细胞膜分子 62
第二节细胞自噬相关转录因子（包括负调控因子） 65
第二篇 细胞自噬的信号转导 79
第五章细胞自噬的Wnt信号途径 79
第一节Wnt信号途径的基本特征 79
第二节Wnt信号通路的功能调控 86
第三节Wnt信号途径与细胞自噬的调控 88
第六章细胞自噬的STAT信号途径 93
第一节STAT信号途径的功能特征 93
第二节细胞自噬对STAT信号途径的影响 100
第七章细胞自噬的PI3K/Akt/mTOR信号途径 104
第一节P13K/Akt/mTOR信号途径的生长分化调控 104
第二节细胞自噬与mTOR信号通路的调控 115
第八章细胞自噬的MAPK/JNK信号途径 125
第一节MAPK/JNK信号途径的功能特征 125
第二节MAPK/JNK信号途径与细胞自噬的调节 132
第九章细胞自噬的其他信号途径 136
第一节钙离子稳态反对细胞自噬的调节 136
第二节GRp78/Bip和LAMP的结构与功能 140
第三篇 细胞自噬的生理学和病理学基础 153
第十章细胞自噬的酶学基础 153
第十一章活性氧与细胞自噬 168
第一节活性氧 168
第二节自噬与活性氧 173
第十二章分子伴侣与自噬 182
第一节分子伴侣 182
第二节自噬 186
第三节分子伴侣介导的细胞自噬 188
第十三章内质网应激与细胞自噬 200
第一节内质网应激的机制及特征 200
第二节细胞自噬与内质网应激之间的关系 202
第三节干预内质网应激与细胞自噬相互的临床意义 205
第十四章细胞周期与细胞自噬 210
第十五章细胞凋亡与细胞自噬 217
第一节细胞死亡 217
第二节细胞自噬与细胞凋亡的异同 220
第三节细胞自噬与细胞凋亡的相互关系 225
第十六章细胞外基质与细胞自噬 229
第一节细胞外基质 229
第二节ECM与细胞自噬 239
第十七章肿瘤基因与细胞自噬 244
第一节自噬执行基因 244
第二节参与自噬调节的基因 247
第三节与自噬相关的癌基因和抑癌基因 252
第四节其他与自噬相关的肿瘤基因 256
第十八章泛素化 262
第一节泛素和泛素化修饰 262
第二节泛素-蛋白酶体途径 264
第三节参与泛素化反应的酶 266
第四节蛋白质底物的泛素化信号 268
第五节泛素化的结局——进入蛋白酶体降解 269
第六节去泛素化及相关酶 272
第七节泛素-蛋白酶体系统的细胞生物学功能 274
第八节泛素-蛋白酶体途径与临床疾病 277
第九节蛋白质的SUMO修饰及其与UPS系统的联系 279
第十节细胞自噬与泛素化蛋白酶系统 283
第十九章趋化因子与细胞自噬 292
第一节趋化因子 292
第二节趋化因子研究的技术和意义 301
第三节趋化因子与自噬之间的关系研究 306
第二十章细胞自噬与发育生物学 310
第二十一章细胞自噬与免疫学 318
第一节自噬与免疫系统发育 318
第二节自噬与免疫途径 323
第三节APC细胞与自噬、免疫耐受 331
第二十二章自噬与衰老 336
第二十三章细胞自噬与组织器官的缺血-再灌注损伤 348
第一节缺血-再灌注损伤的发生机制 348
第二节细胞自噬与缺血-再灌注损伤 353
第三节NOD样受体信号通路与肝炎病毒感染 360
第四篇 细胞自噬与临床疾病 371
第二十四章细胞自噬与心血管疾病 371
第二十五章细胞自噬与神经系统疾病 384
第一节细胞自噬与神经系统疾病诱生因素 384
第二节细胞自噬与神经系统疾病 389
第二十六章细胞自噬与血液系统疾病 406
第一节血液系统与血液系统疾病 406
第二节常见的血液系统疾病及特点 408
第三节细胞自噬与血液系统疾病 409
第四节展望 415
第二十七章自噬与内分泌代谢性疾病 418
第一节内分泌系统与内分泌激素 418
第二节内分泌系统疾病 419
第三节内分泌代谢性疾病与细胞自噬 421
第二十八章细胞自噬与自身免疫性疾病 432
第一节自身免疫与自身免疫性疾病 432
第二节细胞自噬与自身免疫性疾病 434
第二十九章细胞自噬与泌尿系统疾病 441
第一节泌尿系统概述 441
第二节自噬与肾脏疾病 442
第三节自噬与膀胱疾病 445
第四节自噬与前列腺疾病 447
第三十章细胞自噬与肝脏疾病 454
第一节细胞自噬的定义和分子生物学机制 454
第二节细胞自噬在肝脏能量代谢中的作用 455
第三节细胞自噬与肝脏缺血-再灌注损伤 455
第四节细胞自噬与病毒性肝炎 458
第五节细胞自噬与急性肝损伤 459
第六节细胞自噬与α1-抗胰蛋白酶缺乏 460
第七节酒精性肝病中的细胞自噬 461
第八节细胞自噬与非酒精性脂肪性肝病 461
第九节细胞自噬与原发性肝癌 462
第十节小结 465
第三十一章细胞自噬与细菌感染 470
第一节细菌感染引起细胞自噬的机制 470
第二节革兰阴性细菌感染与细胞自噬 474
第三节革兰阳性细菌感染与细胞自噬 480
第四节自噬在抗细菌感染治疗中的意义 483
第三十二章细胞自噬与病毒感染 487
第一节细胞自噬与HIV/AIDS 487
第二节自噬与肝脏疾病 501
第三节细胞自噬与其他病毒感染 506
第三十三章细胞自噬与结核病 525
第一节细胞自噬与MTB感染 525
第二节MTB感染与Th1/Th2极化 527
第三节MTB感染与模式识别受体信号 530
第四节细胞自噬与MTB特异性抗原 534
第三十四章细胞自噬与创伤 541
第一节创伤致细胞损伤的机制 541
第二节细胞自噬与创伤 545
第三十五章烧伤与自噬 553
第一节烧伤与感染 553
第二节烧伤感染细菌菌谱分析 554
第三节烧伤后侵入宿主细胞内的病原体与自噬的相互作用 555
第四节烧伤感染后自噬与病毒的相互作用 560
第五节自噬在细菌感染与获得性免疫应答中的作用 561
第三十六章细胞自噬与妇产科 563
第一节细胞自噬与产科 563
第二节细胞自噬与妇科疾病 565
第三十七章细胞自噬与肿瘤 573
第一节细胞自噬与肺癌 573
第二节细胞自噬与食管癌 576
第三节细胞自噬与胃癌 577
第四节细胞自噬与结肠癌 580
第三十八章细胞自噬与辐射病 587
第一节辐射病及其发病机制 587
第二节细胞自噬与电离辐射 591
第三节细胞自噬与辐射病 594
第五篇 细胞自噬的研究技术和策略 603
第三十九章细胞自噬的检测技术 603
第一节检测自噬泡与自噬小体形成的静态技术 604
第二节检测自噬泡与自噬小体形成的动态技术 609
第四十章细胞自噬的流式细胞学检测技术 615
第一节流式细胞仪简介 615
第二节流式细胞术检测细胞自噬的原理 617
第三节流式细胞术鉴别细胞自噬、凋亡和坏死 619
第四节用流式细胞仪检测细胞自噬的方法 620
第四十一章RNA干扰技术与细胞自噬研究 626
第一节RNA干扰技术的进展 626
第二节细胞自噬的分子机制、自噬调控基因及生物学效应 632
第三节细胞自噬的生物学效应 634
第四节RNA干扰技术在研究细胞自噬中的应用价值及应用实例 634
第四十二章基因芯片技术与细胞自噬研究 638
第一节基因芯片的一般特征 638
第二节基因芯片技术 640
第三节基因芯片的应用 644
第四节基因芯片技术在细胞自噬相关研究中的应用 649
第四十三章微小RNA与细胞自噬研究 651
第一节微小RNA的特征与功能 651
第二节微小RNA与细胞自噬 658
第四十四章表观遗传学技术与细胞自噬研究 665
第一节表观遗传学研究内容与技术 665
第二节表观遗传学与细胞自噬 668
第四十五章全基因组关联与细胞自噬研究 677
第一节全基因组关联概览 677
第二节全基因组关联在细胞自噬研究中的应用（以克罗恩病的发病机制研究为例） 685
第四十六章基因组学技术与细胞自噬研究 692
第一节基因组学概述 692
第二节基因组学技术 693
第三节基因组学技术在细胞自噬研究中的应用 694
第四节基因组学技术在细胞自噬中的研究前景 706
第四十七章蛋白质组学技术及其在自噬中的应用 709
第一节蛋白质组学研究技术 709
第二节自噬的蛋白质组学研究 714
第四十八章生物信息学技术与细胞自噬研究 719
第一节生物信息学数据库 720
第二节序列比对 722
第三节新基因的结构和功能预测 724
第四节蛋白质结构与功能的预测 725
第五节生物信息学技术与细胞自噬 727
索引 732