目录 1
第一章 绪论 1
第一节 分子生态学的概念 1
一、分子生态学的产生 1
二、分子生态学的概念 2
第二节 分子生态学的研究内容和研究方法 4
一、分子生态学的研究内容 4
二、分子生态学的研究方法 5
三、分子生态学的意义与应用 6
第三节 当前分子生态学的研究热点和展望 9
一、当前分子生态学的研究热点 9
二、分子生态学的展望 11
参考文献 14
第二章 植物分子生态学研究方法 15
第一节 分子标记及其发展概况 15
一、蛋白质标记 17
第二节 分子生态学研究中的常用工具 17
二、Southern杂交 19
三、DNA分子标记 19
四、线粒体DNA 25
五、DNA序列分析 26
参考文献 27
第三章 植物分子行为生态 29
第一节 花粉散布和种子传播 29
一、花粉散布 30
二、种子传播 35
第二节 克隆结构 36
一、美国橡树Quercus geminatar的克隆结构 37
二、日本矮竹Sasa senanensis的克隆结果 38
第三节 斑块的形成及其遗传多样性 40
一、斑块的建立和发展 40
二、斑块间和斑块内的遗传多样性 43
第四节 植物繁殖方式的分子鉴定 45
第五节 杂交的分子鉴定 46
一、杂交的分子鉴定 48
二、外来种与本地种间杂交的分子鉴定 54
三、杂交种鉴定 57
参考文献 58
第四章 种群分子生态 63
第一节 种群的基本概念 63
第二节 种群分子生态发展和几个基本概念 64
一、有关种群分子生态发展的主要事件 64
二、种群分子生态的几个基本概念 66
第三节 天然种群的遗传变异 67
一、天然种群 67
二、突变的特性 68
三、突变率 68
四、突变的类型 69
第四节 种群遗传变异、分化和遗传距离的统计学 70
一、种群分子生态研究中分子标记的选择 70
六、自然选择 70
五、种群中突变的检测 70
二、采样策略 71
三、种群内遗传多样性的统计学 71
四、遗传距离 75
五、基因流的估算 76
六、指定检验 77
七、显性分子标记的种群遗传多样性和遗传分化的参数估算 77
二、Iris hexagona盐沼岛天然种群的盐胁迫试验 79
一、Iris hexagona天然隔离种群 79
第五节 地理隔离和环境胁迫下植物种群的遗传分化 79
三、隔离种群遗传分化的遗传解析 82
四、种群指定检验 96
第六节 原生演替中种群发生的分子解析 97
第七节 种群扩张中遗传多样性生态决定子的分子分析 102
参考文献 105
第五章 分子标记在保护遗传学上的应用 109
第一节 进化显著单元 109
一、进化显著单元的定义 109
二、特征明显种群的诊断 111
三、种群的管理和恢复 113
四、进化显著单元的应用 114
五、进化显著单元研究展望 115
第二节 可操作单元 116
一、空间自相关分析的理论和方法 117
二、空间相关图和可操作单元的定义 118
三、应用实例 120
四、结论 122
第三节 物种保护类别及其分子鉴定 123
一、物种保护类别 123
二、物种保护类别的分子鉴定 126
第四节 三种遗传变异及其在濒灭种保护中的应用 128
一、中性变异（neutral variation） 128
二、有害变异（detrimental variation） 129
三、适应性变异 129
四、中性变异可作为有害和适应性变异的指示器 130
一、有效种群大小 131
第五节 有效种群大小和种群大小衰退的分子鉴定 131
二、种群大小衰退的分子鉴定 133
第六节 基于遗传资料的遗传多样性和种群保护 135
一、遗传多样性保护 135
二、种群保护 138
第七节 基于遗传多样性的保护策略 139
一、遗传多样性 139
二、遗传差异 141
参考文献 142
第六章 分子进化和系统地理学 146
第一节 分子进化 146
一、什么叫分子进化 146
二、分子进化的特点 147
三、分子进化的动力 149
第二节 中性学说及其在分子生态学中的应用 152
一、中性学说的主要论点 154
二、中性学说的意义及其应用 156
三、分子钟在分子生态学中的应用 158
二、分子钟建立的程序 158
第三节 分子钟 158
一、分子钟的定义 158
四、分子钟的发展现状和展望 159
第四节 平衡遗传多态进化 160
一、平衡选择 161
二、等位基因数目的进化 162
三、等位基因年龄的进化 163
四、平衡谱系偏离理论期望 166
第五节 物种迁移和侵殖 169
一、冰期诱导的Armeria高海拔迁移 170
二、岛屿分布种Olea europaea的侵殖 171
三、冰河期后欧洲物种的侵殖 172
四、冰河期后榛子Corylus avellana的再侵殖 174
第六节 基于遗传变异的系统地理学研究 176
一、基于遗传变异的东亚红树林植物Kandelia candel系统地理学 177
二、苏铁Cycas taitunensis的系统地理学 178
参考文献 181
第七章 植物适应性的分子机制 185
第一节 植物对光环境适应性 185
第二节 植物对盐胁迫反应 199
一、植物耐盐的生理学机制 201
二、植物耐盐蛋白 203
三、植物耐盐基因 206
四、耐盐转基因研究 208
第三节 植物耐重金属的分子解析 212
第四节 胁迫条件下植物信号传递的分子基础 222
参考文献 224
第八章 分子生态学数据分析工具 230
第一节 个体间的亲缘关系：出身和相关性 230
第二节 种群间的亲缘关系：种群遗传结构和基因流动 232
第三节 种间关系：进化树的重建 236
参考文献 237
英汉名词对照 240