实验1 生物大分子的固相合成与质谱分析 1
1.1 背景知识 1
1.1.1 生物大分子及其获取方法 1
1.1.2 多肽固相合成流程 3
1.1.3 生物大分子的质谱分析 4
1.2 实验设计 7
1.3 实验操作 11
1.3.1 仪器试剂 11
1.3.2 实验步骤 14
1.4 分析讨论 18
1.4.1 氨基酸偶联时间对产率的影响 18
1.4.2 切割时间的影响 19
1.4.3 多肽粗产品的分离 19
1.4.4 其他方法 20
1.5 总结与思考题 21
参考文献 22
实验2 蛋白质连接反应与蛋白质半合成 24
2.1 知识背景 24
2.1.1 蛋白质生物表达的基本原理 24
2.1.2 蛋白质半合成基本原理 26
2.1.3 Intein基本原理 29
2.2 实验设计 32
2.3 实验操作 34
2.3.1 仪器试剂 34
2.3.2 实验步骤 37
2.4 分析讨论 43
2.4.1 Intein融合蛋白的表达效率 43
2.4.2 脱盐效率对Ub-AMC活性的影响 43
2.5 总结与思考题 43
参考文献 44
实验3 非天然氨基酸的定点嵌入与标记 47
3.1 背景知识 47
3.1.1 合成生物学 47
3.1.2 天然蛋白质中引入非天然氨基酸的基本原理 48
3.1.3 含有非天然氨基酸蛋白质的应用 50
3.2 实验设计 52
3.3 实验操作 56
3.3.1 仪器试剂 56
3.3.2 实验步骤 61
3.4 分析讨论 66
3.4.1 引入非天然氨基酸蛋白质的表达效率 66
3.4.2 脱盐对点击化学反应的影响 66
3.5 总结与思考题 67
参考文献 68
实验4 DNA模板控制的点击化学反应 71
4.1 背景知识 71
4.1.1 DNA 71
4.1.2 核酸编码文库 71
4.1.3 核酸模板控制的化学反应 76
4.2 实验设计 80
4.3 实验操作 84
4.3.1 仪器试剂 84
4.3.2 实验步骤 89
4.4 分析讨论 94
4.5 总结与思考题 95
参考文献 96
实验5 蛋白质聚集及小分子对其抑制作用 98
5.1 背景知识 98
5.1.1 蛋白质的结构生物学 98
5.1.2 蛋白质结构与重要人类疾病的关系 101
5.1.3 Tau蛋白介导阿尔兹海默症的机理及相关药物 102
5.2 实验设计 103
5.3 实验操作 106
5.3.1 仪器试剂 106
5.3.2 实验步骤 108
5.4 分析讨论 111
5.5 总结与思考题 112
参考文献 113
实验6 小分子探针在药物靶点鉴定中的应用 117
6.1 背景知识 117
6.1.1 基于活性的蛋白质谱学方法 117
6.1.2 小分子调控蛋白活性 119
6.2 实验设计 126
6.3 实验操作 128
6.3.1 仪器试剂 128
6.3.2 实验步骤 131
6.4 分析讨论 134
6.4.1 实验设计及教学安排 134
6.4.2 荧光基团性质对实验结果的影响 134
6.5 总结与思考题 135
参考文献 136