第1章 综述 1
1.1褐马鸡研究概述 1
1.1.1形态特征 1
1.1.2食物与食性 2
1.1.3繁殖特性 2
1.1.4栖息地特征 3
1.1.5分布与数量 4
1.1.6研究概况 6
1.2遗传多样性研究概述 6
1.2.1概念、研究内容及研究意义 6
1.2.2检测方法 7
1.3保护遗传学研究 12
1.4本书研究的主要内容 14
第2章 褐马鸡非损伤性取样、微量取样DNA的提取及检测 15
2.1引言 15
2.2材料和方法 16
2.2.1材料 16
2.2.2方法 18
2.3研究结果 23
2.3.1肌肉与血液样品基因组DNA浓度和总量测定结果 23
2.3.2不同样本提取的基因组DNA琼脂糖凝胶电泳检测结果 23
2.4分析与讨论 25
2.4.1微量血液DNA提取方法分析 25
2.4.2陈旧剥制标本及新鲜皮张DNA的提取 26
2.4.3提取羽毛样品中DNA的三种方法比较 27
2.4.4粪便DNA的提取分析 27
2.4.5在保护遗传学中的应用 28
2.5小结 29
第3章 褐马鸡种群的线粒体DNA控制区多态性分析 30
3.1引言 30
3.2材料与方法 32
3.2.1材料 32
3.2.2方法 32
3.3研究结果 35
3.3.1 DNA提取的电泳检测结果 35
3.3.2 PCR扩增电泳监测结果 36
3.3.3重组质粒检测（酶切、PCR鉴定） 36
3.3.4褐马鸡线粒体DNA控制区遗传多态性 38
3.3.5种群遗传距离（Da） 43
3.3.6系统发育树的构建 44
3.4分析与讨论 48
3.4.1线粒体控制区的特性 48
3.4.2线粒体DNA的母性遗传分析 49
3.4.3遗传多样性现状分析 50
3.4.4两个种群的遗传差异分析 51
3.5小结 52
第4章 褐马鸡ISSR标记的遗传多样性 53
4.1引言 53
4.2材料与方法 54
4.2.1材料 54
4.2.2方法 54
4.3研究结果 56
4.3.1 PCR-ISSR分析 56
4.3.2多态带百分率 60
4.3.3物种水平上的遗传多样性 60
4.3.4各种群的遗传多样性特点 61
4.3.5各种群个体之间的遗传距离和聚类分析 61
4.4分析与讨论 72
4.4.1 ISSR实验的稳定性 72
4.4.2 ISSR遗传多样性分析 72
4.4.3两个种群的遗传差异分析 73
4.4.4聚类分析 74
4.4.5 ISSR分子标记与线粒体基因标记的比较 74
4.5小结 75
第5章 褐马鸡性别鉴定的分子生物学方法 77
5.1引言 77
5.2材料和方法 79
5.2.1材料 79
5.2.2方法 79
5.3研究结果 80
5.3.1性别相关基因的扩增以及两对引物的有效性分析 80
5.3.2性别相关基因的排序及序列比对 82
5.3.3在已知性别和未知性别个体中的扩增结果 83
5.4分析与讨论 84
5.4.1引物P2/P8与2550F/2718R扩增结果的分析 84
5.4.2已知与未知性别鉴定结果分析 85
5.4.3鸟类性比研究 86
5.5小结 87
第6章 褐马鸡羽毛、卵壳及组织器官中10种矿物元素含量的测定 88
6.1引言 88
6.2实验部分 89
6.2.1主要仪器、材料和试剂 89
6.2.2样品处理 90
6.2.3实验方法 90
6.3研究结果 90
6.3.1羽毛和卵壳中元素含量 90
6.3.2各组织器官中10种矿物元素的测定结果 92
6.3.4各元素的含量差异显著性检验 100
6.3.5各元素的相关关系 100
6.3.6羽毛、卵壳与各组织器官间矿物元素含量的显著性检验 101
6.4回收率实验 104
6.5分析与讨论 104
6.5.1矿物元素在动物机体内的生物学作用 104
6.5.2与文献及其他鸟类中羽毛及卵壳含量的比较分析 105
6.5.3同一组织器官中不同元素的分布及相关关系分析 106
6.5.4通过测定分析羽毛、卵壳中矿物元素的含量可反映出机体内元素的含量及环境状况 107
6.6小结 108
第7章 褐马鸡濒危机制及保护对策 110
7.1褐马鸡的致危因素分析 110
7.1.1褐马鸡濒危的内因 110
7.1.2褐马鸡濒危的外因 113
7.2褐马鸡的生态学和遗传多样性保护建议 116
7.2.1加强自然保护区的建设，提高自然保护区的统筹管理水平 116
7.2.2加强褐马鸡人工饲养和繁育，努力扩大褐马鸡的人工种群 116
7.2.3加强褐马鸡的野外驯化和放归实验，不断扩大褐马鸡的分布区域 117
7.2.4加强褐马鸡遗传多样性基础研究，为褐马鸡的保护提供科学依据 118
第8章 结论 120
主要参考文献 123