第一部分——专著节选 1
关于林木遗传育种学 1
遗传资源的保存与利用 5
杂交的遗传效应及利用 21
无性繁殖的遗传效应及其应用 35
第二部分——报告与讲话 53
树人树木60年——纪念郑万钧教授诞辰80周年 53
植树造林——一项重大的生态环境建设工程 57
论无性系林业——概念和应用 59
森林与生物多样性——遗传多样性的保护和利用 63
世纪之交对林业发展的几点思考 67
可持续发展与林业………………——为庆贺《林业科技开发》杂志创刊十周年而作 71
可持续发展中的森林和林业 74
中国森林可持续发展——我们唯一的选择 77
科技进步是林业发展的主要推动力 80
林木改良与森林可持续发展 84
森林的现代经营管理途径——森林生态系统可持续经营 88
用科学发展观指导治山、育林、兴产业 91
南方型杨树工业用材林的资源培育 93
杨树产业化经营中的几个技术问题 97
江苏杨树人工林资源及木材加工业的崛起 99
江苏杨树资源培育与产业化 103
谈苏北杨树的发展 108
江苏杨树产业的战略思考（Ⅰ）：现状与问题分析 111
江苏杨树产业的战略思考（Ⅱ）：战略措施与调控政策 116
杨树的品种创新和良种繁育 121
南林95、895杨的复合经营技术 123
第三部分——杨树遗传改良 129
我国杨树良种选育的进展 129
关于林木良种选育及种子园问题（摘要） 134
黑杨派3个新无性系的性状分析 137
黑杨派5个现代无性系的比较研究 141
用同工酶分析法鉴定黑杨派无性系 147
黑杨派无性系的抗寒性研究 151
杨树过氧化物酶同工酶的遗传分析 155
杨树杂种膜脂脂肪酸组分与抗寒性的关系 158
黑杨派新无性系研究Ⅰ：苗期测定 161
黑杨派新无性系研究Ⅱ：生长的适应性和遗传稳定性分析 167
黑杨派新无性系研究Ⅲ：生根性状的遗传变异 174
黑杨派新无性系研究Ⅳ：树冠结构与生长的关系 179
黑杨派新无性系研究Ⅴ：树冠结构与干形改良 187
黑杨派新无性系研究Ⅵ：苗期年生长的动态分析 195
黑杨派新无性系研究Ⅶ：生长早期选择 202
黑杨派新无性系木材性状的遗传改良 208
白杨派、青杨派和黑杨派的DNA多态性及系统进化研究 213
杨树经济遗传学的数学模型——多目标最优选择技术 217
林木群体遗传分化的多元分析 223
林木群体遗传多样性和多位点遗传结构 228
美洲黑杨×欧美杨F1无性系一级分枝特性与生长及干形关系的研究 234
美洲黑杨新无性系生长动态遗传分析及早期选择 239
单色软X射线木材密度计的研制 244
美洲黑杨×小叶杨新无性系木材性状遗传相关分析 248
美洲黑杨新无性系干形性状遗传变异初步研究 253
林木复杂性状分维数计算软件（FDC1.0）的研制与应用 258
杨树树冠分维数与生长的相关关系 262
3种冠型分维数求算法在杨树无性系中的应用 265
美洲黑杨新无性系生长遗传稳定性分析 269
杨树插穗根系的分形特征 274
美洲黑杨生长变异与无性系选择 278
我国栓皮栎树种的改良 283
用同工酶研究马尾松群体的遗传结构 288
马尾松人工群体交配系统研究 295
针叶树种扦插繁殖的研究进展及其对策 300
马尾松插穗内源抑制物质的研究 304
马尾松扦插繁殖年龄效应及继代扦插复壮效果 309
马尾松插穗生根能力变异的研究 312
植物抗寒机理研究进展 316
磷脂酰甘油分子种与杨树抗寒性关系的研究 323
银杏叶片磷脂酰甘油脂肪酸分子种组成及其位置分布 328
第四部分——杨树分子生物学 333
用RAPD探讨毛白杨起源 333
青杨的遗传分化 338
青杨的DNA多态性及遗传分化 343
分子标记在杨树遗传改良中的应用 346
美洲黑杨无性系AFLP指纹分析 351
林木RAPD分析及实验条件的优化 353
林木基因组中的微卫星（SSR）及其应用 358
利用RAPD标记构建响叶杨和银白杨分子标记连锁图谱 363
利用RAPD标记构建美洲黑杨×欧美杨分子标记连锁图谱 369
杨树体细胞融合研究 373
用ITS序列研究杨属各组之间的系统发育关系 378
植物原生质体培养和体细胞融合技术研究进展 381
杨属ITS序列的分子进化特点分析 387
一种新的分子标记——单核苷酸多态（SNP） 391
一种高效的树木总DNA提取方法 396
一种适合杨树叶片的蛋白质提取方法 400
杨树叶片蛋白质组分析 403
利用不同作图软件构建响叶杨×银白杨遗传图谱 407
杨树基因组计划及其分子生物学研究进展 416
植物抗病信号传导途径及其相互作用 421
大规模EST序列测定中的条件优化 427
杨树黑斑病感抗无性系cDNA文库的构建 431
与美洲黑杨抗黑斑病基因连锁的SCAR标记的开发 434
杨树锈病抗性遗传特性及基因克隆策略研究进展 438
杨四瘿螨诱导的美洲黑杨抑制消减文库的构建及分析 443
杨树抗杨四瘿螨相关基因的表达分析 447
病原侵染后杨树叶片中两个关键酶的表达分析 453
黑斑病菌侵染后杨树叶片细胞超微结构的变化 458
利用杨树原生质体瞬时表达系统筛选杨生褐盘二孢菌效应因子蛋白 461
利用RAPD标记和单株树大配子体构建马尾松的分子标记连锁图谱 467
广义青篱竹属核糖体DNA ITS序列及亲缘关系研究 472
观赏竹的试管快繁研究 479
大花蕙兰试管苗基部切块诱导类原球茎研究 484
黄花柳基因组微卫星分离及多态性位点检测 489
山核桃成花过程基因表达的cDNA-AFLP分析 494
林木基因工程研究进展 498
林木蛋白质组学研究进展 505
转基因植物中外源基因的沉默 511
植物抗盐碱、耐干旱基因工程研究进展 516
植物甜菜碱合成途径及基因工程研究进展 522
植物抗病基因克隆的研究进展 529
多年生植物模式物种基因组研究的历史及进展 535
植物遗传转化新技术和新方法 547
抗虫的转AaIT基因杨树的获得 552
美洲黑杨杂种优良无性系转抗虫基因（Bt和CpTI）的研究 556
新疆杨高效遗传转化系统的建立 561
新疆杨植株再生体系的建立 566
豇豆胰蛋白酶抑制剂（CpTI）抗虫转基因新疆杨的获得 570
杨树NL-80106转Bt基因植株的获得及抗虫性 575
转天麻抗真菌蛋白GAFP基因烟草的获得及离体抑菌活性检测 579
双价抗病基因植物表达载体构建及在烟草中表达的初步研究 583
NP1和GAFP双价抗病基因植物表达载体的构建 588
转Bt基因南林895杨抗虫性及对土壤微生物影响分析 591
转玉米PEPC基因杨树的光合生理特性分析 596
四甲基氯化铵在杨树RAPD扩增反应中的作用 605
The application ofmarker-assisted selectionto tree breeding 609
Preliminary interspecific genetic maps ofthe Populus genome constructed from RAPD markers 619
A logistic mixture model for characterizing genetic determinants causing differentiation ingrowthtrajectories 628
Molecular linkage maps ofthePopulus genome 640
Quantitative trait loci for growth trajectories in Populus 658
Identification and validation of single nucleotide polymorphisms in poplar using publicly expressed sequence tags 673
Expressionprofiles oftwonovellipoxygenase genesinPopulus deltoides 679
Function and chromosomal localization of differentially expressed genes inducedbyMarssonina brunnea f.sp.multigermtubi in Populus deltoides 690
IdentificationofdifferentiallyexpresseproteinsinpoplarleavesinducedbyMarssonina brunnea f.sp.multigermtubi 697
Isolation and characterization of two genes encoding polygalacturonase-inhibiting protein fromPopulus deltoides 710
Detection of quantitative trait loci influencing growth trajectories of adventitious roots in Populus using functional mapping 718
Identifying secretedproteins ofMarssonina brunneabydegenerate PCR 734
Analysis offloral transcription factors from Lycoris longituba 749
A genetic linkage map ofPopulus adenopoda Maxim.×P. alba L.hybrid based on SSR and SRAPmarkers 762
Naturalvariationinpetal colorinLycoris longitubarevealedbyanthocyanin components 774
Characterization ofmicrosatellites in the coding regions ofthe Populus genome 784
Aquantitativemodeloftranscriptionaldifferentiationdrivinghost-pathogeninteractions 791
Sequencing the genome ofMarssonina brunnea reveals fungus-poplar co-evolution 802
Untanglingthetranscriptomefromfungus-infectedplanttissues 814
A preliminary analysis ofphylogenetic relationships ofA rundinaria and related genera based on nucleotide sequences ofnrDNA（ITS region）and cpDNA（trnL-F intergenic spacer） 825
第五部分——治学杂记 831
古文中的《格物致知》 831
什么是科学？ 833
科学、技术、工程 835
“大科学”的兴起 837
系统观及系统科学的兴起及发展 838
系统生物学（Systems Biology）：生物学领域的一个新潮流 841
林学中的系统观 843
科学工作者与科学精神 845
新世纪寄语 847
“创新是一个民族的灵魂” 849
培养自己的创新能力 851
第六部分——附录 853
大事记 853
后记 854