第1章 绪论 1
1.1 生物信息学的发展史 2
1.2 生物信息学的主要研究内容 7
1.3 生物信息学的应用 15
习题 16
第2章 生物信息数据库 17
2.1 概述 17
2.2 基因组数据库 20
2.3 序列数据库 21
2.4 结构数据库 31
2.5 其他数据库 34
习题 43
第3章 数据库查询和检索 44
3.1 数据库查询 44
3.2 数据库检索 54
习题 82
第4章 序列分析 83
4.1 核酸序列分析 83
4.2 蛋白质序列分析 101
习题 124
第5章 分子系统发生分析 125
5.1 分子系统发生与系统发生树 125
5.2 分子进化模型与序列分歧度计算 134
5.3 分子系统树的构建 139
5.4 系统发生树的可靠性 154
5.5 分子系统发育分析软件及应用 156
习题 167
第6章 生物信息学与生物芯片 168
6.1 概述 168
6.2 基因芯片的基本原理 172
6.3 生物芯片数据分析 180
6.4 新型生物芯片技术 190
6.5 生物芯片的应用 196
习题 202
第7章 生物信息学与药物研究 203
7.1 概述 203
7.2 用于药靶发现的生物信息学方法 206
7.3 生物信息学在药物筛选中的应用 213
7.4 计算机辅助药物设计 216
习题 227
参考文献 228