基本原理 1
1病原菌是怎样形成的？ 3
1.1引言 3
1.2灵活基因库的组成 4
1.3基因组动力学机制 5
1.4以大肠杆菌为模型展示细菌的基因组优化 5
1.5感染过程中基因组的可塑性 7
1.6结论 7
2中性粒细胞的抗菌机制 13
2.1引言 13
2.2募集到感染部位 14
2.3吞噬作用 16
2.4分泌囊泡的胞吐作用和去颗粒作用 17
2.5中性粒细胞胞外陷阱 19
2.6中性粒细胞功能缺陷 19
2.7结论 21
3幽门螺杆菌感染——炎症到癌症的路径 23
3.1 引言 23
3.2幽门螺杆菌诱导胃癌发生的途径 23
模型 33
4 A群链球菌和金黄色葡萄球菌引起的皮肤及软组织感染中宿主-病原体的关系 35
4.1 引言 35
4.2阳离子抗菌肽对A群链球菌和金黄色葡萄球菌皮肤感染的抗菌机制和细菌的抗药机制 36
4.3白细胞和皮肤A群链球菌和金黄色葡萄球菌感染 37
4.4结论 45
5败血性胞外病原菌侵染脑膜的机制：以脑膜炎球菌、无乳链球菌和大肠杆菌为例 54
5.1引言 54
5.2细菌通过中枢神经系统的脉管系统迁移 55
5.3新生儿脑膜炎 60
5.4脑膜炎 64
6社区获得性肺炎的两个重要病原菌：肺炎链球菌和军团菌 79
6.1 背景 79
6.2肺炎链球菌：一个毁灭性的病原体，同时也是一个常见的上呼吸道定植菌 81
6.3嗜肺军团菌——环境存在菌，同时也造成严重散发性和流行性肺炎 89
6.4结论 96
7沙门菌-鼠交互作用：一个研究细菌感染的通用模型 104
7.1引言 104
7.2致病基因的鉴定 106
7.3在体内分析基因功能 108
7.4深入分析在宿主组织内细胞间的相互作用 113
7.5展望 115
8衣原体：从分子水平洞察治疗的新发现 123
8.1 引言 123
8.2衣原体：一种研究胞内宿主-病原体间相互关系的模型 124
8.3一种调查感染期间宿主细胞因子作用的整体方法 129
8.4我们期望从整体化的RNA干扰（RNAi）方法得到什么信息？ 133
8.5展望 134
细菌毒力的整体研究方法 145
9肠道菌群及其对内稳态的贡献 147
9.1引言 147
9.2胃肠道菌群的特征 147
9.3肠道菌群和宿主的共生关系 152
9.4结论 156
10肠道屏障的解剖学和肠道内稳态建立 161
10.1引言 161
10.2肠道屏障的解剖学、生理学和免疫学特性 161
10.3通过对菌群感知、发信号和响应建立共生关系和肠道内稳态 173
10.4结论 179
11通过动态影像技术在细胞、组织和器官水平探索感染过程 187
11.1宿主-病原体相互作用的成像简介 187
11.2感染的影像学 189
11.3临床意义 197
11.4未来的技术发展 198
12细菌感染的物种特异性问题，如何通过试验来研究？ 206
12.1引言 206
12.2分子方面的物种特异性 207
12.3用离体的人体组织使细菌侵染模型化 207
12.4体内建模和相关的动物模型的探索 208
12.5在体内建模关注的焦点是病原体，而不是宿主 209
12.6体内建模：使用异体移植制造“人化”动物模型 210
12.7人传染病免种属特异性和“人化”动物模型的遗传操作 211
12.8李斯特菌作为肠道和母-胎感染模型 212
12.9化脓性链球菌感染：从定植宿主上皮屏障到全身性感染 218
12.10脑膜炎奈瑟菌和脑脊髓膜炎 221
12.11结语 223
缩略语对照表 230