第一章 化学信息学网络资源 1
第一节 化学信息学数据库 1
第二节 电子图书阅读工具——Adobe Acrobat 9
第三节 蛋白质结构数据库 16
第四节 文献数据库——Web of Science 20
参考文献 29
第二章 分子结构绘制及显示 30
第一节 小分子结构绘制及创建——ChemDraw 30
第二节 小分子结构显示——Chem3D 36
第三节 生物大分子结构显示——VMD 44
第四节 生物大分子结构显示——Spdbv 53
参考文献 65
第三章 Linux基础 66
第一节 Linux简介 66
第二节 文件操作命令 68
第三节 目录操作及联机帮助命令 71
第四节 进程及其管理 74
第五节 文本编辑 78
参考文献 80
第四章 分子模拟 81
第一节 分子对接——AutoDock 81
第二节 分子动力学模拟——AMBER 92
第三节 量子化学计算——Gaussian 103
参考文献 114
第五章 数据传输 115
第一节 常规下载——FlashGet 115
第二节 数据上传——CuteFTP 122
第三节 远程连接——Xmanager 126
参考文献 133
第六章 数据分析与绘图 134
第一节 数据分析——Excel 134
第二节 数据绘图——Origin 146
第三节 统计软件——SPSS 161
参考文献 171
第七章 图像处理 172
第一节 简单绘图——画图附件 172
第二节 图像编辑——Photoshop 179
第三节 图像绘制——CorelDraw 191
参考文献 203
第八章 计算机应用基础 204
第一节 文本编辑——Word 204
第二节 文本列操作——UltraEdit 214
第三节 流程图绘制——Visio 219
第四节 演示文稿制作——PowerPoint 228
参考文献 236
第九章 Perl语言初步 237
第一节 Perl安装及启动 237
第二节 Perl的基本语法 238
第三节 Perl的使用实例 248
参考文献 259
第十章 HIV-1整合酶与L708,906抑制剂结合模式及运动性的研究 260
第一节 计算方法 261
第二节 结果与讨论 262
第三节 与《计算机化学实践基础教程》的关联 268
参考文献 269