1进化生物学的由来及现状 2
1.1进化、生物进化与进化生物学 2
1.1.1广义进化 2
1.1.2生物进化 2
1.1.3生物进化论与进化生物学 3
1.2从进化论到进化生物学 3
1.2.1进化思想的产生 3
1.2.2进化论的形成 4
1.2.3进化论的发展 12
1.2.4进化论在我国的传播 15
1.2.5进化生物学的诞生 16
1.3进化生物学的研究现状和发展的新方向 16
1.3.1古生物学和分子古生物学研究的新成果 16
1.3.2基因组学与比较基因组学的新成就 17
1.3.3分子进化工程 18
1.3.4从进化生物学入手揭示发育的机制是研究的热点之一 18
1.4学习和研究进化生物学的意义和方法 18
1.4.1学习和研究进化生物学的意义 18
1.4.2学习和研究进化生物学的基本方法 19
提要 20
习题 21
思考题 22
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参考文献 22
2生命及其在地球上的起源 23
2.1生命的本质 23
2.1.1生命的物质基础 23
2.1.2生命活动的基本特征 26
2.1.3生命和熵 29
2.2生命在地球上的起源 30
2.2.1人类对生命起源的几种认识 30
2.2.2生命起源的条件 32
2.2.3生命起源的过程——生命起源的化学演化学说 36
2.3遗传密码的起源与进化 47
2.3.1最早的遗传密码子 47
2.3.2密码进化的方向 47
2.3.3密码的进化过程 48
2.4有关生命起源问题的探讨 50
2.4.1陨击作用与生命起源 50
2.4.2其他天体上是否有生命 51
提要 53
习题 53
思考题 53
深入阅读推荐 54
参考文献 54
3细胞的起源与进化 55
3.1原始细胞的起源 55
3.1.1超循环组织模式 55
3.1.2阶梯式过渡模式 56
3.2细胞的进化 58
3.2.1原核细胞的出现 58
3.2.2古细菌的发现和早期生物三分支进化观点的形成 59
3.2.3真核细胞的祖先可能是古细菌 60
3.2.4真核细胞的起源途径 61
3.3真核细胞起源的意义 65
3.3.1为生物性分化和有性生殖打下基础 65
3.3.2推动生物向多细胞化方向发展 66
3.3.3促成了三极生态系统的建立 66
3.4关于病毒起源问题的讨论 66
3.4.1病毒起源的退化学说 66
3.4.2病毒起源于胞内核酸成分的学说 66
3.4.3裸基因说 67
3.5生物进化的又一重大事件——多细胞化 67
3.5.1生物多细胞化的最新化石证据 67
3.5.2多细胞生物起源的模式 68
提要 68
习题 69
思考题 69
深入阅读推荐 69
参考文献 69
4生物发展史 72
4.1化石和地质年代的划分 72
4.1.1化石 72
4.1.2地质年代 75
4.2生物界系统发展概况 79
4.2.1生物界的系统发展 79
4.2.2生物界系统发展的规律 89
4.3几种生物的进化史 90
4.3.1象的进化史 90
4.3.2马的进化史 91
4.4生物界进化发展的因素和动力 92
4.4.1生物界进化发展的因素 92
4.4.2生物界进化发展的动力 97
4.5生物的分界 100
4.5.1两界说 100
4.5.2三界说 100
4.5.3四界说 100
4.5.4五界说 101
提要 103
习题 103
思考题 103
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参考文献 104
5生物表型的进化 105
5.1形态结构的进化 105
5.1.1新构造的起源及其在进化中的意义 105
5.1.2形态结构进化的两个方向：复杂化和简化 105
5.1.3形态结构进化的总趋势：复杂性的提高和多样性的增长 106
5.2生理功能的进化 107
5.2.1新功能的起源及其在进化中的意义 107
5.2.2新功能起源的基本方式 107
5.2.3功能进化的实例 107
5.2.4结构和功能进化的统一性 109
5.3行为的进化 109
5.3.1行为进化的基本环节 110
5.3.2通讯行为的进化 113
5.3.3争斗行为的进化 115
5.3.4利他行为的进化 118
5.3.5性行为的进化 122
5.3.6行为与基因 123
5.3.7行为进化的研究方法 125
提要 126
习题 127
思考题 127
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参考文献 127
6生物的微观进化 128
6.1微观进化的概念 128
6.2生物微观进化的单位 128
6.3种群的遗传结构 129
6.3.1种群遗传基础的杂合性 129
6.3.2基因频率和基因型频率 129
6.3.3群体遗传平衡——Hardy-Weinberg定律 130
6.4种群变异 135
6.4.1形态水平变异 135
6.4.2细胞水平变异 136
6.4.3生化水平变异 136
6.4.4 DNA水平变异 137
6.4.5遗传变异的度量 138
6.5种群基因库变异的因素 139
6.5.1突变对基因频率的影响 139
6.5.2在选择作用下基因频率的变化 140
6.5.3迁移（基因流动）对基因频率的影响 144
6.5.4遗传漂变对基因频率的影响 145
6.6自然选择 147
6.6.1自然选择的概念 147
6.6.2自然选择的类型 148
6.6.3自然选择的意义 151
6.7适应 153
6.7.1适应的概念 153
6.7.2适应形成的条件及过程 153
6.7.3自然选择下的适应进化 155
6.7.4适应的普遍性 157
6.7.5适应的相对性 158
6.7.6适应在进化中的作用 160
6.8微观进化在生物进化中的意义 161
提要 161
习题 162
思考题 163
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参考文献 163
7物种与物种的形成 164
7.1物种 164
7.1.1物种的概念 164
7.1.2物种的标准 167
7.1.3物种的结构 168
7.2物种的形成 170
7.2.1物种形成的三个主要环节 170
7.2.2隔离的机制 171
7.2.3物种形成的方式 174
7.3人工控制下的物种形成 180
7.3.1远缘杂交 180
7.3.2体细胞杂交 181
7.3.3染色体工程——再造小麦 181
7.4物种形成在生物进化中的意义 182
7.4.1物种形成使生物界具备了多样性 182
7.4.2物种间的生殖隔离保证了生物类型的稳定性 182
7.4.3物种是生物进化的基本单位 182
7.4.4物种是生态系统中的功能单位 183
7.5神奇物种的新发现和濒危物种的保护 183
7.5.1神奇物种的新发现 183
7.5.2濒危物种的保护 184
提要 185
习题 186
思考题 187
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参考文献 187
8生物的宏观进化 188
8.1宏观进化的概念 188
8.1.1复化式进化 188
8.1.2特化式进化 189
8.1.3简化式进化 192
8.2宏观进化的型式 192
8.2.1物种进化的描述 192
8.2.2渐变型式 193
8.2.3间断平衡型式 193
8.2.4渐变与间断并存 196
8.3进化趋势 196
8.3.1进化趋势的概念 196
8.3.2表型趋异与谱系趋异 197
8.3.3从系统树看进化趋势 198
8.3.4产生进化趋势的原因 198
8.4生物进化的速率 198
8.4.1镶嵌进化 199
8.4.2进化速率的不平衡性 199
8.4.3影响生物进化速率的因素 200
8.5灭绝 201
8.5.1灭绝的概念 201
8.5.2常规灭绝 201
8.5.3集群灭绝 202
8.5.4灭绝动物的复活 203
8.5.5人类世与第六次物种大灭绝 203
8.5.6灭绝的生物学意义 204
8.6关于宏观进化与微观进化问题的讨论 204
8.6.1微观进化能否解释宏观进化 204
8.6.2是否存在宏观进化的特殊机制——大突变 205
8.6.3个体发育能否反映系统发展（重演律是否正确） 206
提要 206
习题 207
思考题 207
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参考文献 207
9生物遗传系统的进化 209
9.1染色体的进化 209
9.1.1染色体数目的进化 209
9.1.2染色体结构的进化 210
9.1.3染色体功能的进化 211
9.2基因与基因组的进化 211
9.2.1基因的进化 211
9.2.2基因组的进化 216
9.2.3进化基因组学 226
9.2.4宏基因组学 227
9.3蛋白质和蛋白质组的进化 228
9.3.1蛋白质的进化 228
9.3.2蛋白质组的进化 232
9.4表观遗传与进化 233
9.4.1表观遗传 233
9.4.2表观遗传与进化 234
提要 234
习题 235
思考题 235
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参考文献 235
10分子进化和分子系统学 237
10.1分子进化的概念 237
10.2分子进化的特点 237
10.2.1分子进化速率的恒定性 237
10.2.2分子进化的保守性 240
10.3分子进化的中性突变理论 242
10.3.1随机漂变对等位基因的作用 242
10.3.2替换率与突变率的关系 243
10.3.3影响突变类型的因素 244
10.3.4有关中性突变进化学说的讨论 244
10.4分子系统学和分子系统树 246
10.4.1分子系统树的构建方法 246
10.4.2分子系统学的研究进展 247
10.5古分子系统学 249
10.5.1古蛋白质分子的研究 249
10.5.2古DNA的研究 249
10.5.3研究进展 249
10.6分子钟 250
10.6.1分子钟的概念 250
10.6.2分子钟建立程序 250
提要 251
习题 252
思考题 252
深入阅读推荐 252
参考文献 252
11人类起源与进化 253
11.1人类的起源 253
11.1.1对人类起源认识的发展过程 253
11.1.2人类在自然界中的位置和人类的双重属性 254
11.1.3人类起源于动物界的证据 256
11.1.4从猿到人体质形态和行为特征的主要变化 258
11.1.5关于人类起源问题的一些争论 262
11.1.6人类起源发展的几个阶段 264
11.2现代人的进化 272
11.2.1现代人的产生与分化 273
11.2.2人类未来的进化 277
提要 284
习题 285
思考题 285
深入阅读推荐 285
参考文献 285
12生态系统的进化 287
12.1生物圈 287
12.2生态系统的组成 288
12.2.1生态系统的成分 288
12.2.2生态系统的组织化水平 289
12.3生态系统中的物种进化 291
12.3.1物种在生态系统中的地位和作用 291
12.3.2竞争、协同进化与共存 292
12.4生态系统在时间尺度上的变化 294
12.4.1生态系统在短时间尺度上的变化——小周期 294
12.4.2生态系统在中等时间尺度上的变化——生态演替 294
12.4.3生态系统在长时间尺度上的变化——生态系统的进化 296
12.5生态系统的进化与人类 299
12.5.1生态系统的进化趋势 299
12.5.2生态安全及气候异常对人类的影响 299
12.5.3人类对生态系统的影响 301
提要 305
习题 306
思考题 306
深入阅读推荐 306
参考文献 306
汉英名词索引 307