基于蛋白质相互作用网络的算法研究及其应用PDF电子书下载

第1章 绪论 1

1.1 蛋白质网络的计算分析 1

1.1.1 蛋白质网络及其研究所面临的挑战 1

1.1.2 蛋白质网络研究的具体内容 4

1.2 蛋白质网络在疾病研究中的应用 11

1.2.1 过滤方法 13

1.2.2 文本和数据挖掘方法 13

1.2.3 基于网络的方法 15

1.3 本书的主要研究内容和框架 19

1.3.1 分离静态蛋白质网络为不同时刻的动态网络 20

1.3.2 关键蛋白质侦测算法 20

1.3.3 蛋白质复合物挖掘算法 21

1.3.4 疾病基因识别算法 22

1.4 本书的结构 23

1.5 本章总结 24

第2章 动态蛋白质网络研究 25

2.1 研究背景 25

2.2 动态蛋白质网络构建方法 27

2.2.1 数据集 27

2.2.2 重构TC-PINs 28

2.2.3 从TC-PINs中识别蛋白质复合物 31

2.2.4 评价指标 32

2.3 结果和讨论 34

2.4 本章总结 46

第3章 关键蛋白质研究 48

3.1 研究背景 48

3.2 关键蛋白质侦测算法WDC 51

3.2.1 算法描述 51

3.2.2 结果和讨论 54

3.3 关键蛋白质侦测算法CNC 72

3.3.1 算法描述 72

3.3.2 结果和讨论 77

3.4 关键蛋白质侦测算法SCP 82

3.4.1 算法描述 82

3.4.2 结果和讨论 87

3.5 本章总结 95

第4章 蛋白质复合物研究 97

4.1 研究背景 97

4.2 蛋白质复合物挖掘算法CMBI 99

4.2.1 算法描述 99

4.2.2 结果和讨论 105

4.3 蛋白质复合物挖掘算法ClusterBFS 122

4.3.1 算法描述 122

4.3.2 结果和讨论 126

4.4 本章总结 135

第5章 基于蛋白质网络的疾病基因研究 137

5.1 研究背景 137

5.2 疾病基因识别算法PDMG 141

5.2.1 算法描述 141

5.2.2 结果和讨论 144

5.3 疾病基因识别算法IMIDG 150

5.3.1 算法描述 150

5.3.2 结果和讨论 154

5.4 本章总结 160

第6章 结束语 162

6.1 本书的主要贡献和创新点 162

6.2 展望 164

参考文献 166

后记 203