简明生物信息学PDF电子书下载
- 电子书积分:10 积分如何计算积分?
- 作 者:钟扬等主编;马坚等编写
- 出 版 社:北京:高等教育出版社
- 出版年份:2001
- ISBN:7040101599
- 页数:220 页
第一章 绪论 1
1.1 生物信息学的产生与发展 1
1.1.1 生产学发展与计算机应用 1
1.1.2 生物信息学及分支学科 2
1.1.3 生物信息学发展阶段与研究方向 2
1.1.4 我国生物信息学研究的发展方向 4
1.2 生物信息学基本方法与前沿技术 4
1.2.1 基本方法 4
1.2.2 前沿技术 5
1.3 生物信息学的应用 6
1.3.1 生物信息的经济价值与生物信息学市场 6
1.3.2 基因组分析 8
1.3.3 基因芯片 9
1.3.4 药物开发 9
1.3.5 其他应用领域 10
1.4 生物信息学教育与学习 15
1.4.1 生物信息学教育项目 15
1.4.2 生物信息学的学习与实践 17
1.4.3 本书要点 18
阅读材料 19
参考文献 19
第二章 生物信息化学的计算机基础 21
2.1 数据管理与数据库技术 21
2.1.1 数据管理的3种形式及其特点 21
2.1.2 数据库基本概念 22
2.1.3 数据库体系结构的3个抽象级和两级数据独立性 25
2.1.4 关系数据库 26
2.1.5 数据库的保护 28
2.1.6 数据库是高层应用的基础 28
2.2 计算机网络与 Internet 29
2.2.1 局域网与广域网 29
2.2.2 客房机/服务器体系结构 30
2.2.3 网络中的常用组件 31
2.2.4 Internet及其发展 31
2.2.5 TCP/IP协议 32
2.2.6 IP地址和域名服务 33
2.2.7 与Internet 的连接方式 35
2.2.8 Internet提供的服务 35
2.3 Internet上的高级信息管理 42
2.4 Java及移动计算 44
2.5 数据仓库和数据挖掘 45
2.6 其他的计算机知识 47
2.6.1 算法和算法分析 47
2.6.3 配对算法 48
2.6.2 相似性度量 48
2.6.4 分类与聚类 49
2.6.5 隐马尔可夫模型 49
2.6.6 人工神经网络 50
思考题 50
阅读材料 51
参考文献 51
第三章 生物信息学资源与数据控掘工具 52
3.1 引言 52
3.2.1 基因组信息 56
3.2 生物信息学资源 56
3.2.2 蛋白质信息 63
3.2.3 整合生物学信息 67
3.3 分子数据挖掘工具 72
3.3.1 序列相似性查询软件 73
3.3.2 通用序列查询和模式识别工具 78
3.3.3 构建序列查询协议 81
3.3.4 数据挖掘工具例子——GeneMine 82
思考题 85
阅读材料 85
参考文献 85
第四章 DNA序列分析 87
4.1 引言 87
4.1.1 为什么要分析DNA序列 87
4.1.2 基因结构与NDA序列分析 88
4.2 表达序列标签分析 90
4.2.1 cNDA文库与表达序列标签 90
4.2.2 EST数据库 92
4.2.3 EST分析 93
4.2.4 电子克隆cDNA全长序列 98
4.3 序列对位排列 100
4.3.1 记分矩阵 101
4.3.2 点标方法 104
4.3.3 全局排列与局部排列 105
4.3.4 CLUSTAL软件 109
思考题 114
阅读材料 114
参考文献 114
第五章 分子系统发育分析 116
5.1 分子进化的基本概念 116
5.1.1 同源性与同源性状 116
5.1.2 类群 117
5.1.3 系统(发育)树 118
5.2.1 核苷酸序列进化 120
5.2 分子进化模型与序列分歧度计算 120
5.2.2 蛋白质编码序列进化 121
5.2.3 核苷酸序列分歧度 122
5.2.4 蛋白质编码序列分歧工 123
5.3 分子系统树的构建 124
5.3.1 距离矩阵法 124
5.3.2 简约法 128
5.4 分子系统树检验 135
5.4.1 一致性指数与一致树 136
5.4.2 统计检验 137
5.5 分子系统发育分析软件及应用 138
5.5.1 软件包 138
5.5.2 应用实例 142
思考题 147
阅读材料 147
参考文献 147
第六章 基因组分析 150
6.1 引言 150
6.2.1 基因组的结构组成与稳定性 151
6.2 基因组分析原理 151
6.2.2 基因组作图 155
6.2.3 基因组计划 159
6.3 功能基因组学 161
6.3.1 功能基因与功能基因组学 161
6.3.2 非确定读码(URF) 162
6.3.3 直系同源体簇(COG) 163
6.4.1 基本原理 166
6.4 比较基因组学 166
6.4.2 主要方法 167
6.4.3 功能网络 169
6.5 基因组分析系统实例——ACeDB 170
6.5.1 ACeDB的主要结构与功能 171
6.5.2 ACeDB的应用实例 173
思考题 176
阅读材料 176
参考文献 177
7.1.1 什么是蛋白质组 179
第七章 蛋白质组分析 179
7.1 引言 179
7.1.2 为什么需要蛋白质组学 180
7.1.3 蛋白质组研究的发展 180
7.1.4 蛋白质分析中的信息学工具 181
7.2 蛋白质组分析技术 181
7.2.1 蛋白质组分析的出发点 181
7.2.2 蛋白质组分析的技术路线 182
7.2.3 蛋白质组分析的关键技术 183
7.2.4 蛋白质组分析模型与数据库 189
7.2.5 SWISS-PROT应用实例 195
思考题 198
阅读材料 198
参考文献 199
附录1 生物信息学相关网址 201
附录2 生物信息学相关刊物 211
附录3 英汉名词索引 213
附录4 缩略词表 217
- 《管理信息系统习题集》郭晓军 2016
- 《生物质甘油共气化制氢基础研究》赵丽霞 2019
- 《信息系统安全技术管理策略 信息安全经济学视角》赵柳榕著 2020
- 《奶制品化学及生物化学》(爱尔兰)福克斯(FoxP.F.)等 2019
- 《生物化学》田余祥主编 2020
- 《ESG指标管理与信息披露指南》管竹笋,林波,代奕波主编 2019
- 《微生物培养与显微检验》李晶主编 2018
- 《灭绝生物的故事》小牛顿科学教育公司编辑团队编著 2018
- 《大学计算机信息技术教程 2018版》张福炎 2018
- 《大数据环境下的信息管理方法技术与服务创新丛书 俄罗斯档案事业改革与发展研究》徐胡乡责编;肖秋会 2019
- 《断陷湖盆比较沉积学与油气储层》赵永胜等著 1996
- 《电子测量与仪器》人力资源和社会保障部教材办公室组织编写 2009
- 《高考快速作文指导》张吉武,鲍志伸主编 2002
- 《建筑施工企业统计》杨淑芝主编 2008
- 《钒产业技术及应用》高峰,彭清静,华骏主编 2019
- 《近代旅游指南汇刊二编 16》王强主编 2017
- 《汉语词汇知识与习得研究》邢红兵主编 2019
- 《黄遵宪集 4》陈铮主编 2019
- 《孙诒让集 1》丁进主编 2016
- 《近代世界史文献丛编 19》王强主编 2017
- 《全国高等中医药行业“十三五”创新教材 中医药学概论》翟华强 2019
- 《培智学校义务教育实验教科书教师教学用书 生活适应 二年级 上》人民教育出版社,课程教材研究所,特殊教育课程教材研究中心编著 2019
- 《指向核心素养 北京十一学校名师教学设计 英语 七年级 上 配人教版》周志英总主编 2019
- 《习近平总书记教育重要论述讲义》本书编写组 2020
- 《办好人民满意的教育 全国教育满意度调查报告》(中国)中国教育科学研究院 2019
- 《高等数学试题与详解》西安电子科技大学高等数学教学团队 2019
- 《北京生态环境保护》《北京环境保护丛书》编委会编著 2018
- 《教育学考研应试宝典》徐影主编 2019
- 《语文教育教学实践探索》陈德收 2018
- 《家庭音乐素养教育》刘畅 2018