计算机辅助药物设计 原理、方法及应用PDF电子书下载
- 电子书积分:15 积分如何计算积分?
- 作 者:陈凯先等主编
- 出 版 社:上海:上海科学技术出版社
- 出版年份:2000
- ISBN:7532355519
- 页数:487 页
第一章 绪论 1
1.1 引言 1
1.2 药物先导化合物的发现 2
1.3 计算机辅助药物设计的策略 4
1.4 计算机辅助药物设计成功的例子 7
1.5 结语 15
参考文献 17
第二章 量子化学计算方法 22
2.1 引言 22
2.2 药物和生物分子计算的量子化学方法 23
2.3 环境的影响——溶剂效应的理论计算方法 54
2.4 生物大分子量子化学计算方法 63
2.5 结语 71
参考文献 71
第三章 分子力学 76
3.1 引言 76
3.2 理论方法 77
3.3 构象分析方法 91
3.4 分子力学在药物设计中的应用 97
3.5 结语 101
参考文献 101
第四章 配体-受体相互作用及其结合自由能的理论计算 106
4.1 引言 106
4.2 配体-受体相互作用的热力学过程 107
4.3 分子动力学与自由能微扰方法 111
4.4 结合自由能的经验计算方法 119
4.5 结语 132
参考文献 133
第五章 定量构效关系 141
5.1 引言 141
5.2 二维定量构效关系分析方法 141
5.3 3D-QSAR方法 165
5.4 QSASR的应用 174
5.5 结语 187
参考文献 188
第六章 药效基团模型 196
6.1 引言 196
6.2 药效基团的概念及用途 198
6.3 活性构象 205
6.4 分子叠合方法 206
6.5 药效基团的建立和评估的理论计算方法 211
6.6 受体排斥体积和受体必需体积 213
6.7 三维药效基团模型及应用举例 214
6.8 结语 222
参考文献 223
第七章 三维结构数据库搜寻 228
7.1 引言 228
7.2 三维结构的来源 228
7.3 二维结构搜寻 233
7.4 三维结构搜寻 234
7.5 有关三维结构搜寻的软件 241
7.6 应用举例 244
7.7 结语 249
参考文献 250
第八章 分子对接 255
8.1 引言 255
8.2 分子对接法的基本原理 255
8.3 Docking 256
8.4 Dock 257
8.5 AutoDock 262
8.6 FlexX 266
8.7 FlexiDock 270
8.8 分子对接在药物设计中的应用 273
8.9 结语 277
参考文献 277
第九章 全新药物设计 282
9.1 引言 282
9.2 全新药物设计概述 283
9.3 全新药物设计方法 285
9.4 结语 299
参考文献 300
第十章 组合化学与药物设计 309
10.1 引言 309
10.2 化学库合成方法简介 310
10.3 组合化学中分子差异性设计方法 314
10.4 虚拟组合化学库 316
10.5 基于结构的药物设计与组合化学的结合 325
10.6 结语 328
参考文献 329
第十一章 二氢叶酸还原酶的作用机理及其抑制剂设计 332
11.1 引言 332
11.2 作为药物的DHFR抑制剂 333
11.3 DHFR的氨基酸序列 333
11.4 DHFR的晶体结构及其与抑制剂的作用 336
11.5 基于结构的DHFR抑制剂设计 351
11.6 结语 354
参考文献 355
第十二章 HIV蛋白酶抑制剂的设计 360
12.1 引言 360
12.2 HIV PR的结构 360
12.3 与配体(抑制剂)结合后HIV PR的结构特性 362
12.4 HIV PR-抑制剂复合物的结构 364
12.5 HIV PR抑制剂的设计 371
12.6 结语 377
参考文献 378
第十三章 其他酶抑制剂的设计 383
13.1 引言 383
13.2 胸苷酸合成酶抑制剂 383
13.3 碳酸酐酶抑制剂 387
13.4 嘌呤核苷磷酸化酶抑制剂设计 393
13.5 中性肽链内切酶抑制剂 395
13.6 血管紧张素和NEP二元抑制剂 397
13.7 唾液酸酶抑制剂 399
13.8 凝血酶抑制剂 400
13.9 结语 402
参考文献 404
第十四章 阿片受体三维结构的模建和配体-受体相互作用研究 410
14.1 引言 410
14.2 阿片受体选择性配体的研究状况 411
14.3 阿片受体的分子生物学 414
14.4 阿片受体三维结构的模拟方法 417
14.5 μ阿片受体与芬太尼类化合物相互作用的分子模拟 431
14.6 δ阿片受体及其与配体相互作用的分子模拟 441
14.7 κ阿片受体及其与选择性配体作用的分子模拟 448
14.8 阿片孤儿受体三维结构模建及其与配体相互作用研究 455
14.9 结语 466
参考文献 466
附录 480
主题词索引 480
人名索引 484
- 《计算机网络与通信基础》谢雨飞,田启川编著 2019
- 《大学计算机实验指导及习题解答》曹成志,宋长龙 2019
- 《计算机辅助平面设计》吴轶博主编 2019
- 《计算机组成原理解题参考 第7版》张基温 2017
- 《第一性原理方法及应用》李青坤著 2019
- 《云计算节能与资源调度》彭俊杰主编 2019
- 《Helmholtz方程的步进计算方法研究》李鹏著 2019
- 《高等院校保险学专业系列教材 保险学原理与实务》林佳依责任编辑;(中国)牟晓伟,李彤宇 2019
- 《天然药物化学》孔令义主编 2019
- 《药物分析》贡济宇主编 2017
- 《钒产业技术及应用》高峰,彭清静,华骏主编 2019
- 《现代水泥技术发展与应用论文集》天津水泥工业设计研究院有限公司编 2019
- 《异质性条件下技术创新最优市场结构研究 以中国高技术产业为例》千慧雄 2019
- 《Prometheus技术秘笈》百里燊 2019
- 《中央财政支持提升专业服务产业发展能力项目水利工程专业课程建设成果 设施农业工程技术》赵英编 2018
- 《药剂学实验操作技术》刘芳,高森主编 2019
- 《林下养蜂技术》罗文华,黄勇,刘佳霖主编 2017
- 《脱硝运行技术1000问》朱国宇编 2019
- 《催化剂制备过程技术》韩勇责任编辑;(中国)张继光 2019
- 《信息系统安全技术管理策略 信息安全经济学视角》赵柳榕著 2020