海洋生物功能基因开发与利用PDF电子书下载

第一章 概述 1

第一节 基因与基因资源 1

一、基因的基本概念 1

二、基因资源的特性 2

三、功能基因的发掘利用 4

第二节 海洋生物功能基因与基因资源 5

一、海洋生物基因资源的特点 5

二、海洋生物基因资源研究现状 6

三、海洋生物功能基因开发利用 7

主要参考文献 8

第二章 海洋生物功能基因发掘与验证技术 9

第一节 基因组学技术 9

一、基因组调查 10

二、普通基因组图谱 12

三、复杂基因组图谱 17

第二节 转录组学技术 18

一、转录组技术平台 18

二、基于高通量测序的转录组学技术 19

三、转录组研究其他技术 22

四、单细胞转录组技术 23

五、非编码RNA研究技术 23

第三节 蛋白质组学技术 24

一、简介 24

二、研究进展及应用实例 27

三、展望及发展趋势 30

第四节 宏基因组学技术 31

一、宏基因组学起源 31

二、宏基因组学在海洋微生物研究中的应用 33

第五节 海洋生物功能基因验证技术 36

一、功能基因的结构特征分析与功能预测 36

二、基因表达规律分析技术 44

三、基于基因功能获得与失活策略的研究技术 47

四、基于基因编码产物与蛋白质或核酸相互作用的研究技术 49

主要参考文献 52

第三章 海洋生物功能基因开发利用技术 54

第一节 海洋生物基因功能产品——天然产物 54

一、简介 54

二、研究进展及应用实例 54

三、展望及趋势 61

第二节 海洋生物药用功能基因开发 61

一、概述 61

二、国内外研发现状与趋势 62

三、发展前景 68

第三节 海洋生物抗菌肽的研究与利用 69

一、简介 69

二、研究进展及应用实例 70

三、展望及趋势等 74

第四节 海洋生物基因功能产品——工业用品 76

一、概念、原理和技术 76

二、海洋生物基因工业产品的研究进展 80

三、展望 84

第五节 系统发育学及DNA条形码 85

一、系统发育学 85

二、DNA条形码 91

第六节 海洋环境污染监测技术及病原检测技术 94

一、海洋环境污染监测技术及病原检测技术简介 94

二、研究进展及应用实例 97

三、展望及趋势 101

主要参考文献 102

第四章 海洋动物功能基因的发掘和利用 104

第一节 海洋生物基因组进展 104

一、海洋鱼类 104

二、海洋鸟类 108

三、海洋爬行动物 109

四、海洋哺乳动物 110

五、其他海洋生物 112

六、总结与展望 112

第二节 半滑舌鳎 113

一、简介 113

二、半滑舌鳎基因组研究进展 114

三、半滑舌鳎重要性状相关功能基因发掘研究进展 116

第三节 牙鲆 120

一、简介 120

二、全基因组测序及精细图谱绘制研究进展 120

三、功能基因发掘利用研究进展及展望 122

第四节 石斑鱼 126

一、石斑鱼简介 126

二、斜带石斑鱼基因组研究进展 128

三、石斑鱼功能基因挖掘与利用研究进展 129

四、展望 133

第五节 弹涂鱼 133

一、弹涂鱼简介 133

二、弹涂鱼的两栖习性 134

三、弹涂鱼基因组学研究进展 135

四、弹涂鱼呼吸和体内离子平衡研究 145

五、弹涂鱼附肢的特化 145

六、总结与展望 145

第六节 大黄鱼 147

一、大黄鱼免疫系统特征 147

二、大黄鱼免疫相关基因研究 149

第七节 海马 156

一、海马简介 156

二、海马基因组及功能基因研究进展 158

三、海马功能基因研究展望 170

第八节 菊黄东方鲀 170

一、简介 170

二、基因组及功能基因研究进展 171

三、功能基因发掘利用 176

第九节 中国明对虾 177

一、简介 177

二、中国明对虾功能基因及基因组研究进展 178

三、中国明对虾功能基因研究的应用前景 186

第十节 凡纳滨对虾 188

一、简介 188

二、凡纳滨对虾功能基因及基因组研究进展 189

三、凡纳滨对虾功能基因和基因组研究在生产中的应用 196

第十一节 牡蛎 198

一、牡蛎全基因组测序 199

二、生长发育基因与应用展望 199

三、贝壳形成相关功能基因与应用展望 201

四、牡蛎抗逆相关基因的筛选及应用前景 202

第十二节 扇贝 206

一、扇贝全基因组序列图谱组装及质量评估 207

二、扇贝基因组注释及结构特征分析 210

三、扇贝基因家族分析及比较基因组分析 211

四、扇贝胚胎发育基因表达模式 211

五、扇贝特殊适应性性状的遗传基础、调控机制及进化途径分析 212

第十三节 马氏珠母贝 216

一、简介 216

二、马氏珠母贝基因组的研究 217

三、以基因组为基础的功能基因研究 219

第十四节 鲍 221

一、物种简介 221

二、鲍功能基因研究进展 222

三、鲍转基因技术的初步研究 229

四、展望 229

第十五节 芋螺 230

一、简介 230

二、基因组及功能基因研究进展 232

三、芋螺毒素功能基因发掘利用 235

第十六节 芋螺转录组与芋螺毒素基因库建设 237

一、芋螺基因组调查测序分析 238

二、多种芋螺转录组测序分析 239

主要参考文献 241

第五章 海洋植物功能基因的发掘和利用 246

第一节 海洋植物基因组及功能基因研究进展 246

一、我国红藻栽培及分子生物学研究现状 247

二、我国绿潮原因种——浒苔及功能基因研究现状 249

三、我国褐藻栽培及分子生物学研究状况 249

四、海洋微藻的研究与利用 250

五、总结与展望 251

第二节 褐藻 253

一、简介 253

二、基因组及功能基因研究进展 255

三、功能基因发掘利用 258

第三节 紫菜 262

一、简介 262

二、基因组及功能基因研究进展 264

三、紫菜功能基因相关研究及发掘利用 269

第四节 江蓠 271

一、简介 271

二、基因组及功能基因研究进展 274

三、功能基因发掘利用 278

第五节 微藻 279

一、简介 279

二、基因组及功能基因研究进展 280

三、微藻功能基因的利用 284

主要参考文献 286

第六章 海洋微生物功能基因的发掘和利用 288

第一节 对虾白斑综合征病毒 288

一、WSSV基因组研究 288

二、WSSV结构蛋白研究 289

三、WSSV极早期基因研究 290

第二节 迟缓爱德华菌 291

一、迟缓爱德华菌简介 291

二、迟缓爱德华菌基因组 292

三、迟缓爱德华菌基因功能研究 294

四、基于迟缓爱德华菌毒力功能基因的相关疫苗设计 296

第三节 其他海洋微生物 297

一、简介 297

二、基因组及功能基因研究进展 299

三、功能基因发掘利用 305

第四节 极端环境微生物 311

一、简介 311

二、基因组及功能基因研究进展 312

三、功能基因发掘利用 315

主要参考文献 316

第七章 其他海洋生物功能基因的发掘和利用 318

第一节 单环刺螠 318

一、种类概况简介 318

二、基因组及功能基因研究进展 319

三、功能基因应用研究 323

第二节 绿海龟 326

一、绿海龟和中华鳖简介 326

二、绿海龟和中华鳖基因组的测序及组装 326

三、结果与分析 326

四、总结 331

第三节 小须鲸 331

一、物种简介 331

二、基因组工作 331

三、重要功能基因 333

主要参考文献 334

第八章 海洋生物基因资源共享及数据库建设 335

第一节 海洋生物基因资源共享办法 335

一、总则 335

二、共享海洋生物基因数据资源的保存原则及方式 335

三、海洋生物基因资源共享原则及方式 336

四、海洋生物基因资源保存及共享各方责权 337

五、管理机构及职能 337

第二节 千种鱼类转录组计划 337

第三节 国际水生哺乳动物基因组计划 339

第四节 深圳国家基因库的数据库建设与应用 340

一、简介 340

二、国家基因库数据库建设 342

三、国家基因库数据库应用实例 344

四、生物信息数据库建设的探讨 351

主要参考文献 351