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常用生物数据分析软件PDF电子书下载

电子书积分：13 积分如何计算积分？
作者：王俊，丛丽娟，郑洪坤著
出版社：北京：科学出版社
出版年份：2008
ISBN：7030206223
页数：364 页

图书介绍：本书较为系统全面的介绍了生物信息学分析各个方面的软件用法，结合具体实例，使大家应用起来更具用参照性。全书共分8章，内容包括：（1）Unix/Linux操作系统介绍，介绍了基本的Unix/Linux操作命令；（2）数据的基本处理，介绍了如何处理常用的生物信息学数据；（3）序列的比对，介绍了常用的比对软件的用法及其在应用过程中要注意的问题；（4）基因组/基因的注释，介绍了Coding和Non-Codoing基因的预测方法；（5）SNP分析，介绍了常用的从生物学数据中寻找SNP的软件；（6）进化分析专题，介绍了几个常用的用于分子进化分析的软件，内容涉及进化树的构建，Ka/Ks的计算等；（7）基因表达分析专题，介绍了EST及生物芯片分析的流程和方法；（8）蛋白质结构预测，介绍了蛋白质三维结构预测的流程及方法。

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《常用生物数据分析软件》目录

标签：数据分析常用生物分析数据

第1章 Unix／Linux操作系统介绍 1

1.1远程登录 1

1.2文件的复制、删除和移动命令 6

1.4文本查看命令 10

1.5文本处理命令 12

1.6改变文件或目录的权限命令 14

1.7备份与压缩命令 16

1.8磁盘及系统管理 18

1.9软件安装简介 20

1.10其他 20

第2章数据的基本处理 22

2.1数据常用格式介绍 22

2.2测序原理介绍 32

2.3峰图转化（Phred ） 33

2.4文件转换（phd2fasta ） 40

2.5载体屏蔽（cross_match） 43

2.6序列聚类拼接 51

2.7 Consed 63

2.8引物设计（Primer3） 77

主要参考文献 82

第3章序列的比对 83

3.1全局比对 85

3.2局部比对 105

主要参考文献 158

第4章基因组／基因的注释 160

4.1重复序列分析 160

4.2 RNA分析 177

4.3基因预测 198

4.4基因功能注释 219

主要参考文献 229

第5章 SNP分析 231

5.1 Polyphred 232

5.2 SNPdetector 237

5.3 cross_match 244

主要参考文献 248

第6章进化分析专题 249

6.1 Phylip 250

6.2 Paml 257

6.3 KaKs_ Calculator 263

6.4 FGF 270

6.5 MEGA 282

主要参考文献 286

第7章基因表达分析专题 287

7.1 EST表达序列标签分析 287

7.2生物芯片分析 307

7.3 Motif预测 321

主要参考文献 341

第8章蛋白质结构预测 343

8.1蛋白质结构知识介绍 343

8.2蛋白质结构预测方法 350

8.3蛋白质结构预测的Threading方法 350

8.4蛋白质三维结构预测流程介绍 351

主要参考文献 363

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