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一、遗传标记的发展 1

第一章 遗传标记概述 1

二、遗传标记的种类 2

(一)形态标记 2

(二)细胞学标记 4

(三)蛋白质标记 5

(二)QTL的定向选择 7

(四)DNA标记 7

(一)RFLP标记技术 10

一、基于DNA-DNA杂交的DNA标记 10

第二章 DNA标记技术 10

(二)VNTR标记技术 12

二、基于PCR技术的DNA标记 13

(一)随机引物的PCR标记 13

(二)特异引物的PCR标记 15

三、基于限制性酶切和PCR的DNA标记 18

(一)AFLP标记 18

(二)CAPS标记 20

四、基于单个核苷酸多态性的DNA标记 20

(一)亲本的选配 22

第三章 分子图谱的构建 22

一、作图群体的建立 22

(二)分离群体类型的选择 23

(三)群体大小的确定 25

二、图谱构建的理论基础 25

(一)染色体遗传理论 25

(二)基因重组和连锁理论 26

(三)图谱制作的统计学原理 26

三、DNA标记分离数据的数学处理 29

(一)分离数据的收集与数字化 29

(二)遗传图距与物理距离对应关系的估计 30

(三)构建DNA标记图谱的计算机软件 30

四、DNA标记连锁图谱的完善 31

(一)DNA标记连锁群的染色体定位 31

(二)饱和DNA标记连锁图的制作 32

(三)DNA标记连锁图与经典遗传连锁图的整合 33

五、比较作图 33

(一)近等基因系的培育 35

一、近等基因系分析法 35

第四章 质量性状的分子标记 35

(二)近等基因系分析法的基本原理 37

(一)基于性状表现型的BSA法 38

(三)近等基因系分析法应用实例 38

二、分离体分组混合分析法 38

(二)基于标记基因型的BSA法 39

第五章 数量性状的分子标记 41

一、数量性状基因的初级定位 42

(一)QTL定位的基本原理和方法 42

(二)均值差检验法 44

(三)性状-标记回归法 47

(四)性状-QTL回归法 47

(五)性状-QTL-标记回归法 49

(六)基于性状-标记回归的区间定位 51

(七)QTL定位的计算机软件 52

(八)QTL定位的可靠性 52

(九)提高QTL定位灵敏度和精确度的方法 53

二、数量性状基因的精细定位 54

(一)单个QTL的精细定位 54

(二)全基因组QTL的精细定位 55

第六章 分子标记辅助选择 57

一、质量性状的标记辅助选择 57

(一)前景选择 58

(二)背景选择 59

(三)基因聚合 60

(四)基因转移 61

二、数量性状的标记辅助选择 64

(一)表型值选择 65

(二)标记值选择 65

(三)指数选择 67

(四)基因型选择 69

三、标记辅助选择的应用研究 71

(一)半个主基因的回交转移 71

(三)QTL的回交转移 72

四、标记辅助选择的发展策略 75

结束语 79

参考文献 80