伯杰细菌鉴定手册 第8版PDF电子书下载

目录 1

关于怎样使用手册 1

细菌在生物界中的地位 3

鉴定机制 7

细菌保藏介绍——模式菌株和新模式菌株的必要和要求 9

十九个部分的检索表 12

原核生物界 14

门Ⅰ蓝细菌 14

门Ⅱ细菌 15

目Ⅰ红螺菌目（Rhodospirillales） 16

第一部分 光能自养细菌 16

科Ⅰ红螺菌科（Rhodospirillaceae） 17

属Ⅰ红螺菌属（Rhodospirillum） 18

属Ⅱ红假单胞菌属（Rhodopseudomonas） 22

属Ⅲ红微菌属（Rhodomicrobium） 28

科Ⅱ着色菌科（Chromatiaceae） 30

属Ⅰ着色菌属（Chromatium） 31

属Ⅱ囊硫菌属（Thiocystis） 36

属Ⅲ八球硫菌属（Thiosarcina） 38

属Ⅳ硫螺旋菌属（Thiospirillum） 39

属Ⅴ荚硫菌属（Thiocapsa） 41

属Ⅵ闪囊菌属（Lamprocystis） 43

属Ⅶ网硫菌属（Thiodictyon） 44

属Ⅷ板硫菌属（Thiopedia） 45

属Ⅸ可变杆菌属（Amoebobacter） 46

属Ⅹ外硫红螺菌属（Ectothiorhodospira） 48

科Ⅲ绿菌科（Chlorobiaceae） 54

属Ⅰ绿菌属（Chlorobium） 55

属Ⅱ突柄绿菌属（Prosthecochloris） 59

属Ⅲ绿假单胞菌属（Chloropseudomonas） 60

属Ⅳ暗网菌属（Pelodictyon） 61

属Ⅴ格状绿菌属（Clathrochloris） 68

目Ⅰ粘细菌目（Myxobacterales） 81

第二部分 滑动细菌 81

科Ⅰ粘球菌科（Myxococcaceae） 84

属Ⅰ粘球菌属（Myxococcus） 85

科Ⅱ原囊菌科（Archangiaceae） 91

属Ⅰ原囊菌属（Archangium） 91

科Ⅲ孢囊杆菌科（Cystobacteraceae） 95

属Ⅰ孢囊杆菌属（Cystobacter） 96

属Ⅱ蜂窝囊菌属（Melittangium） 99

属Ⅲ标桩菌属（Stigmatella） 102

科Ⅳ多囊菌科（Polyangiaceae） 104

属Ⅰ多囊菌属（Polyangium） 105

属Ⅱ小囊菌属（Nannocystis） 110

属Ⅲ软骨霉状菌属（Chondromyces） 111

目Ⅱ噬纤维菌目（Cytophagales） 115

科Ⅰ噬纤维菌科（Cytophagaceae） 116

属Ⅰ噬纤维菌属（Cytophaga） 117

属Ⅱ屈挠杆菌属（Flexibacter） 123

属Ⅲ滑柱菌属（Herpetosiphon） 127

属Ⅳ柔发菌属（Flexithrix） 129

属Ⅴ腐败螺旋菌属（Saprospira） 130

属Ⅳ生孢噬纤维菌属（Sporocytophaga） 133

科Ⅱ贝日阿托氏菌科（Beggiatoaceae） 134

属Ⅰ贝日阿托氏菌属（Beggiatoa） 135

属Ⅱ透明颤菌属（Vitreoscilla） 137

属Ⅲ辫硫菌属（Thioploca） 139

科Ⅲ西蒙斯氏菌科（Simonsiellaceae） 140

属Ⅰ西蒙斯氏菌属（Simonsiella） 140

属Ⅱ小链菌属（Alysiella） 142

科Ⅵ亮发菌科（Leucotrichaceae） 143

属Ⅰ亮发菌属（Leucothrix） 144

属Ⅱ发硫菌属（Thiothrix） 145

位置不定的科和属 145

曲发菌属（Toxothrix） 145

无色菌属（Achromatium） 147

无色菌科（Achromatiaceae） 147

泥线菌科（Pelonemataceae） 148

属Ⅰ泥线菌属（Pelonema） 149

属Ⅱ无色线菌属（Achroonema） 150

属Ⅲ泥辫菌属（Peloploca） 154

属Ⅳ花丛菌属（Desmanthos） 155

第三部分 鞘细菌 157

球衣菌属（Sphaerotilus） 157

纤发菌属（Leptothrix） 159

软发菌属（Streptothrix） 163

利斯克氏菌属（Liesheella） 164

栅状发菌属（Phragmidiothrix） 165

泉发菌属（Crenothrix） 166

细枝发菌属（Clonothrix） 167

第四部分 生芽的和（或）有附属物的细菌 180

生丝微菌属（Hyphomicrobium） 181

生丝单胞菌属（Hyphomonas） 183

土微菌属（Pedomicrobium） 185

柄杆菌属（Caulobacter） 186

不粘柄菌属（Asticcacaulis） 190

臂微菌属（Ancalomicrobium） 191

突柄微菌属（Prosthecomicrobium） 192

枝硫菌属（Thiodendron） 193

巴斯德氏柄菌属（Pasteuria） 194

芽生杆菌属（Blastobacter） 195

塞里伯氏菌属（Seliberia） 196

嘉利翁氏菌属（Gallionella） 197

涅瓦河菌属（Nevskia） 199

浮霉状菌属（Planctomyces） 200

生金菌属（Metallogenium） 202

柄球菌属（Caulococcus） 204

库兹涅佐夫氏菌属（Kusnezovia） 205

科Ⅰ螺旋体科（Spirochaetaceae） 207

目Ⅰ螺旋体目（Spirochaetales） 207

第五部分 螺旋体菌 207

属Ⅰ螺旋体属（Spirochaeta） 208

属Ⅱ脊螺旋体属（Cristispira） 212

属Ⅲ密螺旋体属（Treponema） 216

属Ⅳ疏螺旋体属（包柔氏螺旋体属）（Borrelia） 229

属Ⅴ钩端螺旋体属（细螺旋体属）（Leptospira） 238

第六部分 螺旋状和弯曲的杆菌 245

科Ⅰ螺菌科（Spirillaceae） 245

属Ⅰ螺菌属（Spirillum） 245

属Ⅱ弯曲杆菌属（Campylobacter） 260

蛭弧菌属（Bdellovibrio） 267

位置不定的属 267

微环菌属（Microcyclus） 270

暗屈曲菌属（Pelosigma） 272

短弓菌属（Brachyarcus） 273

第七部分 革兰氏阴性好氧杆菌和球菌 274

科Ⅰ假单胞菌科（Pseudomonadaceae） 274

属Ⅰ假单胞菌属（Pseudomonas） 274

属Ⅱ黄单胞菌属（Xanthomonas） 313

属Ⅲ动胶菌属（Zoogloea） 323

属Ⅳ葡糖杆菌属（Gluconobacter） 325

科Ⅱ固氮菌科（Azotobacteraceae） 329

属Ⅰ固氮菌属（Azotobacter） 330

属Ⅱ氮单胞菌属（Azomonas） 332

属Ⅲ拜叶林克氏菌属（Beijerinckia） 333

属Ⅳ德克斯氏菌属（Derxia） 338

科Ⅲ根瘤菌科（Rhizobiaceae） 340

属Ⅰ根瘤菌属（Rhizobium） 341

属Ⅱ土壤杆菌属（Agrobacterium） 345

科Ⅳ甲基单胞菌科（Methylomonadaceae） 349

属Ⅰ甲基单胞菌属（Methylomonas） 350

属Ⅱ甲基球菌属（Methylococcus） 352

科Ⅴ盐杆菌科（Halobacteriaceae） 353

属Ⅰ盐杆菌属（Halobacterium） 354

属Ⅱ盐球菌属（Halococcus） 357

位置不定的属 359

产碱菌属（Alcaligenes） 359

醋杆菌属（Acetobacter） 362

布鲁氏菌属（Brucella） 366

博德特氏菌属（Bordetella） 371

弗朗西丝氏菌属（Francisella） 374

栖热菌属（Thermus） 376

第八部分 革兰氏阴性兼性厌氧杆菌 382

科Ⅰ肠杆菌科（Enterobacteriaceae） 382

属Ⅰ埃希氏菌属（Escherichia） 385

属Ⅱ爱德华氏菌属（Edwardsiella） 389

属Ⅲ柠檬酸细菌属（Citrobacter） 390

属Ⅳ沙门氏菌属（Salmonella） 392

属Ⅴ志贺氏菌属（Shigella） 442

属Ⅵ克雷伯氏菌属（Klebsiella） 446

属Ⅶ肠杆菌属（Enterobacter） 450

属Ⅷ哈夫尼菌属（Hafnia） 452

属Ⅸ沙雷氏菌属（Serratia） 453

属Ⅹ变形菌属（Proteus） 454

属Ⅺ耶尔森氏菌属（Yersinia） 458

属Ⅻ欧文氏菌属（Erwinia） 462

科Ⅱ弧菌科（Vibrionaceae） 474

属Ⅰ弧菌属（Vibrio） 475

属Ⅱ气单胞菌属（Aeromonas） 482

属Ⅲ邻单胞菌属（Plesiomonas） 487

属Ⅳ发光杆菌属（Photobacterium） 488

属Ⅴ射光杆菌属（Lucibacterium） 490

位置不定的属 491

发酵单胞菌属（Zymomonas） 491

色杆菌属（Chromobacterium） 493

黄杆菌属（Flavobacterium） 498

嗜血菌属（Haemophilus） 507

阴道嗜血菌（H．vaginalis） 514

巴斯德氏菌属（Pasteurella） 516

放线杆菌属（Actinobacillus） 521

心杆菌属（Cardiobacterium） 526

链杆菌属（Streptobacillus） 528

鞘杆菌属（Calymmatobacterium） 532

双小核草履虫（Parameciumauretia）的胞内细菌 533

第九部分 革兰氏阴性厌氧细菌 535

科Ⅰ拟杆菌科（Bacteroidaceae） 535

属Ⅰ拟杆菌属（Bacteroides） 535

属Ⅱ梭杆菌属（Fusobacterium） 561

属Ⅲ纤毛菌属（Leptotrichia） 576

脱硫弧菌属（Desulfovibrio） 579

亲缘关系未定的属 579

丁酸弧菌属（Butyrivibrio） 582

琥珀酸弧菌属（Succinivibrio） 584

琥珀酸单胞菌属（Succinimonas） 585

毛螺菌属（Lachnospira） 586

月形单胞菌属（Selenomonas） 587

第十部分 革兰氏阴性球菌和球杆菌 591

科Ⅰ奈瑟氏球菌科（Neisseriaceae） 591

属Ⅰ奈瑟氏球菌属（Neisseria） 591

属Ⅱ布兰汉氏球菌属（Branhamella） 598

属Ⅲ莫拉氏菌属（Moraxella） 599

属Ⅳ不动杆菌属（Acinetobacter） 604

位置不定的属 607

副球菌属（Paracoccus） 607

俊片菌属（Lampropedia） 609

第十一部分 革兰氏阴性厌氧球菌 615

科Ⅰ韦荣氏球菌科（Veillonellaceae） 615

属Ⅰ韦荣氏球菌属（Veillonella） 615

属Ⅱ氨基酸球菌属（Acidaminococcus） 618

属Ⅲ巨型球菌属（Megasphaera） 620

a．氧化氨或硝酸盐的细菌 622

科Ⅰ硝化杆菌科（Nitrobacteraceae） 622

第十二部分 革兰氏阴性化能自养细菌 622

属Ⅰ硝化杆菌属（Nitrobacter） 623

属Ⅱ硝化刺菌属（Nitrospina） 625

属Ⅲ硝化球菌属（Nitrococcus） 625

属Ⅳ亚硝化单胞菌属（Nitrosomonas） 626

属Ⅴ亚硝化螺菌属（Nitrosospira） 627

属Ⅵ亚硝化球菌属（Nitrosococcus） 628

属Ⅶ亚硝化叶菌属（Nitrosolobus） 630

b．代谢硫磺的细菌 631

属Ⅰ硫杆菌属（Thiobacillus） 631

属Ⅱ硫化叶菌属（Sulfolobus） 638

属Ⅲ硫小杆菌属（Thiobacterium） 639

属Ⅳ大单胞菌属（Macromonas） 640

属Ⅴ卵硫菌属（Thiovulum） 641

属Ⅵ硫螺菌属（Thiospira） 642

c．沉淀铁和镁氧化物的细菌 643

科Ⅰ鞘铁菌科（Siderocapsaceae） 643

属Ⅰ鞘铁菌属（Siderocapsa） 644

属Ⅱ瑙曼氏菌属（Naumanniella） 646

属Ⅲ赭菌属（Ochrobium） 647

属Ⅳ铁球菌属（Siderococcus） 648

第十三部分 产甲烷的细菌 652

科Ⅰ甲烷杆菌科（Methanobacteriaceae） 652

属Ⅰ甲烷杆菌属（Methanobacterium） 653

属Ⅱ甲烷八叠球菌属（Methanosarcina） 657

属Ⅲ甲烷球菌属（Methanococcus） 658

第十四部分 革兰氏阳性球菌 660

a．好氧和（或）兼性厌氧球菌 660

科Ⅰ微球菌科（Micrococcaceae） 660

属Ⅰ微球菌属（Micrococcus） 661

属Ⅱ葡萄球菌属（Staphylococcus） 667

属Ⅲ动性球菌属（Planococcus） 675

科Ⅱ链球菌科（Streptococcaceae） 677

属Ⅰ链球菌属（Streptococcus） 677

属Ⅱ明串珠菌属（Leuconostoc） 702

属Ⅲ片球菌属（Pediococcus） 707

属Ⅳ气球菌属（Aerococeus） 710

属Ⅴ孪生菌属（Cemella） 712

b．厌氧球菌 713

科Ⅲ消化球菌科（Peptococcaceae） 713

属Ⅰ消化球菌属（Peptococcus） 714

属Ⅱ消化链球菌属（Peptostreptococcus） 720

属Ⅲ瘤胃球菌属（Ruminococeus） 724

属Ⅵ八叠球菌属（Sarcina） 727

科Ⅰ芽孢杆菌科（Bacillaceae） 729

属Ⅰ芽孢杆菌属（Bacillus） 729

第十五部分 芽孢杆菌和球菌 729

属Ⅱ芽孢乳杆菌属（Sporolactobacillus） 759

属Ⅲ梭菌属（Clostridium） 760

属Ⅵ脱硫肠状菌属（Desulfotomaculum） 792

属Ⅴ芽孢八叠球菌属（Sporosarcina） 794

位置不定的属 795

颤螺菌属（Oscillospira） 795

第十六部分 革兰氏阳性不生芽孢的杆状细菌 797

科Ⅰ乳杆菌科（Lactobacillaceae） 797

属Ⅰ乳杆菌属（Lactobacillus） 797

利斯特氏菌属（Listeria） 822

位置不定的属 822

丹毒丝菌属（Erysipelothrix） 827

显核菌属（Caryophanon） 828

第十七部分 放线菌及其有关细菌类群 830

棒状菌群 830

属Ⅰ棒杆菌属（Corynebacterium） 833

a．人和动物的寄生菌和病原菌 833

b．植物致病性棒杆菌 845

c．非致病棒杆菌 853

属Ⅱ节杆菌属（Arthrobacter） 855

位置不定的属 865

属A短杆菌属（Brevibacterium） 865

属B微杆菌属（Microbacterium） 870

属Ⅲ纤维单胞菌属（Cellulomonos） 872

属Ⅳ库特氏菌属（Kurthia） 875

科Ⅰ丙酸杆菌科（Propionibacteriaceae） 876

属Ⅰ丙酸杆菌属（Propionibacterium） 877

属Ⅱ真杆菌属（Eubacterium） 888

目Ⅰ放线菌目（Actinomycetales） 910

科Ⅰ放线菌科（Actinomycetaceae） 912

属Ⅰ放线菌属（4ctinomyces） 913

属Ⅱ蛛网菌属（Arachnia） 923

属Ⅲ双歧杆菌属（Bifidobacterium） 926

属Ⅳ丝杆菌属（Bacterionema） 935

属Ⅴ罗氏菌属（Rothia） 939

科Ⅱ分枝杆菌科（Mycobacteriaceae） 941

属Ⅰ分枝杆菌属（Mycobacterium） 942

科Ⅲ弗兰克氏菌科（Frankiaceae） 969

属Ⅰ弗兰克氏菌属（Frankia） 970

科Ⅳ游动放线菌科（Actinoplanaceae） 976

属Ⅰ游动放线菌属（Actinoplanes） 978

属Ⅱ螺孢菌属（Spirillospora） 981

属Ⅲ链孢囊菌属（Streptosporangium） 982

属Ⅳ无定形孢囊菌属（Amorphosporangium） 989

属Ⅴ小瓶菌属（Ampullariella） 990

属Ⅵ发仙菌属（Pilimelia） 993

属Ⅶ游动单孢菌属（Planomonospora） 995

属Ⅷ游动双孢菌属（Planobispora） 997

属Ⅸ指孢囊菌属（Dactylosporangium） 998

属Ⅹ北里菌属（Kitasatoa） 999

科Ⅴ嗜皮菌科（Dermatophilaceae） 1000

属Ⅰ嗜皮菌属（Dermatophilus） 1001

属Ⅱ地嗜皮菌属（Geodermatophilus） 1002

科Ⅵ诺卡氏菌科（Nocardiaceae） 1005

属Ⅰ诺卡氏菌属（Nocardia） 1006

属Ⅱ假诺卡氏菌属（Pseudonocardia） 1035

科Ⅶ链霉菌科（Streptomycetaceae） 1037

属Ⅰ链霉菌属（Streptomyces） 1038

属Ⅱ链轮丝菌属（Streptoverticillium） 1161

属Ⅲ鱼孢菌属（Sporichthya） 1181

属Ⅳ小荚孢囊菌属（Microellobosporia） 1182

科Ⅷ小单孢菌科（Micromonosporaceae） 1185

属Ⅰ小单孢菌属（Micromonospcra） 1186

属Ⅱ高温放线菌属（Thermoactinomycea） 1198

属Ⅲ两歧放线菌属（Actinobifida） 1200

属Ⅳ高温单孢菌属（Thermomonospora） 1202

属Ⅴ小双孢菌属（Microbispora） 1204

属Ⅵ小多孢菌属（Micropolyspora） 1207

目Ⅰ立克次氏体目（Rickettsiales） 1228

第十八部分 立克次氏体 1228

科Ⅰ立克次氏体科（Rickettsiaceae） 1229

族Ⅰ立克次氏体族（Rickettsieae） 1229

属Ⅰ立克次氏体属（Rickettsia） 1230

属Ⅱ罗卡利马氏体菌属（Rochalimaea） 1238

属Ⅲ考克斯氏体属（Coxiella） 1239

族Ⅱ埃里希氏体族（Ehrlichieae） 1242

属Ⅳ埃里希氏体属（Ehrlichia） 1242

属Ⅴ考德里氏体属（Cowdria） 1245

属Ⅵ新立克次氏体属（Neorickettsia） 1246

族Ⅲ沃尔巴克氏体族（Wolbachieae） 1247

属Ⅶ沃尔巴克氏体属（Wolbachia） 1248

属Ⅷ共生小体属（Symbiotes） 1251

属Ⅸ蟑螂杆状体属（Blattabacterium） 1252

属Ⅹ立克次氏小体属（Rickettsiella） 1253

科Ⅱ巴尔通氏体科（Bartonellaceae） 1255

属Ⅰ巴尔通氏体属（Bartonella） 1256

属Ⅱ格拉汉氏体属（Grahamella） 1258

科Ⅲ无形体科（Anaplasmataceae） 1259

属Ⅰ无形体属（Anaplasma） 1260

属Ⅱ类无形体属（Paranaplasma） 1263

属Ⅲ埃及小体属（Aegyptianella） 1264

属Ⅵ血巴通氏菌属（Haemobartonella） 1265

属Ⅴ血虫体属（Eperythrozoon） 1268

目Ⅱ衣原体目（Chlamydiales） 1271

科Ⅰ衣原体科（Chlamydiaceae） 1271

属Ⅰ衣原体属（Chlamydia） 1272

第十九部分 枝原体（菌形体） 1283

柔膜体纲（Mollicutes） 1283

目Ⅰ枝原体目（Mycoplasmatales） 1284

科Ⅰ枝原体科（Mycoplasmataceae） 1284

属Ⅰ枝原体属（Mycoplasma） 1284

属Ⅰ无胆甾原体属（Acholeplasma） 1313

科Ⅱ无胆甾原体科（Acholeplasmataceae） 1313

归属未定的属 1318

热原体属（Thermoplasma） 1318

螺原体属（Spiroplasma） 1319

植物中的类枝原体 1321

附录 1323

菌种保藏机构目录 1323

术语汇编 1327

鉴定手册中所列有机体属的位置的检索表 1341

参考文献 1388

中名索引 1533

拉丁名索引 1553