畜禽育种中的线性模型PDF电子书下载

目录 1

第一章 线性代数预备知识 1

1.1　纯量，矩阵与向量 1

1.2　一些特殊的矩阵 1

1.3　矩阵的运算 3

1.4　二次型 5

1.5　矩阵的导数 6

1.6　方差协方差矩阵 8

1.7　特征值与特征向量 10

1.8　Kronecker乘积 11

1.9　矩阵向量化 11

1.10　广义逆矩阵 12

2.1　线性模型的概念 15

第二章 线性模型基础 15

2.2　线性模型的矩阵表达式 17

2.3　虚变量模型 17

2.4　线性模型举例 19

2.5　线性模型分类 20

2.5.1　按试验因子个数分类 20

2.5.2　按效应性质分类 22

2.6　环境效应与遗传效应 24

2.6.1　环境效应 24

2.6.2　遗传效应 25

2.7　数据资料的结构 25

第三章 参数的最小二乘估计 28

3.1　常规最小二乘估计 28

3.1.1　最小二乘方程组 28

3.1.2.1　系数矩阵（X′X）满秩时的求解 29

3.1.2　最小二乘方程组的求解 29

3.1.2.2　系数矩阵（X′X）非满秩时的求解 30

3.1.3　最小二乘估计量的标准误与相关系数 44

3.2　广义最小二乘估计 46

3.2.1　广义最小二乘方程组 46

3.2.2　广义最小二乘估计量的性质 49

3.2.3　广义最小二乘估计举例 49

第四章 育种值估计方法 52

4.1　育种值的概念 52

4.2　选择指数 52

4.2.1　单个性状的育种值估计 52

4.2.2　多性状的育种值估计 57

4.3　最佳线性无偏预测 58

4.3.1 BLUP法的基本理论 58

4.3.2　混合模型方程组 62

4.3.3　BLUP估计值的性质 66

4.3.4　BLUP应用举例 68

第五章 畜禽遗传评定模型 72

5.1　公畜模型 72

5.2　公畜—母畜模型 73

5.3　外祖父模型 74

5.4　个体动物模型 76

5.5　简化动物模型 77

5.6　各种模型的比较 82

5.7　等价模型 83

5.8　其它模型 84

第六章 BLUP法的有关计算技术 87

6.1　分子血缘相关矩阵A及其逆矩阵A-1的计算 87

6.1.1　A的计算方法 87

6.1.2　A-1的计算方法 89

6.2　吸收法 93

6.3　混合模型方程组的迭代求解 97

6.3.1　经典的迭代方法 98

6.3.2　间接解法 99

6.3.3　向动物模型的推广 101

第七章 多性状的BLUP方法 103

7.1　概述 103

7.2　HENDERSON的近似方法 106

7.3　数据转换 112

7.4 关于BLUP法的结语 113

第八章 方差组分估计方法—Ⅰ 115

8.1　一般基础知识 115

8.1.1　数量遗传学基础 115

8.1.2　统计学基础 116

8.2.1　利用半同胞记录估计方差组分 117

8.1.3　二次型的一些基本性质 117

8.2　随机模型下的方差组分估计 117

8.2.2　利用全同胞—半同胞记录通过ANOVA估计方差组分 127

8.2.3　由亲子比较估计方差参数 130

8.2.4　由选择试验估计实现遗传相关 132

8.3　方差组分估计新方法概述 133

8.3.1　用任意二次型进行方差组分的无偏估计 133

8.3.2　用约化平方和估计方差组分 135

8.4　方差组分估计步骤及估计值的性质 143

8.4.1　方差组分估计的一般步骤 143

8.4.2　方差组分估值的性质 143

第九章 方差组分估计方法—Ⅱ 146

9.1　HENDERSON方法Ⅰ 146

9.1.1　基本方法 146

9.1.2　举例 148

9.2　HENDERSON方法Ⅱ 151

9.2.1　基本方法 151

9.2.2　理论推导 151

9.2.3　举例 154

9.3　HENDERSON方法Ⅲ 157

9.3.1　基本方法 157

9.3.2　举例 159

9.4　HENDERSON方法Ⅳ及其他类似的方法 161

9.5　MINQUE和MIVQUE 163

9.5.1　MINQUE估计方程的理论推导 164

9.5.2　通过混合模型方程组求MINQUE 166

9.5.3　举例 171

9.6　ML法和REML法 172

9.6.1　最大似然法的一般原理 172

9.6.2　ML法 175

9.6.3 REML法 180

9.6.4　举例 183

9.6.5　加快迭代收敛速度的方法—CIA 185

9.7　MINQUE、ML和REML的比较 187

第十章 协方差组分估计 189

10.1　两个随机效应间的协方差 189

10.1.1 MINQUE 190

10.1.2　REML 190

10.2　性状间的协方差 190

10.2.1　第一种情形 191

10.2.2　第二种情形 193

10.2.3　第三种情形 194

10.3　关于方差和协方差组分估计的结语 199

参考文献 201