生物化学 第2版PDF电子书下载

1．生物化学与细胞 1

1.1 生物分子 1

目录 1

1.1.1 蛋白质 2

1.1.2 糖 2

1.1.3 核酸 3

1.1.4 脂 3

1.2 生物化学反应 3

1.3 细胞 4

1.3.1 细胞的分子组织层次 4

1.3.2 原核细胞 4

1.3.3 真核细胞 5

思考题 7

习题 7

术语 7

小结 7

2．氨基酸和肽 9

2.1 氨基酸结构和分类 9

2.1.1 氨基酸结构 9

2.1.2 氨基酸分类 12

2.2 氨基酸的酸碱特性 14

2.3 氨基酸的特征化学反应 17

2.3.1 氨基酸的α-氨基与茚三酮反应 17

2.3.2 氨基酸的α-氨基与2，4-二硝基氟苯反应 18

2.3.3 氨基酸的α-氨基与丹磺酰氯反应 18

2.3.4 氨基酸的α-氨基与苯异硫氰酸酯反应 18

2.4 肽 19

2.5.1 谷胱甘肽 20

2.5 天然存在的活性肽 20

2.5.2 催产素和加压素 21

2.5.3 胰岛素 21

2.5.4 阿斯巴甜 21

小结 22

术语 23

思考题 23

习题 23

3．蛋白质的三维结构 25

3.1 蛋白质结构的4个层次 25

3.2 肽平面 26

3.3 二级结构 28

3.3.1 α-螺旋 29

3.3.2 β-折叠 31

3.3.3 转角与环 32

3.4 胶原蛋白——另一种螺旋结构 33

3.5 三级结构 34

3.5.1 疏水相互作用 35

3.5.2 氢键和范德华力 36

3.5.3 共价交联和离子相互作用 36

3.6 蛋白质变性与复性 36

3.6.1 核糖核酸酶A变性与复性 37

3.6.2 肽酰脯氨酰顺-反异构酶和二硫键异构酶 38

3.6.3 分子伴侣 38

3.6.4 疯牛病 39

3.7 超二级结构和结构域 39

3.7.1 超二级结构 39

3.7.2 结构域 40

3.8.1 血红蛋白结构 41

3.8 四级结构 41

3.8.2 血红蛋白和肌红蛋白的氧合曲线 42

3.8.3 BPG和波尔效应 43

3.8.4 镰刀形细胞贫血病 45

3.9 抗体 46

小结 47

术语 48

思考题 48

习题 48

4．蛋白质研究技术 50

4.1 蛋白质的初步分离纯化 50

4.2 柱层析 51

4.2.1 凝胶过滤层析 52

4.2.2 离子交换层析 53

4.2.3 亲和层析 54

4.2.4 高压液相层析 54

4.3 电泳 55

4.3.1 SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳 55

4.3.2 等电聚焦电泳 57

4.3.3 双向电泳 58

4.4 蛋白质氨基酸序列分析 58

4.4.1 确定多肽链N末端和C末端氨基酸残基 59

4.4.2 测定氨基酸组成 59

4.4.3 Edman降解 60

4.4.4 多肽裂解和序列确定 61

4.5 肽的化学合成 62

习题 64

思考题 64

术语 64

小结 64

5．酶 66

5.1 酶的命名和分类 66

5.2 比活 68

5.3 活化能 69

5.4 活性部位 70

5.5 酶催化机制 72

5.5.1 酸碱催化 72

5.5.2 共价催化 73

5.5.3 靠近和定向效应 73

5.5.4 底物变形 74

5.6 米氏方程 74

5.6.1 米氏方程的推导 75

5.6.2 双倒数作图 76

5.7 可逆抑制作用 77

5.7.1 竞争性抑制 78

5.7.2 反竞争性抑制 79

5.7.3 非竞争性抑制 79

5.7.4 可逆酶抑制剂的临床应用 80

5.8 不可逆抑制作用 81

5.9 pH值对酶促反应速度的影响 82

5.10 酶原的激活 82

5.10.1 蛋白水解酶原的激活 82

5.10.2 血液凝固中的酶级联反应 83

5.11 别构酶 84

5.11.1 天冬氨酸转氨甲酰酶 85

5.11.2 底物协同结合模型 86

5.12 共价调节酶 87

5.14 抗体酶 88

5.13 同工酶 88

小结 89

术语 90

思考题 90

习题 90

6．辅酶和维生素 92

6.1 尼克酸 92

6.2 核黄素 94

6.3 泛酸 95

6.4 硫胺素 96

6.5 维生素B6 97

6.6 生物素 98

6.7 四氢叶酸 99

6.8 维生素B12 100

6.9 硫辛酸 101

6.10 维生素C 102

6.11 脂溶性维生素 103

6.11.1 维生素A 103

6.11.2 维生素D 104

6.11.3 维生素E 105

6.11.4 维生素K 105

小结 105

术语 106

思考题 106

习题 106

7．糖 108

7.1 单糖 108

7.1.1 醛糖系列 109

7.1.2 酮糖系列 110

7.2 单糖的环式结构 111

7.3 单糖的构象 113

7.4 单糖衍生物 113

7.4.1 磷酸糖 113

7.4.2 脱氧糖 114

7.4.3 氨基糖 114

7.4.4 糖醇 115

7.4.5 糖酸 115

7.4.6 糖苷 115

7.5 单糖的氧化还原反应 116

7.6 寡糖 117

7.6.1 麦芽糖 117

7.6.2 异麦芽糖 117

7.7 同多糖 118

7.7.1 贮存多糖——淀粉和糖原 118

7.6.3 纤维二糖 118

7.6.5 蔗糖 118

7.6.4 乳糖 118

7.7.2 结构多糖——纤维素和几丁质 120

7.8 杂多糖 122

7.8.1 肽聚糖 122

7.8.2 糖蛋白 124

7.8.3 蛋白聚糖 126

小结 127

术语 128

思考题 128

习题 128

8．脂和生物膜 129

8.1 脂肪酸 130

8.2 三酰甘油 132

8.3 甘油磷脂 134

8.4 鞘脂 137

8.5 类固醇 139

8.6 前列腺素 140

8.7 生物膜组成和结构 141

8.7.1 膜基本结构——脂双层 141

8.7.2 流动镶嵌模型 142

8.7.3 膜蛋白 142

8.8 膜的流动性 145

8.8.1 膜脂的侧向运动 145

8.8.2 相转换温度 146

8.8.3 膜蛋白的侧向扩散 147

8.10 跨膜转运 148

8.9 生物膜的分离 148

8.10.1 被动转运（易化扩散） 149

8.10.2 主动转运 151

8.10.3 胞吞和胞吐 153

小结 153

术语 154

思考题 154

习题 154

9．核酸 156

9.1 核酸的基本结构 156

9.1.1 嘌呤和嘧啶 157

9.1.2 核苷 159

9.1.3 核苷酸 160

9.1.4 DNA和RNA 162

9.2 DNA——遗传信息载体 164

9.3 DNA碱基组成——查格夫法则 166

9.4 DNA双螺旋结构 167

9.5 其他类型DNA双螺旋 171

9.6 DNA超螺旋 171

9.7 染色质 173

9.8 几种类型RNA 175

9.9 核酸变性、复性和杂交 176

9.9.1 变性、复性 176

9.9.2 杂交 178

9.10 核酸酶 179

9.11 限制性内切酶 180

小结 181

习题 182

术语 182

思考题 182

10．DNA复制 183

10.1 DNA复制模式 183

10.1.1 半保留复制 184

10.1.2 双向复制 184

10.2 DNA聚合酶 185

10.3 DNA复制 187

10.3.1 起始 187

10.3.2 延伸 188

10.3.3 终止 190

10.4 真核生物DNA的复制 191

10.5 其他复制方式 192

10.5.1 滚环复制 192

10.5.2 D-环复制 193

10.6 逆转录 194

10.7 DNA修复 195

10.7.1 直接修复 195

10.7.2 核苷酸切除修复 196

10.7.3 碱基切除修复 197

10.7.4 错配修复 197

小结 198

术语 199

思考题 199

习题 199

11．RNA合成 200

11.1 转录概述 200

11.2 RNA聚合酶 201

11.4 转录延伸 202

11.3 转录起始 202

11.5 转录终止 203

11.6 转录抑制剂 204

11.6.1 放线菌素D 204

11.6.2 利福霉素 205

11.6.3 鹅膏蕈碱 205

11.7 初始转录RNA的加工 205

11.7.1 mRNA的加工 205

11.7.2 rRNA的加工 208

11.7.3 tRNA的加工 211

11.8 转录调控 211

11.8.1 原核生物基因表达的转录调控 211

11.8.2 真核生物基因表达的转录调控 215

小结 219

习题 220

术语 220

思考题 220

12．蛋白质合成 221

12.1 遗传密码 222

12.2 tRNA 225

12.2.1 tRNA的三维结构 225

12.2.2 “摆动”假说 226

12.3 氨酰-tRNA的合成 228

12.4 核糖体 230

12.5 肽链的起始 232

12.5.1 翻译起始位点 232

12.5.2 起始tRNA分子 233

12.5.3 起始复合物的组装 233

12.6 肽链的延伸 234

12.7 肽链的终止 237

12.8 蛋白质修饰和定位 238

12.9 蛋白质合成的抑制剂——抗生素和毒素 238

小结 240

术语 240

思考题 240

习题 240

13．核酸研究技术 242

13.1 核酸电泳 242

13.2 DNA序列测定 243

13.3 聚合酶链式反应（PCR） 244

13.4 重组DNA技术 245

13.5 外源蛋白的表达 248

习题 249

思考题 249

小结 249

术语 249

14．代谢导论 251

14.1 分解代谢与合成代谢 252

14.2 代谢途径的区室化 254

14.3 代谢调控 254

14.4 热力学原理 255

14.5 高能化合物与偶联反应 256

14.6 酰基转移反应 258

14.7 氧化还原反应 259

小结 262

术语 262

思考题 262

习题 262

15．糖酵解 264

15.1 糖酵解途径概述 265

15.2 糖酵解的10步反应 266

15.3 丙酮酸的代谢命运 274

15.3.1 乙醇发酵 274

15.3.2 乳酸发酵（Cori循环） 275

15.4 糖酵解的调控 276

15.5 巴斯德效应 278

15.6 3种单糖代谢 278

15.6.1 果糖 279

15.6.2 半乳糖 279

15.6.3 甘露糖 280

小结 280

习题 281

思考题 281

术语 281

16．柠檬酸循环 282

16.1 丙酮酸转化为乙酰CoA 282

16.2 柠檬酸循环概述 284

16.3 柠檬酸循环的8步反应 286

16.4 柠檬酸循环产生的能量 290

16.5 柠檬酸循环的调控 292

16.6 柠檬酸循环——两用代谢途径 293

16.7 乙醛酸循环 294

小结 295

术语 296

思考题 296

习题 296

17.1 糖原降解 297

17．糖原代谢、糖异生和磷酸戊糖途径 297

17.2 糖原合成 299

17.3 糖异生 300

17.3.1 旁路Ⅰ：丙酮酸转化为磷酸烯醇式丙酮酸 301

17.3.2 旁路Ⅱ：果糖-1，6二磷酸水解生成果糖-6-磷酸 301

17.3.3 旁路Ⅲ：葡萄糖-6-磷酸水解生成葡萄糖 302

17.3.4 底物循环 303

17.3.5 葡萄糖—丙氨酸循环 303

17.4 戊糖磷酸途径 304

17.4.1 氧化阶段反应 305

17.4.2 非氧化阶段反应 305

小结 306

习题 307

思考题 307

术语 307

18．电子传递和氧化磷酸化 308

18.1 电子传递和氧化磷酸化概述 309

18.2 线粒体 310

18.3 电子传递 310

18.3.1 复合物Ⅰ将来自NADH的电子传递给泛醌 312

18.3.2 复合物Ⅱ将电子由琥珀酸转移到CoQ 314

18.3.3 复合物Ⅲ将电子由CoQH2传给细胞色素c 314

18.3.4 复合物Ⅳ将电子从细胞色素c传给O2 315

18.4 氧化磷酸化 316

18.5 化学渗透假说 317

18.6 穿梭机制 319

18.6.1 甘油磷酸穿梭 319

18.6.2 苹果酸-天冬氨酸穿梭 320

小结 321

术语 321

思考题 321

习题 322

19．光合作用 323

19.1 叶绿体和光合色素 323

19.2 光系统 326

19.3 光反应 328

19.3.1 光系统Ⅱ：裂解水 328

19.3.2 光系统Ⅰ：生成NADPH 329

19.3.3 循环电子传递 330

19.3.4 光合磷酸化 331

19.4 暗反应 332

19.4.1 Calvin循环 332

19.4.2 Calvin循环的调控 334

19.5 光呼吸 335

19.6 C4途径 337

小结 338

术语 339

思考题 339

习题 339

20．脂代谢 340

20.1 脂肪动员和降解 340

20.2 甘油的命运 341

20.3 脂肪酸β-氧化 342

20.3.1 脂肪酸激活 342

20.3.2 脂酰CoA转运 343

20.3.3 脂肪酸β-氧化 344

20.3.4 脂肪酸氧化产生的能量 345

20.4 奇数碳脂肪酸的氧化 347

20.5 不饱和脂肪酸的氧化 348

20.6 酮体 350

20.6.1 酮体合成 350

20.6.2 酮体氧化 351

20.7 脂肪酸的生物合成 351

20.7.1 乙酰CoA的转运 352

20.7.2 丙二酸单酰CoA合成 352

20.7.3 脂肪酸合成 353

20.8 脂肪酸链的延长和去饱和 357

20.9 其他脂的生物合成 358

20.9.1 三酰甘油和磷脂的合成 358

20.9.2 鞘脂的合成 360

20.9.3 胆固醇的合成 360

术语 363

小结 363

思考题 364

习题 364

21．氨基酸代谢 365

21.1 转氨作用 365

21.2 脱氨作用 367

21.3 氨的转运 367

21.4 尿素循环 369

21.4.1 氨甲酰磷酸的合成 370

21.4.2 尿素循环 371

21.5 氨基酸碳骨架的降解 373

21.6 氨基酸的生物合成 375

21.6.1 生物固氮 375

21.6.3 氨基酸的生物合成 377

21.6.2 氨载体——谷氨酸和谷氨酰胺 377

21.6.4 其他氨基酸衍生物的合成 378

小结 380

术语 381

思考题 381

习题 381

22．核苷酸代谢 382

22.1 磷酸核糖焦磷酸的合成 382

22.2 嘌呤核苷酸的合成 383

22.2.1 从头合成——IMP的合成 383

22.2.2 AMP和GMP的合成 385

22.2.3 补救途径 386

22.3 嘧啶核苷酸的合成 387

22.3.1 UMP的合成 387

22.4 脱氧核糖核苷酸的合成 389

22.3.2 CTP的合成 389

22.5 嘌呤核苷酸的降解 391

22.5.1 AMP和GMP的降解 391

22.5.2 痛风 392

22.5.3 嘌呤核苷酸循环 394

22.6 嘧啶核苷酸的降解 394

小结 395

术语 396

思考题 396

习题 396

23．激素与代谢调控 397

23.1 内分泌腺与激素的分泌 397

23.2 激素的分类 398

23.3.1 cAMP 400

23.3 第二信使 400

23.3.2 肌醇三磷酸和二酰甘油 401

23.4 酪氨酸激酶 402

23.5 类固醇类激素作用机制 403

23.6 代谢中的激素调控 403

23.6.1 胰高血糖素 404

23.6.2 肾上腺素 405

23.6.3 胰岛素 405

小结 406

术语 406

思考题 406

习题 406

索引 408

参考文献 418