微生物法医学：理论与技术PDF电子书下载

第一节 微生物法医学的发展 1

第一章 微生物法医学 1

第二节 微生物法医学的任务 3

一、证据调查 3

二、生物犯罪中微生物的检验与鉴定 3

三、追踪微生物的来源 6

四、调查研究 7

五、教育培训与通讯 7

第三节 微生物法医学的未来发展 7

一、质量保证（QA）与质量控制（QC）标准的发展 7

二、微生物基础数据库的标准设计与建立 7

三、高水平检验鉴定队伍的培养与组织指挥体系的建立 8

四、重点科研领域的支持 8

参考文献 8

第一节 高通量实验室硬件建设 9

第二章 高通量实验室的建立 9

一、高通量实验室的特点 10

二、高通量实验室的工作内容 10

三、高通量实验室的设施与装备 11

第二节 高通量实验室的软件建设 14

一、实验室认可 14

二、实验室信息管理系统 16

第三节 高通量实验室的质量保证 17

参考文献 18

第三章微生物法医学技术支撑 19

第一节 证据调查 19

一、行之有效的预案的建立 19

二、第一反应者任务的落实与持续培训 20

三、及时的采样与标本的正确运输 20

六、成立一个永久的微生物专家组，为法律的实施开展咨询工作 21

七、发展标准的操作程序，避免样品的意外损毁 21

五、建立各交叉学科间的持久交流与培训计划 21

四、证据调查要及时、记录要完整 21

第二节 计算机网络和基础数据库建设 22

一、计算机网络建设 22

二、基础数据库建设 23

第三节 微生物的鉴定与溯源技术体系 24

一、检验、鉴定程序与技术体系 24

二、溯源技术体系 30

三、生物犯罪中使用微生物生物工程特性的检测 33

第四节 分型技术的基本要求 34

一、分辨力 34

二、重复性 34

三、分型性 34

四、简便性 34

参考文献 35

一、生化反应 36

第一节 生物型分析技术 36

第四章 表型分析技术 36

二、生理试验 37

三、细菌素（bactericin）分型 37

四、生物型报告方法 38

五、优缺点 38

六、应用 39

第二节 生化谱分析技术 39

一、原理 39

二、操作 40

三、优缺点 43

四、应用 43

第三节 表型微点阵技术 44

一、原理 44

二、操作 45

三、优缺点 45

四、表型微点阵的应用 47

二、噬菌体的分离、纯化与增殖技术 48

一、对细菌进行噬菌体分型的基本要求 48

第四节 噬菌体分型分析技术 48

三、噬菌体的效价和裂解谱的测定 50

四、细菌的噬菌体分型方法 51

五、噬菌体分型的优缺点 52

第五节 药物敏感性试验 52

一、耐药性产生的机制 53

二、药物敏感性试验的方法 53

三、各种微生物的药物敏感性试验 57

四、药物敏感性流行病学 59

第六节 血清学分析技术 60

一、凝集反应 60

二、血清学分型的应用 60

三、血清学方法的优缺点 62

一、原理 63

二、操作 63

第七节 LPS谱分析 63

三、优缺点 64

四、应用 64

第八节 PAGE／免疫印迹分析技术 65

一、蛋白质免疫印迹的基本流程 65

二、蛋白质免疫印迹技术的实验步骤 65

三、免疫印迹技术关键点 69

四、免疫印迹技术优缺点 69

五、PAGE／免疫印迹技术的应用 69

第九节 多位点酶电泳分析技术 71

一、原理 72

二、方法 72

三、优缺点 76

四、应用 76

参考文献 77

第一节 微生物DNA多态性的演化及其分析技术 80

一、微生物基因组 80

第五章 核酸指纹分析技术 80

二、微生物基因组的分子进化 83

三、遗传多态性分析技术 90

第二节 质粒指纹图分析技术 92

一、基本原理 92

二、质粒指纹图分析的基本方法 93

三、质粒指纹图谱技术的优缺点 95

四、质粒指纹图谱技术的应用 95

第三节 核酸探针杂交分型技术 98

一、原理 98

二、操作步骤 99

三、优缺点 105

四、应用 106

第四节 随机扩增多态性DNA分析技术 108

一、原理 109

二、方法 110

三、RAPD方法的评价 114

四、应用 116

五、展望 120

第五节 rep-PCR分析技术 121

一、简介 121

二、材料 122

三、方法 124

四、注意事项 127

第六节 限制性核酸片段多态性分析技术（RFLP） 128

一、限制性核酸片段多态性分析基本原理 128

二、限制性核酸片段多态性分析RFLP的基本方法 128

三、RFLP技术的特点 131

四、RFLP技术的应用 131

五、RFLP技术的展望 132

六、PCR-RFLP分析技术 133

第七节 间区寡核苷酸分型分析技术 138

一、原理 138

二、试验方法 139

三、优缺点 141

四、应用 141

第八节 脉冲场凝胶电泳 144

一、PFGE的技术原理 144

二、脉冲场凝胶电泳用于细菌分型的原理 146

三、PulseNet简介 149

四、PFGE在微生物法医学中的应用 152

五、PFGE应用展望 153

第九节 AFLP分析技术 154

一、AFLP的基本原理 154

二、AFLP的操作过程 155

三、优缺点 157

四、应用 158

第十节 SNP分析技术 159

一、新SNP的鉴定 160

二、SNP分型技术 161

第十一节 多位点序列分型技术 167

一、原理 167

二、操作 168

三、优缺点 169

四、应用 170

第十二节 VNTR/MLVA分析技术 172

一、VNTR/MLVA的应用原理 172

二、VNTR的研究方法 174

三、以VNTR为基础的菌株分型研究 177

第十三节 病毒的基因分型及核酸指纹图谱技术在病毒分型中的应用 182

一、病毒的血清型和基因型 182

二、核酸指纹图分析法及其在病毒基因分型中的应用 183

三、其他病毒基因分型法概述 185

四、几种重要病毒的基因分型及所采用的基因分型方法 191

参考文献 194

一、原理 199

第一节 脂肪酸分析技术 199

第六章 化学分析技术 199

二、气相色谱分析方法 200

三、结果解析 202

四、应用实例 204

五、展望 206

第二节 质谱质量指纹图技术 208

一、质谱的发展历史 208

二、原理与方法 209

三、应用 215

四、发展与展望 229

第三节 细菌红外光谱分析技术 231

一、红外光谱测定原理 231

二、实验方法 231

三、分类鉴别方法与应用 232

参考文献 232

一、DNA芯片（微点阵） 234

第七章 生物芯片分析技术 234

第一节 DNA芯片技术 234

二、DNA芯片技术在微生物法医学上的应用 235

第二节 蛋白质芯片 243

一、蛋白质芯片的制备 244

二、蛋白质芯片在微生物法医学中的应用 248

三、其他方面的应用 249

四、蛋白质芯片检测SARS冠状病毒特异性抗体 250

参考文献 251

第八章 基因组学分析 252

第一节 细菌基因组概述 252

一、基因组大小 252

二、编码密度高 260

三、基因组拓扑结构 260

四、原噬菌体（Prophages）和隐性原噬菌体（Cryptic Prophages） 261

五、插入序列（insertion sequence,IS）和转座子（transposons） 261

六、DNA链组成的不对称性 262

七、基因组重排 264

八、原核生物基因组的（G+C）含量 264

第二节 全基因组鸟枪法测序 265

一、基因组DNA提取 266

二、文库构建 266

三、大规模培养、质粒提取、测序 268

四、序列拼接 269

五、完成图的绘制 269

六、完成图的验证 271

第三节 基因组功能注释及比较基因组学分析 272

一、碱基组成分析 272

二、RNA基因的预测 273

三、重复序列 273

四、蛋白编码基因的预测和组功能注释 274

七、比较基因组学分析 280

六、序列发布和递交（GenBank） 280

五、运用Artemis软件人工注释 280

第四节 基因组学在生物恐怖及不明原因突发性疾病中的应用 281

一、基因组分析在1999年美国东北部脑膜炎流行的病原体——西尼罗河病毒研究中的应用 282

二、基因组分析在炭疽生物恐怖中的应用 282

三、基因组学分析在SARS防治中的应用 283

四、比较基因组学在鼠疫耶尔森菌的基因组分型和菌源追踪的应用 284

参考文献 289

第九章 蛋白质组学方法的应用 292

第一节 蛋白质组简介 292

第二节 蛋白质组学研究方法 293

第三节 蛋白质组学研究方法在微生物法医学中的应用 307

参考文献 310

第十章 生物信息学分析技术 311

第一节 生物信息学简介 311

一、生物信息学概念 311

二、生物信息学的研究对象 312

三、生物信息学的研究目标和任务 313

四、生物信息学的研究内容 314

第二节 微生物法医学中的生物信息学技术 318

一、数据库建设和维护 318

二、序列比较 319

三、系统进化树构建 322

第三节 生物信息学资源 327

一、因特网数据库资源 327

二、生物信息学分析软件 331

参考文献 332

第十一章 微生物介质分析 333

第一节 微生物介质的特点与采集 333

一、微生物介质的定义 333

二、微生物介质的特点 333

三、微生物介质的采集、包装和运输 333

一、微生物介质的分析内容及其对微生物法医学调查的意义 335

第二节 微生物介质的分析 335

二、微生物介质分析手段的要求 336

三、微生物介质分析的常用方法 337

参考文献 340

第十二章 稳定同位素技术 341

第一节 稳定同位素技术的原理和基本概念 341

一、稳定同位素技术的原理 341

二、稳定同位素技术的几个基本概念 341

二、自动分析仪器简介 344

第二节 稳定同位素分析方法 344

一、传统的稳定同位素分析方法 344

第三节 稳定同位素技术的优缺点及应用 346

一、稳定同位素技术的优缺点 346

二、稳定同位素技术的应用 347

三、稳定同位素技术在微生物法医学中的应用探讨 348

参考文献 349

附录 微生物法医学实验室质量保证指南 350