现代生物化学与分子生物学研究技术PDF电子书下载

1 测序技术 1

1.1 第一代测序技术 2

1.2 第二代测序技术 3

1.2.1 第二代测序方法及原理 3

1.2.2 第二代测序技术的运行平台 7

1.3 第三代测序技术 14

1.3.1 第三代测序方法及原理 14

1.3.2 第三代测序系统 16

1.4 其他研发中的测序方法 20

1.4.1 基于溶液的杂交测序 20

1.4.2 隧道电流DNA测序 20

1.4.3 显微镜为基础的DNA测序 21

1.4.4 质谱为基础的DNA测序 21

1.4.5 RNA聚合酶测序 21

1.5 测序技术的应用 25

参考文献 29

2 宏基因组技术 32

2.1 宏基因组与宏基因组学 32

2.2 宏基因组研究的主要技术流程 34

2.2.1 功能宏基因组研究技术流程 34

2.2.2 序列宏基因组研究技术流程 39

2.3 宏基因组技术的特点 41

2.4 宏基因组技术的应用及发展趋势 42

2.4.1 应用 42

2.4.2 发展趋势 51

参考文献 52

3 新型靶向基因组编辑技术 60

3.1 锌指核酸酶 60

3.1.1 ZFN的结构和作用原理 61

3.1.2 ZFN的构建策略 63

3.2 转录激活因子样效应物核酸酶 67

3.2.1 TALEN的结构和作用原理 67

3.2.2 TALEN的构建策略 69

3.3 CRISPR-Cas系统 74

3.3.1 CRISPR-Cas系统的发现历程 74

3.3.2 细菌获得性免疫系统CRISPR-Cas的自然作用机制 78

3.3.3 CRISPR-cas位点的分类 80

3.3.4 Cas9蛋白的结构与功能机制 82

3.3.5 基因组编辑工具CRISPR-Cas9 84

3.4 新型靶向基因组编辑技术的应用 90

3.4.1 新型靶向基因组技术的主要应用领域 90

3.4.2 新型基因组编辑技术在靶向编辑CCR5治疗HIV中的应用 92

参考文献 95

4 分子标记技术 104

4.1 早期标记法——生化标记 105

4.2 基于DNA水平的标记技术 105

4.2.1 RFLP标记技术 106

4.2.2 RAPD标记技术 107

4.2.3 AFLP标记技术 108

4.2.4 多样性微阵列技术 109

4.2.5 STS标记技术 109

4.2.6 SRAP标记技术 110

4.2.7 以EST技术为基础的分子标记技术 112

4.2.8 SSR标记技术 114

4.2.9 单核苷酸多态性标记技术 115

4.3 其他新型分子标记技术 117

4.3.1 RGA标记？ 117

4.3.2 染色体原位杂交 117

4.4 分子标记技术的应用 118

参考文献 123

5 表观遗传技术 125

5.1 表观遗传现象 125

5.1.1 DNA甲基化 125

5.1.2 组蛋白修饰 127

5.1.3 染色质重塑 129

5.2 表观遗传学研究技术 130

5.2.1 Southern印迹杂交 130

5.2.2 基于甲基化敏感限制性技术 130

5.2.3 亚硫酸氢盐介导的DNA转化 133

5.2.4 结合亚硫酸氢盐限制性分析 136

5.2.5 甲基化特异性PCR 136

5.2.6 实时MSP和荧光定量法 137

5.2.7 焦磷酸测序 137

5.2.8 MassARRAY？ 138

5.2.9 限制性界标性基因组扫描 138

5.2.10 染色质免疫沉淀法 139

5.2.11 甲基化特异性数字染色体核型分析 140

5.2.12 质谱分析 141

5.2.13 甲基化CpG岛复苏法 143

5.3 表观遗传的信息学 149

5.3.1 ChIP与芯片结合技术 149

5.3.2 ChIP-Seq技术 151

参考文献 153

6 冷冻电镜技术 157

6.1 电子显微镜三维分子成像技术的发展历史 157

6.2 冷冻电镜技术解析生物大分子结构的原理 158

6.2.1 冷冻电镜技术解析生物大分子结构的主要原理 158

6.2.2 冷冻电镜的三维重构技术 159

6.2.3 冷冻电镜技术的主要技术突破 160

6.2.4 冷冻电镜技术解析生物大分子结构的独特优势 162

6.3 冷冻电镜技术的应用及发展趋势 163

6.3.1 冷冻电镜技术的应用 163

6.3.2 冷冻电镜技术的发展趋势 172

参考文献 173