肽：化学与生物学PDF电子书下载

1 绪论 1

参考文献 3

2 基本化学结构准则 4

2.1 肽键的定义和主要构象特征 4

2.2 构建单元、分类及命名法 5

2.3 肽与蛋白质的共价结构分析 9

2.3.1 分离与纯化 9

2.3.2 一级结构确定 15

2.4 三维结构 27

2.4.1 二级结构 27

2.4.2 三级结构 32

2.5 结构分析方法 36

2.5.1 圆二色谱 36

2.5.2 红外光谱 37

2.5.3 NMR谱 38

2.5.4 X射线晶体学 39

2.5.5 紫外荧光光谱 40

参考文献 41

3 生物活性肽 45

3.1 现状与生物学作用 45

3.2 生物合成 54

3.2.1 核糖体合成 54

3.2.2 翻译后修饰 56

3.2.3 非核糖体合成 66

3.3.1 肽与蛋白类激素 68

3.3 重要的生物活性肽家族 68

3.3.2 神经肽 81

3.3.3 肽类抗生素 91

3.3.4 肽类毒素 97

参考文献 100

4 肽合成 104

4.1 原理与目的 104

4.1.1 肽合成的主要目标 104

4.1.2 肽键形成的基本原理 107

4.2.1 Nα-氨基保护 109

4.2 官能团的保护 109

4.2.2 Cα-羧基的保护 118

4.2.3 C端与骨架Nα-酰胺保护 123

4.2.4 侧链保护 124

4.2.5 对酶敏感的保护基 138

4.2.6 保护基的匹配 141

4.3 肽键的形成 141

4.3.1 酰基叠氮物法 142

4.3.2 酸酐法 143

4.3.3 碳二亚胺法 147

4.3.4 活化酯法 150

4.3.5 酰卤法 153

4.3.6 磷鎓盐试剂法 154

4.3.7 脲鎓试剂法 155

4.3.8 其他特殊方法 156

4.4 肽合成中的消旋化 157

4.4.1 直接烯醇化机制 157

4.4.2 5(4H)-噁唑酮机制 158

4.4.3 消旋的检测：立体化学产物分析 159

4.5 固相肽合成(SPPS) 160

4.5.1 固相载体和连接臂 162

4.5.2 变构保险连接臂 169

4.5.3 保护策略 172

4.5.4 肽链的延长 175

4.5.5 固相肽合成的工艺自动化 179

4.5.6 特殊方法 180

4.5.7 肽树脂的裂解 181

4.5.8 线性固相肽合成实例 182

4.6 生物化学合成 183

4.6.1 重组DNA技术 183

4.6.2 酶促肽合成 189

4.6.3 抗体催化形成肽键 194

参考文献 196

5 肽和蛋白质的合成理念 208

5.1 策略与战术 208

5.1.1 线性或逐步合成 208

5.1.2 片段缩合或收敛式合成 210

5.1.3 策略考虑 211

5.2 液相合成 213

5.2.1 最大保护片段的收敛式合成 214

5.2.2 最小保护片段的收敛式合成 218

5.3 多聚物载体上的最佳策略 221

5.3.1 逐步延长的固相肽合成 221

5.3.2 收敛式固相肽合成 223

5.3.3 相变化合成 226

5.3.4 可溶性把手方法 226

5.4 未保护肽片段的连接 228

5.4.1 主干修饰连接 229

5.4.2 优先捕获介导的连接 230

5.4.3 生物化学蛋白质连接 235

参考文献 238

6 特殊肽以及肽结合物的合成 242

6.1 环肽 242

6.1.1 主链环合(头-尾环合) 243

6.1.3 侧链-侧链环合反应 248

6.1.2 侧链-头以及尾-侧链的环合反应 248

6.2 胱氨酸肽 249

6.3 糖肽 251

6.4 磷酸肽 256

6.5 脂肽(lipopeptide) 259

6.6 硫酸酯肽 260

参考文献 261

7 肽及蛋白质设计，假肽和肽模拟物 264

7.1 肽设计 265

7.2.1 侧链修饰 268

7.2 结构修饰肽 268

7.2.2 骨架修饰 271

7.2.3 组合修饰(球形限制)法 273

7.2.4 二级结构模拟物的修饰 274

7.2.5 过渡态抑制剂 275

7.3 肽模拟物 276

7.4 伪生物聚合物 278

7.4.1 类肽 279

7.4.2 肽核酸 280

7.4.3 β肽、肼基肽、氨氧基肽及寡聚磺酰胺类 281

7.4.5 寡聚吡咯啉酮类 283

7.4.4 寡聚氨基甲酸酯类 283

7.5 多肽、大肽及蛋白质的从头设计 284

7.5.1 蛋白质设计 284

7.5.2 多肽枝聚物 288

7.5.3 多肽聚合物 290

参考文献 291

8 组合多肽合成 297

8.1.1 茶袋法 299

8.1 平行合成 299

8.1.2 聚乙烯树脂针上的合成(多针合成) 300

8.1.3 单一化合物在纤维素或聚合物带上的平行合成 301

8.1.4 光导和空间定位的平行合成 302

8.1.5 可溶性聚合载体上的液相合成 303

8.2 混合物合成 304

8.2.1 混合试剂法 304

8.2.2 均分组合法 304

8.2.3 编码方法 306

8.2.4 肽库迭代 309

8.2.5 肽库合成的生物方法 310

参考文献 312

9 多肽和蛋白质的应用 315

9.1 蛋白质药物 315

9.1.1 重要性与来源 315

9.1.2 内源性蛋白质药物 315

9.1.3 治疗用蛋白质工程 317

9.2 大规模肽合成 321

9.3 肽类药物 325

9.3.1 肽类药物与候选药物 325

9.3.2 肽类药物转运系统 327

9.3.3 肽作为药物发现中的工具 329

参考文献 332

缩写及中英文名称 335

词汇表 367

索引 474

氨基酸名称、结构式、三字母及单字母缩写 495