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目录 1

第一章 系统生物学与进化研究及其有关学科的关系 1

第一节 系统生物学及其发展 1

第二节 关于生命起源的问题 6

第三节 动物进化的例证 7

一、比较解剖学的例证 7

二、胚胎学的例证 7

三、古生物学的例证 8

四、动物地理学的例证 9

五、生理、生化的例证 13

六、遗传学例证 17

七、返祖现象和形态特征演化的例证 18

第四节 进化原因的探讨——进化理论 18

一、达尔文的进化理论 19

二、进化的动因——自然选择 20

第五节 动物进化规律和进化谱系 22

第六节 动物地理区划与海洋渔区划分 26

一、动物的分布 26

二、世界及我国陆地动物地理区系划分 28

三、世界海洋渔区的划分与产量分布 30

第七节 动物生态学与环境概要 34

一、动物生态学 34

二、环境保护 35

复习题 36

参考文献 37

第二章 系统原理与生物系统 39

第一节 系统原理 40

一、什么是系统原理 40

二、起源与发展的关系 42

三、连续性与间断性的统一 43

第二节 生物的一级分类系统 43

二、三界系统 44

一、两界系统 44

三、四界系统 45

四、五界系统 46

五、六界系统 46

复习题 47

参考文献 48

第三章 系统生物学的发展与分支系统学 49

第一节 系统生物学的发展 49

第二节 系统生物学内部学派的争论 51

一、传统进化系统学派 52

二、表相学派 52

三、支序系统学派 53

第三节 分支系统学的原理与方法 58

一、Hennig分支系统学（支序系统学）的基本原理 58

二、单系、并系和复系 59

三、姐妹群与特征镶嵌 66

一、使用外类群法 68

第四节 特征分析 68

二、有关资料的收集 69

三、特征分析的要点 71

四、特征分析的事例（三种方法的介绍） 73

五、不可混淆的问题 81

复习题 84

参考文献 85

第四章 物种概念与物种形成和保护 86

第一节 物种概念 86

第二节 亚种分化 89

第三节 物种形成 90

一、生殖隔离的因素 90

二、物种形成的方式 91

三、隔离机制与物种形成 91

四、物种的真实性 92

第四节 物种的生殖属性和表型属性的关系 94

第五节 物种多样性保护的研究 95

二、物种生物多样性分析 98

一、物种多样性研究程序 98

三、物种多样性保护的编目程序和原则 100

第六节 物种濒危等级 102

一、濒危等级划分的标准 102

二、国际贸易公约（CITES）附录等级标准的扼要说明 109

三、物种保护的优先原则 110

复习题 115

参考文献 115

第五章 支序系统学与生物地理学 117

第一节 生物地理学的理论基础 117

一、生物区系及特征种类 117

二、扩散概念 118

三、起源中心 118

四、隔离分化 119

一、传统的演化生物地理学（evolutionary biogeogrophy） 120

第二节 生物地理学的重大变革 120

二、系统发育生物地理学（Phylogenetic biogeography） 121

三、隔离分化生物地理学 123

四、Rosen（1979）对中美洲花鳉鱼类两属的分析 127

第三节 国内有关生物地理学的主要论述 131

一、河西阿拉善内流区的鱼类区系和地理区划 131

二、青海省可可西里地区与周邻水域的鱼类地理学关系 139

复习题 146

参考文献 146

第六章 生物化学在系统生物学中的应用 149

第一节 生物体内分子特征 149

第二节 关于核酸 150

一、细胞内DNA含量的比较 151

二、DNA中G·C含量的比较 152

三、DNA的杂交 153

第三节 关于蛋白质 154

四、DNA和RNA的杂交 154

一、血清反应 155

二、以电泳和层析法测定并绘制蛋白质的“轮廓” 157

三、蛋白质分子中氨基酸次序的测定 159

第四节 关于其他成分 159

一、游离氨基酸的层析 160

二、色素的分析 160

一、RAPD的原理及研究现状 162

第五节 现代分子生物学技术在系统生物学中的应用 162

二、现代分子生物学技术在系统生物学中的应用 163

第六节 PCR介导的DNA序列系统分析在系统动物学中的应用 168

一、PCR介导的DNA序列系统分析技术的优点 168

二、DNA序列系统分析的应用范围 170

三、有关PCR介导的DNA序列系统分析的争议 172

四、PCR介导的DNA序列系统分析的应用前景 173

第七节 本章小结 174

参考文献 178

复习题 178

附录Ⅰ 常见动物的主要特征 183

一、昆虫纲分类常用的主要特征 183

二、鱼纲（鲤形目鱼类代表）常用鉴别特征及其性状说明 191

三、两栖纲（Amphibia） 201

四、爬行纲（Reptilia） 208

五、鸟纲（Aves） 210

六、哺乳纲（Mammalia） 219

附录Ⅱ 常见植物的识别和鉴定 225

第一节 常见孢子植物的识别和鉴定 225

一、常见的藻类 225

二、常见的真菌 230

三、常见的地衣 231

四、常见的苔藓植物 232

五、常见的蕨类植物 232

第二节 常见种子植物的识别和鉴定 233