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Ⅰ 核酸的组分 1

1.1 核酸的化学组成 1

1.1.1 戊糖和脱氧戊糖的结构和构象性质 1

1.1.2 碱基的结构 17

1.1.3 磷酸基的几何形状与特性 41

1.1.4 核苷 47

1.1.5 核苷酸的构象性质 54

1.2 核酸组分构象性质小结 62

参考文献 63

Ⅱ 核酸的结构原理 65

2.1 核酸结构的多样性 65

2.1.1 核酸分子的结构形态 66

2.1.2 多聚核苷酸双螺旋的多态性 72

2.1.3 多聚核苷酸右手螺旋:A型和B型 75

2.1.4 天然DNA的构象 81

2.2 RNA的结构 82

2.2.1 RNA的一般结构特征 82

2.2.2 RNA的一级结构 84

2.2.3 RNA的二级结构 88

2.2.4 RNA的三级结构 103

2.2.5 RNA的折叠 110

2.2.6 mRNA与其编码的蛋白质在空间结构上的对应 113

2.2.7 具有催化功能的RNA 118

2.3 DNA的结构 122

2.3.1 DNA的一级结构(脱氧核糖核苷酸顺序) 122

2.3.2 DNA的二级结构 124

2.3.3 DNA的三级结构 137

2.3.4 三链和四链DNA结构 146

2.4.1 基因组测序计划 157

2.4 基因组物质结构和信息结构 157

2.4.2 基因组的初步分析 159

2.4.3 基因组物质结构和信息结构的几个问题 168

2.5 核酸的功能 171

2.5.1 核酸分子作为遗传信息载体的功能 172

2.5.2 作为酶的核酸 176

参考文献 177

Ⅲ 蛋白质结构原理 181

3.1 蛋白质组分的结构 181

3.1.1 氨基酸的立体结构 185

3.1.2 氨基酸的电子结构 197

3.1.3 氨基酸对蛋白质三维结构的影响 201

3.1.4 肽平面和构象角(扭转角) 204

3.2 蛋白质分子的一级结构 208

3.2.1 蛋白质的二级结构 210

3.2.2 蛋白质的三级结构 215

3.2.3 蛋白质的四级结构 220

3.3 蛋白质的折叠 226

3.3.1 蛋白质折叠的超始过程 228

3.3.2 折叠结构分析 232

3.3.3 蛋白质折叠的研究现状 237

3.4 蛋白质的运动 238

3.5 蛋白质运动的功能方面 247

3.5.1 由配体引起的构象变化 247

3.5.2 在催化过程中蛋白质的运动,核糖核酸酶 250

3.5.3 配体的进入和离开,肌红蛋白 251

3.6 蛋白质与遗传信息 252

参考文献 254

4.1 X射线单晶衍射分析(晶体结构分析) 258

Ⅳ 结构分子生物学研究技术 258

4.1.1 生物大分子晶体学方法的发展 259

4.1.2 晶体及其对X射线的衍射 260

4.1.3 X射线衍射结构分析法的基本原理 262

4.1.4 X射线衍射分析步骤 264

4.1.5 蛋白质和核酸晶体的X射线衍射结构分析 265

4.1.6 晶体结构的表达 271

4.2 核磁共振技术 272

4.2.1 核磁共振技术基础 273

4.2.2 多维核磁共振 278

4.2.3 核磁共振测定生物大分子的空间结构 283

4.3 扫描隧道显微(STM)技术 298

4.3.1 扫描隧道显微镜 301

4.3.2 STM的局限性与发展 303

4.3.3 STM在结构分子生物学研究中的应用 304

4.3.4 原子力显微镜(AFM) 314

4.4 结构分子生物学的基本数据和计算机分析 331

4.4.1 生物大分子的序列数据和计算机分析 331

4.4.2 生物大分子的立体结构 367

参考文献 369