动物育种中的统计计算 Julia语言应用PDF电子书下载

第一章 Julia语言使用说明 1

第一节 Julia语言简介 2

第二节 Julia语言基础 8

第二章 系谱数据处理方法 27

第一节 近交系数与亲缘系数 28

第二节 分子血缘相关矩阵及其逆矩阵计算 32

第三节 计算实例 43

第三章 动物遗传育种中的数据模拟 49

第一节 随机数和随机变量的产生 49

第二节 误差计算 51

第三节 使用Julia语言模拟数据 55

第四节 计算实例 62

第五节 基因组模拟软件XSim 65

第四章 线性模型的建立和求解 73

第一节 单因子模型 73

第二节 二因子模型 81

第三节 建立Henderson混合模型方程组 90

第五章 线性模型的扩展 105

第一节 有重复记录的动物模型 105

第二节 母体效应模型 116

第六章 多性状模型 121

第一节 多性状模型 122

第二节 Julia语言实现多性状模型 125

第三节 带有缺失数据的多性状模型 132

第七章 分子标记和多基因效应单性状模型 151

第一节 标记辅助选择 151

第二节 混合模型方程组的储存技术 154

第三节 Julia语言示例 165

第八章 MCMC算法 173

第一节 贝叶斯统计 173

第二节 Julia语言的实现 179

第三节 贝叶斯统计在多元线性模型中的应用 186

第四节 贝叶斯统计示例 192

第五节 多性状模型的Gibbs抽样 205

第六节 思考题解答 212

第九章 全基因组统计分析 221

第一节 基于Haseman-Elston回归的全基因组连锁分析 222

第二节 多元混合线性模型 234

第三节 贝叶斯GWAS 240

第四节 单步全基因组分析方法 246

第五节 GBLUP的准确性 250

第六节 Julia语言示例 254

第十章 附录 269

第一节 线性模型简介 271

第二节 基于系谱的混合线性模型 273

第三节 预测SNP效应的固定效应模型 276

第四节 结合有基因型和无基因型家畜数据 282

第五节 贝叶斯GWAS基础 287

第六节 统计基因组学基础 294