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第一章 数据整理与准备 1

第一节 数据的类型 1

一、名称数据 1

二、顺序属性数据 2

三、数量属性数据 3

第二节 数据预处理 3

一、数据简缩 4

二、数据转换 4

三、数据标准化 6

第三节 预处理的MATLAB实现 14

一、MakeExcelFileName函数 14

二、MakeExcelColumnName函数 15

三、OutputExcel函数 16

四、DataTransform函数 17

五、StandardizeData函数 19

第二章 多样性指数计算 25

第一节 物种多样性指数 25

一、α多样性指数 25

二、α多样性计算的MATLAB实现 31

三、β多样性指数 37

第二节 系统发育多样性 40

一、群落系统发育α多样性指数 40

二、群落系统发育β多样性指数 42

第三节 功能多样性 44

一、功能α多样性指数 45

二、功能β多样性指数 47

第三章 种间关系分析 49

第一节 种间关联 49

一、总体关联性分析 49

二、种对间关联性分析 51

三、种间关联计算的MATLAB实现 54

第二节 种间相关 61

一、Pearson相关系数 61

二、Spearman相关系数 63

第三节 种间分离 65

一、Pielou分离指数 66

二、Pielou分离指数的MATLAB实现 68

第四节 种间竞争 71

一、竞争强度 71

二、竞争指数的MATLAB实现 72

第四章 生态位 74

第一节 生态位测度计算 75

一、生态位宽度计算 75

二、生态位重叠指数 77

三、生态位分离 85

四、多物种生态位重叠指数 85

五、生态位重叠的应用 85

第二节 生态位计算的MATLAB实现 86

一、niche函数 86

二、WangOverlap函数 90

三、nobp函数 92

第五章 空间格局分析 93

第一节 种群分布类型及其判定 93

一、植物分布类型与模型描述 93

二、分布格局类型的验证 94

第二节 单种群格局规模分析 103

一、等级方差分析法 104

二、双项轨迹方差法 108

三、随机配对法 112

第三节 单种群格局纹理分析 118

一、斑块-间隙分析法 118

第四节 大尺度格局分析 123

一、趋势面分析 123

二、典范趋势面分析 131

第六章 排序 147

第一节 极点排序法 148

一、步骤 148

二、实例计算 149

三、极点排序法的MATLAB实现 151

第二节 主成分分析法 155

一、主成分分析概述 155

二、主成分分析排序步骤 156

三、实例计算 157

四、主成分分析的MATLAB实现 160

第三节 典范主成分分析法 164

一、原理与步骤 164

二、实例计算 165

三、典范主成分排序的MATLAB实现 168

第四节 主坐标分析法 171

一、原理与步骤 171

二、实例计算 173

三、主坐标分析的MATLAB实现 174

第五节 对应分析法 178

一、原理与步骤 178

二、实例计算 179

三、对应分析排序的MATLAB实现 181

第六节 修订型对应分析法 186

一、原理与步骤 186

二、实例计算 187

三、修订型CA/RA排序的MATLAB实现 190

第七节 除趋势对应分析法 193

一、原理与步骤 193

二、实例计算 194

三、除趋势对应分析的MATLAB实现 196

第八节 典范对应分析法 200

一、原理与步骤 200

二、实例计算 202

三、典范对应分析的MATLAB实现 206

第九节 除趋势典范对应分析法 213

一、原理与步骤 213

二、实例计算 213

三、除趋势典范对应分析的MATLAB实现 216

第七章 群落数量分类 222

第一节 相似的表达方法 222

一、仅适用于二元数据的相似关系 223

二、适用于二元数据和数量数据的相似关系 230

第二节 等级聚类法 235

一、等级聚类方法的步骤 235

二、几种常用的聚合策略 238

三、等级聚类分析的MATLAB实现 240

第三节 关联分析法 243

一、原理与步骤 243

二、实例计算 244

三、关联分析法的MATLAB实现 248

第四节 双向指示种分析法 254

一、原理与步骤 254

二、实例计算 255

三、双向指示种分析法的MATLAB实现 260

主要参考文献 272