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希金斯炭疽菌G蛋白信号途径绘制及相关蛋白生物信息学分析
希金斯炭疽菌G蛋白信号途径绘制及相关蛋白生物信息学分析

希金斯炭疽菌G蛋白信号途径绘制及相关蛋白生物信息学分析PDF电子书下载

农业科学

  • 电子书积分:8 积分如何计算积分?
  • 作 者:韩长志编著
  • 出 版 社:北京:中国林业出版社
  • 出版年份:2016
  • ISBN:9787503886522
  • 页数:134 页
图书介绍:本书针对目前学术界希金斯炭疽菌G蛋白信号途径系统性研究的空白,特别是在当前林下经济背景条件下,经济林木、花卉以及中药材等诸多植物炭疽病发生逐年增加的背景下,详细论述了希金斯炭疽菌G蛋白信号途径绘制,并对相关蛋白生物信息学进行了详细分析。本书出版为进一步开展同属于炭疽菌属但其基因组序列尚未公布的胶孢炭疽菌的研究提供重要的理论指导,也为实现林下经济背景下植物炭疽病的防治药剂的开发提供重要的新思路。
《希金斯炭疽菌G蛋白信号途径绘制及相关蛋白生物信息学分析》目录

第一章 希金斯炭疽菌的研究进展 1

一、经济危害及分布情况 1

(一)经济危害情况 1

(二)分布情况 2

二、形态特征及分类地位 2

(一)形态特征 2

(二)分类地位 3

三、生活史及侵染过程 3

四、遗传关系 7

五、防治措施 8

第二章 G蛋白信号途径相关蛋白介绍 10

一、GPCR 11

二、Gα、Gβ、Gγ以及PhLPS 13

(一)Gα、Gβ、Gγ 13

1.Gα 13

2.Gβ 13

3.Gγ 14

(二)PhLPS 14

三、调控蛋白RGS 15

四、G蛋白信号下游效应分子 15

(一)cAMP-PKA途径 16

1.AC 17

2.PKA-R及PKA-C 17

3.PDE 18

(二)MAPK途径 18

1.MAPKKK 18

2.MAPKK 19

3.MAPK 19

(三)IP3-Ca2+/DAG-PKC途径 20

1.PI-PLC 20

2.PKC 20

第三章 希金斯炭疽菌G蛋白信号途径图绘制 22

一、G蛋白信号途径图绘制 22

(一)G蛋白信号途径相关蛋白获取 22

1.GPCR获取 22

2.Gα、Gβ、Gγ以及PhLPS获取 23

3.RGS获取 24

4.AC获取 25

5.PKA-R以及PKA-C获取 26

6.PDE获取 28

7.MAPK获取 28

8.PI-PLC获取 29

9.PKC获取 30

(二)G蛋白信号途径绘制 32

二、问题 33

三、展望 34

第四章 希金斯炭疽菌GPCR生物信息学分析 36

一、GPCR保守结构域分析 36

二、GPCR理化性质分析 37

三、GPCR疏水性分析 39

四、GPCR信号肽、转运肽分析 40

五、GPCR亚细胞定位分析 41

六、GPCR二级结构分析 41

七、GPCR遗传关系分析 42

第五章 希金斯炭疽菌Gα、Gβ、Gγ生物信息学分析 44

一、Gα、Gβ、Gγ保守结构域分析 44

二、Gα、Gβ、Gγ理化性质分析 45

三、Gα、Gβ、Gγ疏水性分析 47

四、Gα、Gβ、Gγ信号肽、转运肽分析 48

五、Gα、Gβ、Gγ亚细胞定位分析 49

六、Gα、Gβ、Gγ二级结构分析 49

七、Gα、Gβ、Gγ遗传关系分析 50

第六章 希金斯炭疽菌PhLPS生物信息学分析 54

一、PhLPS保守结构域分析 54

二、PhLPS理化性质分析 54

三、PhLPS疏水性分析 55

四、PhLPS信号肽、转运肽分析 56

五、PhLPS亚细胞定位分析 57

六、PhLPS二级结构分析 57

七、PhLPS遗传关系分析 57

第七章 希金斯炭疽菌RGS生物信息学分析 59

一、RGS保守结构域分析 59

二、RGS理化性质分析 60

三、RGS疏水性分析 61

四、RGS信号肽、转运肽分析 63

五、RGS亚细胞定位分析 64

六、RGS二级结构分析 65

七、RGS遗传关系分析 65

第八章 希金斯炭疽菌AC生物信息学分析 68

一、AC保守结构域分析 68

二、AC理化性质分析 68

三、AC疏水性分析 70

四、AC信号肽、转运肽分析 71

五、AC亚细胞定位分析 71

六、AC二级结构分析 71

七、AC遗传关系分析 72

第九章 希金斯炭疽菌PKA-R以及PKA-C生物信息学分析 73

一、PKA-R以及PKA-C保守结构域分析 73

二、PKA-R以及PKA-C理化性质分析 74

三、PKA-R以及PKA-C疏水性分析 77

四、PKA-R以及PKA-C信号肽、转运肽分析 79

五、PKA-R以及PKA-C亚细胞定位分析 80

六、PKA-R以及PKA-C二级结构分析 81

七、PKA-R以及PKA-C遗传关系分析 82

第十章 希金斯炭疽菌PDE生物信息学分析 85

一、PDE保守结构域分析 85

二、PDE理化性质分析 85

三、PDE疏水性分析 87

四、PDE信号肽、转运肽分析 88

五、PDE亚细胞定位分析 89

六、PDE二级结构分析 90

七、PDE遗传关系分析 90

第十一章 希金斯炭疽菌MAPK信号通路上蛋白生物信息学分析 92

一、MAPK信号通路上蛋白保守结构域分析 92

二、MAPK信号通路上蛋白理化性质分析 93

三、MAPK信号通路上蛋白疏水性分析 93

四、MAPK信号通路上蛋白信号肽、转运肽分析 97

五、MAPK信号通路上蛋白亚细胞定位分析 98

六、MAPK信号通路上蛋白二级结构分析 98

七、MAPK信号通路上蛋白遗传关系分析 99

第十二章 希金斯炭疽菌PI-PLC生物信息学分析 103

一、PI-PLC保守结构域分析 103

二、PI-PLC理化性质分析 104

三、PI-PLC疏水性分析 105

四、PI-PLC信号肽、转运肽分析 106

五、PI-PLC亚细胞定位分析 108

六、PI-PLC二级结构分析 109

七、PI-PLC遗传关系分析 109

第十三章 希金斯炭疽菌PKC生物信息学分析 111

一、PKC保守结构域分析 111

二、PKC理化性质分析 111

三、PKC疏水性分析 113

四、PKC信号肽、转运肽分析 114

五、PKC亚细胞定位分析 114

六、PKC二级结构分析 114

七、PKC遗传关系分析 115

参考文献 117

附录 125

附录1 希金斯炭疽菌PKA-C BLASTP比对结果 125

附录2 希金斯炭疽菌PKC BLASTP比对结果 129

附录3 希金斯炭疽菌G蛋白亚基遗传关系分析结果 131

致谢 134

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