常用计算机辅助药物设计软件教程PDF电子书下载

电子书积分：11 积分如何计算积分？
作者：张亮仁主编
出版社：北京：中国医药科技出版社
出版年份：2017
ISBN：9787506792158
页数：257 页

图书介绍：计算机辅助药物设计已成为一门新兴的研究领域,在合理药物设计中发挥不可或缺的作用!本书依据实际工作中各种软件的应用,介绍了分子动力学模拟、分子对接、蛋白质同源模建、定量构效关系的研究、药效团的构建、虚拟筛选等内容，且每一内容有不止一个软件的使用介绍，并手把手的教初学者如何操作，适合入门计算机辅助药物设计的广大师生参考使用。

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《常用计算机辅助药物设计软件教程》目录

标签：软件教程主编药物辅助常用

第一章同源模建法预测蛋白质结构 1

第一节同源模建概述 1

第二节同源模建 3

第二章分子对接预测结合位点 18

第一节利用AutoDock进行分子对接 18

第二节利用DOCK进行分子对接 31

第三节利用Surflex-Dock进行分子对接 46

第四节利用GOLD进行分子对接 68

第三章蛋白质与核酸的分子动力学模拟 99

第一节分子动力学概述 99

第二节利用GROMACS进行纯蛋白分子动力学模拟 100

第三节蛋白与小分子复合物的动力学模拟 121

第四节核酸分子动力学模拟 143

第四章利用OpenEye组件包进行虚拟筛选 150

第一节软件简介 150

第二节利用OpenEye组件包进行虚拟筛选 152

第五章定量构效关系分析 164

第一节 CoMFA＆CoMSIA 164

第二节 HQSAR 177

第六章药效团 185

第一节药效团介绍 185

第二节利用Discovery Studio进行药效团模型构建 189

第七章全新药物设计 207

第一节概述 207

第二节利用LigBuilder进行全新药物设计 209

第八章作图软件PyMOL的应用 227

第一节 PyMOL简介 227

第二节 PyMOL基本操作 227

第九章药物设计实例 241

第一节利用OpenEye发现F.tularensis烯酰基载体蛋白还原酶FabI抑制剂 241

第二节基于模建结构的虚拟筛选发现对虾黄头病毒蛋白酶抑制剂 245

第三节基于药效团建模和分子对接的虚拟筛选发现β-分泌酶抑制剂 249

参考文献 252

彩图 255

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