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第一章　绪论 1

第一节　病毒学的历史与进化 1

一、病毒学前历史 1

二、病毒的发现 2

三、病毒学研究方法的发展 3

四、分子病毒学的发展 6

五、病毒学发展史上的重大事件 7

第二节　病毒的定义与分类 10

一、病毒的定义 10

二、病毒的进化 12

三、病毒的分类 14

第二章　病毒的组成及基因组 33

第一节　病毒的组成结构与功能 33

一、病毒衣壳的对称及吸附 34

二、病毒的螺旋状衣壳 35

三、二十面体（等轴）衣壳 38

四、复合体病毒衣壳 40

五、包被病毒 40

六、病毒的蛋白质 42

第二节　病毒的基因组及结构 45

一、病毒基因组的分类 46

二、大DNA病毒 48

三、小DNA病毒 49

四、RNA病毒（非节段基因组） 50

五、RNA病毒（节段基因组） 50

第三章　病毒吸附宿主细胞及其内化过程 56

第一节　细胞表面的结构特征 56

一、细胞外基质 56

三、细胞膜蛋白 57

二、细胞膜 57

第二节　病毒与细胞受体的相互作用 58

一、各种不同病毒的受体 59

二、病毒对受体的吸附 61

三、细胞对病毒的内吞作用 64

第三节　病毒侵入宿主细胞的分子机制 66

一、病毒通过与细胞膜的融合侵入宿主细胞 66

二、病毒通过内吞作用侵入宿主细胞 69

三、无包膜病毒侵入宿主细胞的过程 73

四、参与病毒脱壳的分子 75

第四节　病毒基因组进入宿主细胞核的分子机制 76

一、介导蛋白质入核的细胞通路 76

二、不同病毒基因组的入核机制 78

第四章　DNA病毒基因组的复制 84

二、复制的原点与复制方向 85

第一节　DNA病毒基因组复制的特点 85

一、半保留复制 85

三、连续复制与不连续复制 88

四、复制酶及附属蛋白 88

五、复制的触发机制 90

第二节　病毒DNA复制的多样性 92

一、病毒DNA复制多样性的产生 92

二、病毒DNA复制方式 92

三、双链闭环病毒DNA的复制 93

四、双链线性病毒DNA的复制 100

五、单链线性病毒DNA的复制 104

第三节 宿主细胞对病毒DNA复制的影响 106

一、病毒基因产物诱导宿主细胞复制蛋白的合成 106

二、Rb基因与DNA病毒基因组的复制 106

三、p53基因与DNA病毒复制 107

四、大量病毒复制蛋白的合成 108

五、病毒DNA的限制性复制 108

六、病毒复制部位的特点 110

第四节　病毒DNA的遗传与变异 111

一、DNA病毒遗传学特征 112

二、病毒基因组的重组 112

三、缺陷病毒 114

第五节　DNA病毒基因组复制的调控 115

第五章　RNA病毒基因复制 121

第一节 RNA病毒的基因组结构与复制特征 123

一、RNA病毒基因组结构特征 123

二、不同基因组RNA病毒的复制特征 126

三、RNA病毒基因的多样性形成 130

一、RNA依赖的RNA多聚酶 132

第二节 RNA病毒的RNA复制 132

二、病毒RNA依赖的RNA合成的启始机制 134

三、RNA依赖的RNA合成 139

第三节　反转录病毒的基因复制机制 149

一、反转录酶的结构与特征 149

二、反转录酶的反应过程 152

三、整合酶的结构与催化机制 156

四、DNA的整合反应 158

第六章　病毒基因表达调控 162

第一节　病毒基因表达调控原理 162

一、原核细胞的基因调控 162

二、λ噬菌体基因的表达调控 163

三、真核基因的表达调控 165

第二节　病毒基因的转录调控 167

一、转录的起始和转录复合体的建立 167

二、病毒蛋白在转录中的作用 169

第三节　病毒基因转录后水平的调控 172

一、转录产物的加工 172

二、转录产物的输出 176

三、病毒蛋白在转录后的调控作用 178

第四节　病毒基因的翻译及翻译后调控 181

一、多聚蛋白的合成和加工处理 181

二、渗漏扫描机制 182

三、翻译重新起始 182

四、核糖体ORF移位 183

五、翻译终止的抑制 184

第五节　各类病毒基因的表达调控 185

一、双链DNA病毒 185

二、单链DNA病毒 187

三、双链RNA病毒 187

四、正链RNA病毒 188

五、负链RNA病毒 189

六、带有DNA中间体的正链RNA病毒 190

七、带有RNA中间体的双链DNA病毒 190

第七章　病毒粒子的装配、成熟和释放 196

第一节　病毒核衣壳的装配 196

一、DNA病毒核衣壳的装配 197

二、RNA病毒核衣壳的装配 203

第二节　子代病毒粒子的成熟 210

一、病毒蛋白的水解加工 210

二、其他成熟反应 212

第三节　病毒包膜的获得 212

一、从核膜上获取包膜 212

二、从细胞质内膜上获取包膜 214

三、从细胞膜上获取包膜 214

一、无包膜病毒的释放 215

第四节　病毒粒子的释放 215

二、包膜病毒的释放 216

三、病毒在细胞之间的扩散 217

第八章　病毒感染的特点 222

第一节　病毒感染类型 222

一、急性感染 223

二、持续性感染 224

三、其他类型的感染 226

第二节　病毒在宿主体内的播散 226

一、病毒侵入机体的途径 227

二、病毒在机体内的播散 228

三、病毒的组织亲嗜性 231

四、病毒的排出和传播 232

第三节　病毒感染对宿主造成的损伤 233

一、杀细胞效应 234

二、非杀细胞效应 235

三、免疫病理损伤 235

第四节　病毒感染与细胞凋亡 240

一、细胞凋亡概述 240

二、病毒对细胞凋亡的抑制 243

三、病毒诱导的细胞凋亡 249

第五节　宿主对病毒性疾病的易感性 252

一、遗传因素 253

二、非遗传因素 254

第九章　病毒致瘤的分子机制 259

第一节　具有致瘤作用的病毒 259

一、致瘤性RNA病毒 260

二、致瘤性DNA病毒 263

一、EBV感染的细胞信号转导机制 267

第二节　病毒致瘤的细胞信号转导机制 267

二、HCV感染的细胞信号转导机制 276

第三节　病毒编码产物调控细胞周期的机制 279

一、细胞周期调节网络 279

二、病毒编码产物对细胞周期的调控 282

第四节　病毒编码产物调控细胞凋亡的机制 287

一、细胞凋亡和Caspase 287

二、病毒编码产物对细胞凋亡的抑制 288

三、病毒编码产物对细胞凋亡的诱导 290

第十章　病毒免疫 297

第一节　抗病毒免疫的细胞和分子机制 298

一、免疫系统的基本结构和功能 298

二、病毒感染的过程和免疫学特征 301

三、抗病毒感染的免疫学机制 303

一、限制病毒基因的表达 319

第二节　病毒免疫逃逸的机制 319

二、感染免疫特赦部位 320

三、逃避抗体的识别 320

四、逃避T细胞的识别 320

五、抑制细胞表面免疫分子的表达 321

六、阻碍抗原提呈 321

七、干扰细胞因子和趋化因子的作用 321

八、免疫耐受 322

第十一章　病毒性疾病的预防和治疗 324

第一节　病毒疫苗 325

一、活疫苗 328

二、灭活疫苗 334

三、佐剂 335

四、亚单位疫苗 337

五、DNA疫苗 337

第二节　病毒性疾病的化学治疗 340

六、多肽疫苗 340

一、抗病毒化疗药物的研发策略 343

二、核苷类似物 346

三、新型抗病毒化疗药物 349

四、抗病毒化疗药物的抗性 352

五、组合疗法 353

第三节　病毒性疾病的免疫治疗 355

一、细胞疗法 356

二、细胞因子疗法 356

三、抗体疗法 358

第四节　病毒性疾病的基因治疗 359

一、反义核酸技术 360

二、负显性抑制剂与抗病毒基因治疗 361

三、细胞自杀与抗病毒基因治疗 362

四、诱饵RNA与抗病毒基因治疗 362

五、抗病毒免疫基因治疗 363

第十二章　病毒载体与基因治疗 369

第一节　概述 370

一、病毒载体的发展简史 370

二、病毒载体的基本特征 371

第二节　反转录病毒载体 373

一、反转录病毒的生物学特性 373

二、反转录病毒载体的构建 373

三、反转录病毒载体的临床应用 377

第三节　DNA病毒载体 378

一、腺病毒载体 378

二、腺相关病毒载体 383

三、疱疹病毒载体 384

四、痘病毒载体 385

一、腺病毒／反转录病毒嵌合载体 386

第五节　嵌合病毒载体 386

第四节　其他病毒载体 386

二、腺病毒／腺相关病毒嵌合载体 387

三、单纯疱疹病毒／腺相关病毒嵌合载体 387

四、单纯疱疹病毒／埃巴二氏病毒嵌合载体 387

第十三章　人类免疫缺陷性病毒 390

第一节　艾滋病毒的发现、分类与起源 390

第二节　HIV的特征 392

一、HIV病毒的形态结构 392

二、HIV的基因组 393

三、HIV编码的蛋白质 394

第三节 HIV的生活周期 402

一、病毒颗粒与细胞表面的受体结合 403

二、反转录、入核和整合 404

三、RNA的转录、剪接和进入胞浆 406

四、结构蛋白质的表达、RNA包装以及病毒颗粒的装配和成熟 408

五、HIV感染的潜伏状态 409

第四节　HIV的传播途径 409

一、血液传播 410

二、性接触传播 410

三、母婴传播 411

第五节　HIV的致病机制 412

一、HIV病毒的细胞毒性 412

二、HIV对免疫系统的影响 412

三、对其他系统和器官的影响 414

四、HIV与癌 415

第六节　HIV感染所诱发的免疫反应 415

一、体液免疫反应 416

二、细胞免疫 416

一、病程演变 418

三、其他天然的抗HIV病毒复制的体液因子 418

第七节 HIV感染的病程和体内复制的动力学 418

二、HIV在体内复制的动力学 420

第八节　HIV的治疗与预防 421

一、抗病毒的药物治疗 421

二、有效HAART条件下残余HIV复制的治疗和免疫重建 423

三、疫苗的发展 424

第十四章　流行性感冒病毒 431

第一节　流感病毒的基本特征 431

第二节　流感病毒基因组结构及其表达蛋白 433

一、RNA聚合酶 433

二、血凝素 434

三、NP基因及其蛋白 439

四、神经氨酸酶 440

五、M1和M2基质蛋白 445

六、NS1和NS2非结构蛋白 446

第三节　流感病毒的感染和复制 447

一、病毒的吸附、穿膜和脱壳 447

二、基因组的转录和复制 448

三、病毒的组装、成熟与释放 452

第四节　流感病毒的抗原变异 453

一、抗原转变 454

二、抗原漂移 454

三、RNA-RNA片段重组 455

四、特异性受体在抗原改变中的作用 456

五、流感病毒缺陷性干扰颗粒 456

第五节　流感病毒的种间传播 456

一、自然宿主和种间传播 456

二、其他动物流感病毒 458

一、A型流感的临床特征 459

第六节　临床症状和预防原则 459

二、B型和C型流感的临床特征 460

三、流感的预防 460

第十五章　汉坦病毒 466

第一节　汉坦病毒属的分类 466

一、汉坦病毒与布尼亚病毒科其他属病毒的比较 466

二、汉坦病毒的型别 467

第二节　汉坦病毒的特征 467

一、汉坦病毒的形态结构 467

二、汉坦病毒的基因组 468

三、汉坦病毒的结构蛋白 470

四、汉坦病毒的培养特性 475

第三节　汉坦病毒的增殖和变异 475

一、汉坦病毒受体的研究现状 476

二、汉坦病毒基因的复制和转录 477

三、汉坦病毒蛋白的转运及毒粒的装配 478

四、汉坦病毒的变异 479

第四节　汉坦病毒的致病机制 481

一、汉坦病毒的流行病学特征 481

二、汉坦病毒所致疾病的发病机制 482

三、汉坦病毒所致疾病的病理变化 483

第五节　肾综合征出血热的特异性预防与治疗 485

一、肾综合征出血热的疫苗研制现状 485

二、肾综合征出血热的特异性治疗研究现状 486

第十六章　轮状病毒 492

第一节　轮状病毒性状 492

一、分类 492

二、病毒颗粒 493

三、理化特性 493

第二节　病毒基因组 494

第三节　病毒蛋白 495

一、结构蛋白 496

二、非结构蛋白 498

第四节　轮状病毒复制 498

一、吸附、穿入和脱衣壳 498

二、转录与复制 499

三、装配 500

四、病毒释放 500

第五节　致病性 500

一、流行病学 500

二、发病机制 501

三、临床表现及实验室检查 502

四、诊断与治疗 504

五、预防 505

一、概述 510

第十七章　肝炎病毒 510

第一节　甲型肝炎病毒 510

二、一般性状及生物学特征 511

三、基因组结构与功能及编码蛋白 511

四、病毒复制与胞内增殖 512

五、感染宿主与实验动物模型 514

六、发病机制 515

七、展望 515

第二节　乙型肝炎病毒及丁型肝炎病毒 516

一、嗜肝DNA病毒概述 516

二、乙型肝炎病毒基因组结构及编码蛋白 516

三、病毒复制与感染 522

四、乙型肝炎病毒基因变异 523

五、发病机制与免疫应答 527

六、慢性乙型肝炎的抗病毒治疗 539

七、丁型肝炎病毒 541

第三节　丙型肝炎病毒 543

一、概述 543

二、一般性状及理化性质 544

三、基因结构及编码蛋白 544

四、丙型肝炎病毒基因组序列变异 545

五、发病机制及免疫应答 547

第四节　戊型肝炎病毒 549

一、概述 549

二、病毒的理化特性 550

三、戊型肝炎病毒的基因组结构及编码蛋白 550

四、实验动物与细胞培养 551

第十八章　腺病毒 558

一、腺病毒的分类 559

第一节　腺病毒的结构与分类 559

二、腺病毒的毒粒结构 561

三、腺病毒的基因组构成 562

第二节　腺病毒基因组的转录 564

一、早期转录及早期蛋白 566

二、晚期转录及晚期蛋白 567

第三节　腺病毒的复制周期 568

一、吸附和内化 570

二、早期基因激活 571

三、宿主细胞激活 572

四、抑制凋亡 574

五、病毒DNA复制 575

六、病毒后期基因表达的激活 575

七、病毒装配和释放 577

二、免疫逃逸 579

一、人类腺病毒感染的宿主 579

第四节　腺病毒与宿主的关系 579

三、肿瘤发生 580

四、腺病毒感染的分子病理 582

第五节　腺病毒的应用 583

一、腺病毒载体的研究状况 583

二、复制缺陷型重组腺病毒载体 585

三、复制型重组腺病毒载体 585

四、靶向性重组腺病毒载体 586

第十九章　人乳头瘤病毒 592

第一节　人乳头瘤病毒的基因结构和功能 592

一、E6蛋白的结构与功能 593

二、E7蛋白的结构与功能 595

三、E5蛋白的结构与功能 597

四、E1、E2、L1、L2蛋白 598

五、HPV非编码区的结构与功能 599

第二节　人乳头瘤病毒的自然生活史及相关疾病 599

一、HPV的流行病学 599

二、HPV传播途径及自然生活史 600

三、HPV相关疾病 602

四、HPV-DNA检测 603

第三节　人乳头瘤病毒变异与宫颈癌 605

一、HPV型内序列变异 606

二、HPV基因序列变异的功能意义 606

三、HPV基因变异与宫颈癌 608

四、HPV基因变异与宿主遗传学因素 608

第四节　人乳头瘤病毒疫苗 610

一、机体对人乳头瘤病毒感染的免疫反应 611

二、乳头瘤病毒如何逃逸机体的免疫反应 612

三、HPV疫苗的要求及所存在的问题 617

四、目前HPV疫苗的类型及研究现状 619

第二十章　单纯疱疹病毒、巨细胞病毒和Epstein-Barr病毒 630

第一节　单纯疱疹病毒 630

一、病毒的基本特征 631

二、病毒复制 636

三、病毒感染与致病机制 639

第二节 巨细胞病毒 643

一、病毒的基本特征 644

二、病毒复制 647

三、病毒感染与致病机制 650

第三节　Epstein-Barr病毒 656

一、病毒结构 656

二、感染机制 659

三、正常人对EBV感染的反应 665

四、免疫抑制个体对EBV感染的反应 672

第二十一章　朊病毒 681

第一节　可传播性海绵状脑病的种类 681

一、动物可传播性海绵状脑病 682

二、人类可传播性海绵状脑病 685

三、可传播性海绵状脑病的临床及病理学特征 688

第二节　可传播性海绵状脑病的感染因子 690

一、感染途径及致病过程 691

二、感染因子的特征 692

三、朊病毒学说 693

第三节　宿主基因和种属屏障作用 696

一、宿主基因 696

二、人PrP基因129位密码子的多态性 698

三、种属屏障作用 701

一、正常PrP蛋白PrPc 703

第四节 PrPc和PrPSc的生物学特征 703

二、异常PrP蛋白PrPSc 705

第五节 PrPc-PrPSc转变的分子机制 707

一、蛋白分子结构及相互作用 707

二、PrPSc形成的模型 709

三、PrPSc形成过程中的分子伴侣 710

第六节　可传播性海绵状脑病的实验室诊断、处理原则 711

一、实验室诊断 711

二、实验室安全 713

第二十二章　SARS冠状病毒 719

第一节　SARS冠状病毒的鉴定与分类 720

一、SARS冠状病毒的鉴定 720

二、SARS-CoV在冠状病毒属中的分类 720

二、SARS冠状病毒的理化性质 722

一、SARS冠状病毒的形态结构 722

第二节　SARS冠状病毒的生物学特征 722

三、SARS冠状病毒的基因组结构 724

四、SARS冠状病毒基因组编码蛋白及其功能 725

第三节　SARS冠状病毒的增殖和变异 728

一、SARS冠状病毒受体 728

二、SARS冠状病毒的增殖 728

三、SARS冠状病毒的变异 729

第四节　SARS冠状病毒的致病机制 731

一、SARS冠状病毒的流行病学特点 731

二、SARS冠状病毒的发病机制 732

第五节　SARS冠状病毒的预防和治疗原则 733

一、SARS冠状病毒的预防原则 733

二、SARS冠状病毒的治疗原则 735

一、细胞培养的分类 737

第一节　细胞培养 737

第二十三章　分子病毒学实验方法 737

二、细胞培养的基本条件 738

三、细胞培养的方法 739

第二节　病毒的分离与鉴定 740

一、标本的采集与送检 740

二、病毒的分离 741

三、分离病毒的鉴定 741

第三节　病毒基因的扩增与检测 743

一、聚合酶链反应技术 743

二、分子杂交技术 749

第四节　病毒抗原抗体测定 751

一、病毒特异性抗原检测 751

二、病毒特异性抗体检测 752

一、RNA病毒敏感动物 753

第五节　病毒的动物模型 753

二、DNA病毒敏感动物 757

三、其他病毒的敏感动物 757

第六节　病毒的结构分析 758

一、病毒核酸的分析 758

二、病毒蛋白的分析 759

第七节　病毒基因表达调控分析 761

一、染色质和基因活化的研究方法 761

二、转录水平的研究方法 761

三、反式作用因子相互作用的检测 762

四、研究上游顺式作用元件的方法 762

五、转基因与基因“敲除”技术 762

附录一　主要参考文献 764

附录二 国内外病毒学期刊 766

附录三　病毒学研究相关网站 767

附录四　索引 768