生物信息学中的智能计算理论与方法研究PDF电子书下载

Structural Modelling of the Saccharomyces Cerevisiae and Candida Albicans PEPCKs:Models for the Antifungal Drug Design Zhen Qian,Liang Shan,Beibei Niu,Feng Wang,Shengrong Tang,Bin Xu,Juhong Tao,Hui Dong,Shuangxi Ren 1

第一部分　蛋白质结构与相互作用 1

计算机模拟短小芽孢杆菌木聚糖酶与底物木聚糖的对接 林锦霞，张燎原，张光亚，方柏山 5

数据挖掘在蛋白质二级结构建模中的应用研究 刘满强，周承刚，周红莉　 10

一种基于最小自由能和协变信息预测带伪结RNA二级结构的迭代化方法 王金华，骆志刚，管乃洋，严繁妹，靳新，张雯　 15

Effective Protein Folding Prediction Based on Genetic-Annealing Algorithm in Toy Model Xiaolong Zhang,Xiaoli Lin 21

3D Structural Motif Finding in Protein Strutures by Network Alignment Yong Wang,Zhenping Li,Xiangsun Zhang,Luonan Chen　 27

RelBay:A Combined Method for Mining Literature of Protein Phosphorylation Sites Lirong Wang,Wenlong Xu,Xie Dan,Huanqing Feng,Zhaohui Jiang　 32

Prediction of Enzyme Catalytic Residues Based on Naive Bayes Classification Yun Xu,Kunpeng Zhang,Guoliang Chen　 35

蛋白质折叠速率计算 马彬广　 39

Mining Data of Global Gene Expression in Human Skeletal Muscle Relate to Regular Aerobic Exercise by BRB-ArrayTools Ke Jiebing,Ma Wenli,Lin Jiandi,Jiang Li,Zheng Wenling　 44

第二部分　基因测定与算法设计 44

酵母基因上游中二聚体寡核苷酸转录调控位点的分析 王秀荷，张静，胡俊　 50

基于基因表达谱的肿瘤分类研究进展 王树林，陈火旺，王戟　 56

基于大规模DNA微阵列数据的调控亚网络的重建 陈晓辉，宁开达，陈铭　 65

基于模糊关联规则的聚类算法在基因表达数据分析中的研究 徐旭东，郑欣　 70

基于序列特征的戊肝病毒基因分型方法 刘志华，董晨，孟继鸿，孙啸　 74

细菌基因组水平转移基因预测 吴建盛，李菊荣，周豪彦，周童，翁建洪，孙啸　 79

Quantitative Analysis of Gene Regulatory Networks in Response to Various Environmental Stresses Ting Chen,Feng Li,Bor-Sen Chen,Liang Chen　 84

调控元件和组合元件的识别以及全基因组分布分析 黄甲平，韦芬霞，吴建盛，孙啸　 89

Hybrid Intelligent Data Mining Techniques and Array CGH in Breast Cancer Profiling Filippo Menolascina,Stefania Tommasi,Vita Fedele,Angelo Paradiso,Giuseppe Mastronardi,Vitoantonio Bevilacqua　 93

基于基因芯片表达谱的癌症预后元分析研究 杨锡南，孙啸　 100

针对早期应答基因的专用检测芯片设计 肖强海，Saleh,Hatem Mohamed，马维骏　 105

第三部分　序列分析与结构比对 110

一种快速的序列次序无关的结构比对方法 项俊平，胡茂林　 110

A New Method for Pairwise Protein Structure Alignment Yuefeng Shen,Bo Li　 119

Genome-wide Comparative Phylogenetic Analysis of SBP-box Gene Family in Arabidopsis and Rice Zefeng Yang,Xuefeng Wang,Shiliang Gu,Zhiqiu Hu,Hua Xu,Chenwu Xu　 125

第四部分　生物数据库的开发、管理与搜索策略 134

生物序列数据库管理系统研究 熊赟，张锐，陈越，朱扬勇 134

基于Web的基因表达数据管理系统的设计与实现 徐旭东，韩丹，郑欣，刘国明　 139

疾病相关SNP数据的分类组织及数据库构建 张青青，王琦，赵嫒嫒，吴建盛，陆祖宏，孙啸　 143

MoBIoS Index:Support Distance-Based Queries in Bioinformatics Rui Mao,Weijia Xu,Willard S.Willard,Smriti R.Ramakrishnan,Daniel P.Miranker　 147

第五部分　智能计算在生物信息学领域的应用研究 153

SAT问题的主要算法模型 刘伟，孙守霞　 153

拟位生物信息学分析工具 黄健，张安英　 158

A New Method for Conversion from Torsion Space to Cartesian Space Banghe Li,Yuefeng Shen　 163

Thirty-four Pseudoknots of Twenty-two Human C2H2 Zinc Finger ESTs Discovered by Computational Structural Analysis Shaowu Meng,Zhuo Zhang,Zhong Yang　 167

An Adaptive Elastic Registration of Two-Dimensional Electrophoresis Gel Images Using Intensity Information and Landmark Points Shicai Fan,Lijiang Wu,Xuegong Zhang 173

具有灾变效应的合作式协同进化遗传算法 程俊，顾幸生　 179

Data Model of Knowledge Base of Reproductive Biology Chunsheng Han,Shaoyuan Yao,Xiongying Yuan　 183

Effect of Decay Functions in Medical Diagnoses with GRLS Neural Networks Yong Xu,Kwok-Wo Wong,　 188

第六部分　其他 194

Bcl-2家族蛋白调控线粒体外膜通透性的细胞自动机模拟 陈春，崔隽，张帅，沈萍萍　 194

The Relationship Between Molecular Motions of HIV-1 gp120 Mutants and Their Preferences for Different Conformations Shuqun Liu,Shixi Liu,Ciqun Liu,Yunxin Fu　 201

Neighboring Nucleotide Biases of the Intra-Varietal Single Nucleotide Polymorphisms of the rice Plastid Genome Xiangjun Tian,Songnian Hu,JunYu　 217

基于MATLAB的分子系统学研究——以鳄类分子系统学研究为例 左先波，吴孝兵　 221