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第一章 绪论 2

1.1前言 2

1.1.1微生物于环工上之意义 2

1.2微生物 3

1.2.1微生物一般性之定义 3

1.2.2微生物学术上之定义 3

1.2.3原生生物的分类 4

1.2.4微生物分类概述 4

1.3环境微生物 7

1.3.1根据环境微生物之应用一般可区分成四方面 8

1.3.2水质生物检验目的 8

第二章 原核生物与病毒 10

2.1生物之分类 10

2.2原核细胞（Procaryotes） 13

2.2.1细菌 13

2.2.2蓝绿藻（Blue green algae/Cyanobacter） 22

2.3病毒 24

2.4最新细菌分类法（Bergey氏手册） 26

2.4.1古细菌之细胞壁及细胞膜 31

2.5古细菌各论（参考） 33

2.6特殊细菌（参考） 35

第三章 真核生物 42

3.1前言 42

3.2真菌 42

3.3藻类（Algae） 48

3.4原生动物 53

3.4.1单细胞原生动物 53

3.4.2多细胞原生动物（后生动物）（Metazoan） 57

3.4.3微生物指标（种歧异度） 60

3.4.4微生物营养要求-细胞化学组成 61

第四章 研究微生物的方法 64

4.1观察微生物的方法 64

4.1.1显微镜种类 64

4.1.2镜检之方法 67

4.2检体制备-染色 67

4.2.1常见的染色法 69

4.3微生物的培养 72

4.3.1培养之种类 72

4.3.2培养基之种类 72

4.3.3培养之技术 75

4.4菌种的保存 80

4.5微生物生长之测定 81

4.5.1菌数测定（Total count） 81

4.5.2菌体重量测定 82

4.5.3菌体活性测定 83

4.6目前水中微生物之标准检测方法（暂定） 84

4.6.1水中大肠杆菌群检验法-多管发酵法 84

4.6.2水中生菌数检验法-涂抹法 90

4.7应用分子生物技术进行微生物之检测 91

第五章 影响微生物生长、死亡的环境因子及其生长特性 100

5.1生长条件 100

5.2生长特性 109

5.2.1微生物数目vs.时间图 110

5.2.2模式之数学解析 111

5.2.3比生长率和时间关系 112

5.2.4基质降解和生物增长动力学 113

5.2.5比基质利用vs.基质浓度 116

5.2.6内呼吸期的数学模式 118

5.2.7完全混合活性污泥槽问题 119

5.2.8 BOD去除问题 121

5.2.9化学恒定器与完全混合活性污泥槽 121

5.3微生物的死亡 123

5.3.1一般名词 124

5.3.2灭菌之方法 125

5.3.3作用原理 129

5.3.4石炭酸系数（Phenol coefficient） 130

5.3.5常用之化学消毒剂 132

5.3.6影响消毒剂之因子 133

第六章 环境微生物 136

6.1基础观念 136

6.2种类 137

6.2.1碳循环 138

6.3氮细菌 138

6.3.1氮的循环可分为五大作用 138

6.3.2硝化菌 140

6.3.3脱氮菌（Denitrifier） 142

6.3.4氮固定菌（三类） 143

6.3.5毒性问题 144

6.4硫细菌 145

6.4.1硫循环 146

6.4.2 H2S→/-O2 S 146

6.4.3 H2S （S、S2O 2- 3）→/+O2 SO4 2-硫氧化菌 147

6.4.4硫还原菌（化学异营菌）（SRB） 150

6.4.5光合非硫菌 153

6.5铁细菌（Fe 2+→Fe 3+） 154

6.6锰细菌 158

6.7汞细菌 159

6.8氢细菌 160

6.9甲烷菌 161

6.10微生物去除环境中重金属之机制 163

6.11自然生态系之模拟（Winogadsky column） 167

第七章 环工微生物之应用 170

7.1废水处理的程序 170

7.2生物处理法 171

7.3活性污泥法 173

7.3.1污泥膨化现象之深入探讨 181

7.4滴滤池（Trickling Filter） 185

7.5氧化塘（Oxidation Pond） 190

7.5.1生物相（参考） 190

7.6旋转生物盘（RBC） 191

7.6.1 RBC之优点 191

7.6.2基质及溶氧在旋转盘上之变化情形（污水工程高考考题） 192

7.7活性生物滤床法（ABF） 195

7.8厌氧消化法 196

7.8.1优缺点 197

7.8.2厌氧消化之过程 198

7.8.3影响消化的因素 200

7.9接触曝气法 201

7.10高级处理（三级处理） 206

7.10.1氮的去除 207

7.10.2磷的去除 207

7.10.3顽固性有机物去除-活性碳 209

7.11环境微生物之新应用 210

7.12堆肥技术 213

第八章 指标微生物 218

8.1前言 218

8.2对自来水理想指标微生物的条件 218

8.2.1 Coliform group大肠菌群 219

8.2.2以大肠菌作为污染指标之优点 220

8.2.3鉴定方法 222

8.3河流之自净作用 226

8.4水体污染指标 228

8.5生物毒性试验 230

第九章 优养化现象 234

9.1前言 234

9.2优养化（Eutrophication） 234

9.3春秋翻腾（Turnover） 235

9.4名词解释（参考） 240

第十章 顽固有机物之处理 244

10.1土壤中之微生物 244

10.2空气中之微生物 245

10.3难分解有机物概论 247

10.4一般有机物之代谢反应 249

10.5生物复育技术 254

10.6顽固有机物分解模式 254

10.7突变与酵素调控机制 256

10.7.1突变 256

10.7.2酶合成之调控 257

第十一章 微生物之代谢 261

11.1酵素与有机物代谢作用 261

11.1.1酵素之特性 261

11.1.2有机物代谢作用 262

11.2糖解作用（Glycolysis）（EMP Pathway） 265

11.2.1进入TCA cycle之起始反应 266

11.3柠檬酸循环 267

11.4电子传递链（厌氧及好氧） 268

11.5醱酵作用 269

11.6甘油进入TCA cycle 272

11.7胺基酸进入TCA cycle 274

11.8基质代谢总论 277

11.9微生物产能之方式（三种） 282

附录 294

精选例题 294