放线菌分类学PDF电子书下载

第一篇 现代放线菌分类学原理 2

第一章 放线菌分类学的过去和现在 2

第一节 国外概况 2

第二节 国内概况 5

第三节 放线菌的分类地位 6

第二章 形态特征和培养特征在分类中的意义 10

第一节 放线菌的基本形态 10

第二节 放线菌形态特征和培养特征的稳定性 11

第三章 化学分类原理 13

第一节 细胞壁化学类型 14

第二节 全细胞水解物糖类型 16

第三节 肽聚糖类型 18

第四节 磷脂 18

第五节 脂肪酸 21

第六节 甲基萘醌 26

第四章 分子分类原理 29

第一节 蛋白质图谱 31

第二节 DNA的GC克分子百分比 35

第三节 DNA-DNA分子杂交 37

第四节 DNA-RNA分子杂交 42

第五节 DNA探针及其应用 44

第五章 rRNA核苷酸序列分析在分类中的应用 50

第一节 基本原理 50

第二节 16SrRNA核苷酸序列分析方法之一 56

一、基本原理 56

二、引物设计 56

三、引物的合成和纯化 61

四、模板RNA提取 62

五、RNA纯化 63

六、测序 64

七、试剂配制 67

第三节 RT-PCR方法 71

一、rRNA制备 72

二、cDNA的合成 73

三、PCR扩增 74

四、制备pBluescript KS＋重组质粒 77

五、重组质粒转入E.coli 79

六、从E.coli提取DNA 81

七、测定DNA核甘酸顺序 82

第四节 结果的分析整理 89

一、相似性计算 89

二、构建进化（系统发育）树（Phylogenetic tree） 89

第五节 问题和展望 89

第六章 数值分类原理 92

第一节 基本原则 92

第二节 方法 95

第三节 程序 96

第四节 结果分析 102

第五节 数值分类的应用 103

第七章 综合分类 105

第一节 放线菌分类的基本程序 105

第二节 信息是分类研究的生命线 106

主要参考文献（Ⅰ） 108

第二篇 各 论 114

第八章 放线细菌群Actinobacteria 114

第一节 壤霉菌属Agromyces 114

第二节 杆菌属Arthrobacter 115

第三节 原小单孢菌属Promicromonospora 115

第四节 厄氏菌属Oerskovia 116

第五节 放线菌属Actinomyces 116

第六节 短杆菌属Brevibacterium 117

第九章 游动放线菌群Actinoplanetes 118

第一节 游动放线菌属Actinoplanes 119

第二节 小瓶菌属Ampullariella 120

第三节 嗜毛水生菌属Pilimelia 121

第四节 指孢囊菌属Dactylosporangium 124

第五节 小孢链菌属Catellatospora 125

第六节 小单孢菌属Micromonospora 127

第十章 马杜拉菌群Maduromycetes 130

第一节 马杜拉放线菌属Actinomadura 131

第二节 小双孢菌属Microbispora 134

第三节 小四孢菌属Microtetraspora 136

第四节 游动双孢菌属Planobispora 138

第五节 游动单孢菌属Planomonospora 138

第六节 游动多孢菌属Planopolyspora 139

第七节 螺孢菌属Spirillospora 140

第八节 链孢囊菌属Streptosporangium 140

第九节 草孢菌属Herbidospora 143

第十节 游动链孢菌属Streptoplanospora 143

第十一节 中国孢囊菌属Cathayosporangium 144

第十一章 小多孢菌群Micropolyspores 145

第一节 放线多孢菌属Actinopolyspora 146

第二节 糖多孢菌属Saccharopolyspora 146

第三节 无枝菌酸菌属Amycolata 147

第四节 拟无枝菌酸菌属Amycolatopsis 148

第五节 假无枝菌酸菌属Pseudoamycolata 149

第六节 小多孢菌属Micropolyspora 149

第七节 拟孢囊菌属Kibedelosporangium 150

第八节 假诺卡氏菌属Pseudonocardia 151

第九节 糖单孢菌属Saccharomonospora 152

第十节 双孢放线菌属Actinobispora 152

第十一节 游动四孢菌属Planotetraspora 153

第十二章 多腔孢囊菌群Multilocular Sporangia 154

第一节 地嗜皮菌属Geodermatophilus 154

第二节 嗜皮菌属Dermatophilus 155

第三节 弗兰克氏菌属Frankia 156

第十三章 诺卡氏菌群Nocardioforms 158

第一节 乳酸杆菌属Caseobacter 158

第二节 棒杆菌属Corynebacterium 159

第三节 红球菌属Rhodococcus 159

第四节 分枝杆菌属Mycobacterium 160

第五节 诺卡氏菌属Nocardia 161

第十四章 类诺卡氏菌群Nocardioides 163

第十五章 链霉菌群Streptomycetes 165

第一节 间孢囊菌属Intrasporangium 165

第二节 动孢菌属Kieosporia 166

第三节 鱼孢菌属Sporichthya 167

第四节 链霉菌属Streptomyces 168

第十六章 高温单孢菌群Thermomonospores 177

第一节 高温单孢菌属Tnermomonospora 177

第二节 束丝菌属Actinosynnema 178

第三节 拟诺卡氏菌属Nocardiopsis 179

第四节 糖丝菌属Saccharothrix 180

第五节 链异壁菌属Streptoalloteichus 181

第六节 珊瑚放线菌属Actinocarallia 181

第七节 库茨勒菌属Kutzneria 182

第十七章 未归群各属Other Genera 183

第一节 糖霉菌属Glycomyces 184

第二节 游动短孢链菌属Catenuloplanes 184

第三节 库奇游动菌属Couchioplanes 185

第四节 高温放线菌属Thermoactinomyces 185

主要参考文献（Ⅱ） 187

附： 198

一、评论：近五年放线菌分类研究的进展 198

二、构建微生物分子分类系统进化树的快速算法与数据结构 212

三、系统进化树的图论性质及研究自动绘制算法 224