信号转导手册 2 蛋白质磷酸化和去磷酸化 英文PDF电子书下载

导读版第①卷 细胞内外信号转导机制 1

1．细胞信号转导：昨天、今天和明天 1

第一部分 起始：胞外及质膜事件 5

A 分子识别 9

2．分子识别的结构和能量基础 11

3．蛋白与蛋白相互作用的自由能概貌 15

4．分子社会学 23

5．抗原-抗体识别及其构象变化 29

6．抗原-抗体界面处的结合热力学 37

7．免疫球蛋白-Fc受体相互作用 41

8．免疫球蛋白超折叠及其在分子识别中的多种用途 49

9．T细胞受体／pMHC复合体 55

10．细胞表面黏附受体的机制特征 63

11．免疫突触 71

12．NK受体 77

13．碳水化合物的识别与信号转导 85

14．鼻病毒与其受体的相互作用 93

15．Ⅰ-型人免疫缺陷病毒与其受体的相互作用 97

16．流感病毒神经氨酸酶的抑制剂 103

17．涉及血液纤维蛋白原及纤维蛋白的信号事件的结构基础 111

18．整合素信号的结构基础 115

19．G蛋白异源三聚体及其复合物的结构 119

20．G蛋白偶联受体的结构 129

21．Toll样受体的结构与信号 139

22．多种多样的淋巴细胞受体 145

B 多通路受体 149

23．G蛋白偶联受体的结构与功能：从最近发现的晶体结构得到的启示 151

24．趋化因子及其受体的结构与功能 157

25．G蛋白偶联受体的结构及其被可扩散激素所激活的过程（参照β2型肾上腺素受体模型） 163

26．蛋白酶激活的受体 171

27．由激动剂导致的G蛋白偶联受体的脱敏及细胞内吞化作用 177

28．由G蛋白偶联受体形成的二聚化复合体的功能 185

29．细菌中的趋化性受体：跨膜信号，敏感性，匹配及受体聚集 195

30．离子通道结构概论 201

31．STIM和Orai介导的钙库依赖性钙信号及CRAC离子通道激活的分子机制 209

32．离子渗入性：离子选择性与进入阻断的机制 217

33．烟碱乙酰胆碱受体 221

34．与核苷酸环化酶直接结合而被调节的离子通道 225

C 对受体的横向比较研究 233

35．细胞因子受体概述 235

36．生长激素与泌乳激素家族及其受体：受体激活和调节的结构基础 237

37．以促红细胞生成素受体为例的细胞因子信号 245

38．纤维原细胞生长因子（FGF）信号复合体 253

39．γ干扰素及其受体的结构 261

40．肿瘤坏死因子（TNF）的结构及其在细胞表面的功能 265

41．神经生长因子的信号机制（以p75和TrkA受体复合体为例） 277

42．血管内皮生长因子对其受体的激活机制 287

43．肿瘤生长因子β超家族中的受体-配体识别：其外部结构域复合物晶体结构的启示 293

44．胰岛素受体复合物及胰岛素介导的信号通路 301

45．胰岛素受体酪氨酸激酶的结构与机制 307

46．白介素21增强的药效设计 315

47．典型的第一类细胞因子受体——白介素4R的信号通路：静止态是如何定义的 323

48．表皮生长因子激酶及其在受体介导的信号通路中的激活 329

D 膜近端事件 337

49．肿瘤坏死因子受体偶联因子在免疫受体信号转导中的作用 339

50．肿瘤坏死因子受体家族分子的信号复合体组装 347

51．CD40在免疫系统中的信号机制 353

52．脂类结构域在表皮生长因子受体信号通路中的作用 359

53．脂类介导的信号蛋白定位 365

54．光受体信号复合体的组织 373

55．跨膜受体多聚化 379

导读版第②卷 蛋白质磷酸化和去磷酸化第二部分 传递：效应物及胞浆事件 385

A 蛋白磷酸化 391

56．真核激酶组学：蛋白激酶的基因组与进化 393

57．在细胞交流中模块蛋白的互作结构域 399

58．丝／苏氨酸及酪氨酸激酶的结构 413

59．蛋白酪氨酸激酶受体信号概述 419

60．血小板来源的生长因子受体家族信号通路 427

61．表皮生长因子受体家族 435

62．Eph受体信号的机制与功能 443

63．细胞因子受体信号通路 451

64．JAK/STAT信号通路的负调控 467

65．蛋白激酶的抑制物 481

66．整合信号：细胞的迁移、增殖与存活 491

67．下游信号通路：模块的互作 501

68．非受体型酪氨酸激酶在T细胞抗原受体功能中的作用 507

69．受体酪氨酸激酶信号及泛素化 517

70．肿瘤生长因子β的信号转导 521

71．有丝分裂原激活的蛋白激酶 533

72．由磷酸化的丝／苏氨酸结合结构域介导的对丝／苏氨酸磷酸化蛋白质的识别 539

73．单磷酸腺苷激活的蛋白激酶 551

74．激酶调节的原则 559

75．钙／钙调蛋白依赖的蛋白激酶Ⅱ 565

76．糖原合成激酶3 569

77．PIKK蛋白激酶家族 575

78．在双组分信号通路中的组氨酸激酶 581

79．非典型性蛋白激酶：EF2K/MHCK/TR-PM7家族 587

80．拟南芥的富亮氨酸重复受体蛋白激酶——植物LRR受体的范例 601

81．构建对非自然核苷酸或抑制剂具特异性的蛋白激酶 609

82．激酶抑制剂在实体瘤中的临床应用 615

83．在NFkB信号通路中由泛素化介导的蛋白激酶的调节 633

84．对磷酸化调节网络的整体性分析 645

B 蛋白去磷酸化 657

85．对蛋白的丝氨酸及苏氨酸残基去磷酸化的磷酸酶家族 659

86．蛋白丝／苏氨酸磷酸酶的基本结构及拓扑结构 677

87．蛋白丝／苏氨酸磷酸酶的天然抑制剂 683

88．蛋白磷酸酶1结合蛋白 689

89．蛋白丝／苏氨酸磷酸酶抑制剂及人类疾病 699

90．钙调蛋白磷酸酶 705

91．蛋白丝／苏氨酸磷酸酶2C（PP2C） 711

92．识别蛋白酪氨酸磷酸酶底物的方法 717

93．蛋白酪氨酸磷酸酶的抑制剂 727

94．PTP受体活性的调节 737

95．CD45 743

96．Cdc14磷酸酶的调节及其细胞周期功能 749

97．MAP激酶磷酸酶 755

98．包含SH2结构域的蛋白酪氨酸磷酸酶 771

99．胰岛素受体PTP:PTP1B 811

100．STYX/Dead磷酸酶 817

101．斑马鱼与磷酸酶功能 827

102．Eya蛋白酪氨酸磷酸酶：一类新的真核脱卤化酶超家族 835

103．PHLPP：含PH结构域及富亮氨酸重复基序的蛋白磷酸酶 843

104．PTEN 849

105．PTP的氧化 855

106．细胞骨架调节中的Choronophin与Slingshot cofilin磷酸酶 863

107．蛋白酪氨酸磷酸酶的大尺度结构分析 871

108．蛋白磷酸酶与生物钟 877

导读版第③卷 钙离子信号转导、脂质介导的第二信使C 钙信号转导 883

109．钙信号：信使、传输通路、感受器及生理效果 885

110．磷脂酶C 887

111．环化ADP-核糖与NAADP 893

112．电压门控的钙通道 897

113．钙库偶联的钙通道 911

114．花生四烯酸调节的钙通道 915

115．IP3受体 921

116．Ryanodine受体 927

117．细胞内钙信号 937

118．钙泵 943

119．钠／钙交换 949

120．Ca2＋缓冲 955

121．线粒体是细胞钙信号网络的组织者 963

122．EF-手蛋白与钙的感受：神经元钙感应蛋白 973

123．钙调蛋白介导的信号通路 979

124．S100细胞信号蛋白家族 983

125．膜联蛋白Annexin与钙信号 995

126．钙依赖蛋白酶Calpain 999

127．平滑肌中的钙信号 1009

128．心肌中的钙信号 1027

D 脂来源的第二信使 1031

129．历史回顾：蛋白激酶C、佛波酯及脂类递质 1033

130．Ⅰ型磷脂酰肌醇-4-磷酸-5-激酶（PI4P5-激酶） 1037

131．Ⅱ型PIP4激酶 1043

132．磷酸肌醇3-激酶 1049

133．PTEN/MTM磷脂酰肌醇磷酸酶 1061

134．含有SH2结构域的5'肌醇磷酸酶 1065

135．脂类第二信使识别的结构原则 1085

136．Pleckstrin同源（PH）结构域 1093

137．PX结构域 1103

138．膜运输及细胞信号中的FYVE结构域 1111

139．蛋白激酶C：从脂类水解到蛋白磷酸化的信号接力 1123

140．磷酸肌醇对单体G蛋白的调节 1131

141．磷酸肌醇与肌动蛋白细胞骨架的重构 1141

142．磷脂酰肌醇转运蛋白 1151

143．肌醇羟基五磷酸盐——信号转导中心 1159

144．磷脂酶D 1167

145．二酯酰甘油激酶 1177

146．1-磷酸-鞘氨醇受体：最新进展 1183

147．溶血磷脂酸及1-磷酸-鞘氨醇对G蛋白偶联受体的激活 1191

148．神经酰胺在细胞调节中的作用 1201

149．磷脂酶A2在花生四烯酸动员中的作用与花生酸的产生 1213

150．前列腺素递质 1219

151．白三烯递质 1229

152．脂氧素与阿司匹林诱发的15-磊晶脂氧素：在抗炎与炎症消退中的消退递质前体 1235

导读版第④卷 蛋白质互作、环化核苷酸E 蛋白临近互作 1243

153．蛋白临近互作 1245

154．体内磷酸化位点的快速识别及蛋白激酶和磷酸酶通过亲合捕获对这些位点的调节 1247

155．FRET法对胞内信号事件的分析 1253

156．局部黏附：分子互作的网络 1259

157．WASP及WAVE家族蛋白复合体 1265

158．突触NMDA受体信号复合体 1271

159．Toll家族受体 1277

160．信号转导与免疫突触 1283

161．泛素-蛋白酶体系统 1293

162．半胱天冬氨酸蛋白水解酶：蛋白降解引发的细胞信号 1297

163．酵母中的MAP激酶 1303

164．哺乳动物MAP激酶 1315

165．由AKAP介导的PKA亚细胞靶点：保守的铆定结构域与独特的靶点结构域 1329

166．AKAP转导单位：背景依赖的信号复合体组装 1337

167．树突蛋白磷酸酶复合体 1343

168．蛋白磷酸酶2A 1353

169．14-3-3蛋白 1367

170．蛋白互作数据资源 1375

F 环化核苷酸 1387

171．腺苷酸环化酶 1389

172．鸟苷酸环化酶 1399

173．磷酸二酯酶家族 1409

174．cAMP特异性的磷酸二酯酶：多种识别cAMP信号特征与定位的一类酶 1415

175．cAMP/cGMP双重特异性的磷酸二酯酶 1425

176．磷酸二酯酶-5 1439

177．光受体磷酸二酯酶（PDE6）在视觉信号途径中的功能与调节 1445

178．通过鳌合调节环化核苷酸水平 1453

179．cAMP依赖的蛋白激酶 1461

180．cGMP依赖的蛋白激酶：靶向及表达控制 1471

181．cAMP及cGMP依赖性蛋白激酶的抑制剂 1479

182．环化核苷酸依赖的蛋白激酶的底物 1489

183．PKA和PKG的生理底物 1497

184．cGMP依赖的蛋白激酶敲除效应 1515

185．环化核苷酸调节的阳离子通道 1519

186．Epac,cAMP调节的Rap1和Rap2的鸟嘌呤核苷酸交换因子 1525

187．在磷酸二酯酶和腺苷酸环化酶中结合环化核苷酸的GAF结构域 1531

188．利用嵌合型腺苷酸环化酶来研究环化核苷酸信号通路 1537

189．动体目原生动物中的环化核苷酸信号 1543

190．环化核苷酸的特异性与环化核苷酸受体的交叉激活 1549

191．用于研究环化核苷酸信号通路的环化核苷酸类似物 1555

192．血小板中的cGMP和PKG信号 1563

193．应用siRNA及反义链敲减研究PKI对PKA的调节 1569

194．中枢神经系统中的环化核苷酸信号 1573

195．心肌细胞中cAMP的区室化 1581

196．磷酸二酯酶9A:cGMP特异性的酶 1589

导读版第⑤卷 G蛋白、发育生物学中的信号转导G G蛋白 1595

197．G蛋白的信号转导：基本原则、分子多样性及其行为的结构基础 1597

198．在原子分辨率下的异三聚G蛋白信号 1615

199．异三聚体G蛋白的体内功能 1621

200．共价修饰对G蛋白的调节 1629

201．G蛋白偶联受体、信号保真及细胞转化 1635

202．通过Gz传导的信号 1649

203．Gαo的效应物 1655

204．异三聚体G蛋白的单ADP核糖基化 1665

205．G蛋白βγ二聚物信号的特异性 1673

206．G蛋白信号调节者（RGS）超家族 1683

207．化学趋向性中的G蛋白信号 1705

208．在G蛋白信号通路中可逆的棕榈酰化作用 1713

209．G蛋白在味觉转导中的行为 1721

210．由异三聚体G蛋白调节的突触融合 1727

211．通道的G蛋白调节 1735

212．Ras蛋白与癌症 1741

213．细胞内定位对Ras蛋白功能的影响 1745

214．R-Ras在细胞生长中的作用 1753

215．Ran GTPase：细胞作用与调节 1763

216．Rac GTPase对NADPH氧化酶的调节 1773

217．Rac和Rho在细胞周期进程中的作用 1781

218．Cdc42及其细胞功能 1785

219．组织中谷氨酰胺转移酯酶：一种独特的GTP结合／GTPase 1795

220．ADP核糖基化因子在膜转运中的作用 1803

221．酵母小G蛋白的功能：酵母中细胞极性的分子基础 1813

222．法尼基转移酶的抑制剂 1819

223．Rho家族靶点的结构 1827

224．RhoGEF的结构特征 1843

225．小GTP结合蛋白的结构思考 1849

226．Mx蛋白：有着抗病毒活性的高分子量GTPase 1855

H 发育信号 1865

227．Wnt/β-catenin/Fgf之间的相互作用与在侧线形态生成中的趋化因子信号 1867

228．Wnt信号在发育中的作用 1873

229．Hedgehog信号在发育与疾病中的作用 1879

230．钙对脊椎动物左右轴发育的调节 1885

231．LIN-12/Notch信号：诱导、侧向特异性及与EGF/Ras通路的互作 1891

232．Notch信号的蛋白降解激活：配体内吞与机械转导 1897

233．BMP在发育中的作用 1905

234．神经营养因子在发育中的作用 1913

235．不同生物学反应中背景依赖的VEGF信号机制 1919

236．血管内皮生长因子及其受体：血管发育中的信号转导 1927

237．成纤维生长因子受体在发育与疾病中的信号 1939

238．受体蛋白酪氨酸磷酸酶在轴突路径导航中的作用 1949

239．神经生长椎导向中的吸引与排斥信号 1955

240．脊椎及无脊椎动物中的Semaphorin蛋白及其受体 1961

241．在胚胎脊髓发育中调节细胞命运的信号通路 1967

242．黏附互作的钙粘蛋白调节 1975

243．通过Smadl磷酸化实现的BMP、RTK及Wnt信号的整合 1989

导读版第⑥卷 转录与翻译：细胞核与细胞质事件第三部分 转录与翻译：细胞核与细胞质事件 1995

A 核受体 1997

244．核受体共激活因子 1999

245．在核受体介导的抑制中的辅阻遏物 2005

246．类固醇激素受体信号 2015

247．COUP-TFII在先天性横隔膜疝气中的作用 2021

248．黑腹果蝇中的核受体 2027

B 转录因子 2039

249．JAK-STAT信号 2041

250．FOXO转录因子：PI3K-Akt通路的关键靶点，调节细胞增殖、存活及机体衰老 2049

251．转录因子AP-1的多基因家族 2059

252．NFkB：细胞信号的关键整合者 2069

253．通过cAMP应答激活因子CREB的转录调节 2077

254．NFAT家族：结构、调节及生物学功能 2083

255．泛素／蛋白酶体 2093

256．Smad蛋白 2099

C 损伤／应激反应 2105

257．压力信号的复杂性 2107

258．在大肠杆菌SOS反应中的信号转导 2127

259．氧化压力与自由基信号转导 2137

260．利用啤酒酵母鉴别DNA双链损伤信号必需基因的筛选方法 2145

261．果蝇的辐射应答 2159

262．由非同源性末端联结介导的双链断裂识别及其修复 2165

263．保护基因组完整性的ATM介导信号 2171

264．由基因毒性和非基因毒性压力激活通路介导的p53肿瘤抑制信号 2185

265．总调节者p53及其与靶序列互作的规则 2205

266．Abl酪氨酸激酶的细胞核及胞浆功能 2217

267．射线诱导的细胞质信号 2225

268．热休克反应及错误折叠蛋白的应激反应 2231

269．缺氧介导的信号通路 2241

270．细胞压力对mRNA降解的调节 2247

271．癌基因的应激反应 2257

272．泛素及FANC应激反应 2265

273．应激与γ-H2AX 2273

D 转录后控制 2283

274．氨基酸与能量对翻译的控制 2285

275．翻译控制与胰岛素信号 2295

276．内质网与氧化压力：疾病的暗示 2301

277．mRNA降解的调节 2311

278．胞质中的多腺苷化信号与翻译 2317

279．无脊椎动物发育中的翻译控制 2323

280．选择性剪接在细胞周期与程序性细胞死亡中的作用 2329

281．介导mRNA招募核糖体的翻译控制的信号通路 2335

E 染色质及其修饰 2343

282．SWI/SNF及RSC核小体重塑复合体 2345

283．ISWI染色质重塑复合体 2357

284．INO80染色质重塑复合体 2363

285．组蛋白乙酰化复合体 2369

286．由磷酸化和去磷酸化实现的组蛋白脱乙酰酶活性及功能调节 2379

287．组蛋白甲基化：化学惰性的但是染色质动态的 2389

288．组蛋白磷酸化：将细胞信号通路与核功能调控联系起来的染色质修饰 2399

289．组蛋白变种：信号还是结构模块？ 2409

290．啤酒酵母中沉默染色质的形成与调节 2427

291．在果蝇与人中由Polycomb复合体介导的染色质修饰与基因沉默 2437

292．组蛋白泛素化 2449

293．染色质介导的先天免疫及炎症中的基因表达控制 2461

导读版第⑦卷 细胞内功能区隔信号转导、胞间和细胞基质间的相互作用、疾病病理学第四部分 细胞内功能区信号转导 2467

294．内质网中的蛋白质量控制 2471

295．线粒体中的质量控制与保证 2477

296．过氧化物酶体中的蛋白质量控制：过氧化物酶体目标信号受体的泛素化 2489

297．线粒体动力学：融合与分离 2499

298．SREBP通路：通过固醇感应及门控蛋白运输实现的基因调控 2505

299．通过未折叠蛋白反应调节内质网的功能 2511

300．从线粒体到胞浆及核的信号通路 2527

301．凋亡信号：走向完结的手段 2535

302．细胞周期过程调节 2545

303．细胞器分裂及遗传中的信号：过氧化物酶体 2555

304．核包被中的信号 2563

305．肌动蛋白动力学与胞吞作用的双向交流 2571

306．自噬相关通路信号 2583

第五部分 细胞-细胞及细胞-基质互作 2589

307．细胞-细胞及细胞-基质互作概述 2591

308．脉管系统中的互作信号通路 2593

309．心脏形成中的信号通路 2601

310．胰腺发生中的调节信号：胰腺癌中异常信号的暗示 2611

311．胃肠管道中肠激素的营养效应 2621

312．神经营养因子 2631

313．骨中的细胞-细胞及细胞-基质互作 2647

314．睾丸及卵巢中的细胞-细胞信号 2663

315．T淋巴细胞中的信号转导 2679

316．由B细胞抗原受体介导的信号转导：B细胞生物学的主要调节因子 2689

317．正常与增生的乳腺中的信号通路 2699

318．肾脏 2707

319．在造血过程中调节细胞存活、增殖和分化的细胞因子及细胞因子受体 2733

320．调节成体干细胞生长及分化的信号通路 2743

321．体细胞网络信号图景 2753

第六部分 疾病病理学：转化启示 2759

322．Ras家族小GTPase在乳腺癌中的作用 2763

323．前列腺癌中基质与上皮细胞相互作用的转化医学启示及干细胞／前体细胞的潜在功能 2773

324．胰腺癌中的异常信号通路：靶向治疗的机遇 2783

325．液态骨髓分隔物中多重骨髓瘤细胞克隆的进化与保留：治疗的暗示 2799

326．骨髓环境的病理生理学功能及其在多重骨髓瘤中的微环境 2811

327．骨髓性白血病的信号靶点 2821

328．淋巴性白血病的信号靶点 2831

329．以Ras为靶点探索抗癌药物 2837

330．以EWS/FLI1驱动的信号通路作为针对Ewing's家族性肉瘤的治疗靶点 2859

331．中枢及周围组织中的IRS蛋白骨架及胰岛素／IGF活性 2873

332．脂肪动员信号：肥胖症的暗示 2885

333．以血管生成信号为癌症治疗的靶点 2895

334．间质性肺病中的CXC趋化因子信号 2907

335．系统性硬化症 2913

336．类风湿性关节炎及系统性红斑狼疮中的信号转导 2919

337．脉管炎中的转化概念 2933

338．在理解炎症性肠道疾病病理方面的进展 2945

339．蛋白组学的转化医学启示 2959

340．microRNA在临床诊断与治疗中的转化医学启示 2965

索引 2983