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第一章 绪论 1

一、生物化学概念 1

二、生物化学研究内容 2

三、生物化学发展简史 3

四、生物化学应用简述 4

五、生物化学学习方法 5

第二章 核酸的化学 6

第一节 细胞内的遗传物质 6

第二节 核酸的种类与分布 7

一、核酸的种类 7

二、核酸的分布 8

三、核酸的组成 8

第三节 DNA的结构与功能 12

一、DNA的一级结构与功能 12

二、DNA的二级结构（双螺旋模型） 14

三、DNA二级结构的其他形式 16

四、真核生物的染色体 18

第四节 RNA的结构与功能 20

一、RNA的分类 21

二、RNA的结构与功能 21

第五节 核酸的理化性质 26

一、核酸的化学水解 26

二、核酸的紫外吸收性质 27

三、核酸的变性、复性与分子杂交 27

第三章 蛋白质化学 31

第一节 蛋白质概述 31

一、蛋白质的概念 31

二、蛋白质的生物学功能 32

三、蛋白质的分类 33

第二节 蛋白质的组成单位——氨基酸 34

一、氨基酸的基本结构和分类 34

二、氨基酸的理化性质 40

第三节 肽 45

一、肽键 45

二、多肽链 46

三、生物活性肽 47

第四节 蛋白质结构 48

一、蛋白质的一级结构 48

二、蛋白质的空间结构 49

三、蛋白质结构与功能的关系 58

第五节 蛋白质的理化性质 62

一、蛋白质的相对分子质量 62

二、蛋白质的两性电离及等电点 62

三、蛋白质的胶体性质 63

四、蛋白质的紫外吸收与呈色反应 63

五、蛋白质的变性及复性 64

六、蛋白质的免疫化学性质 65

第四章 酶 68

第一节 酶的基本概念和作用特点 68

一、酶是生物催化剂 68

二、酶催化作用的特点 69

三、酶的专一性类型 70

第二节 酶的命名和分类 71

一、酶的命名 71

二、酶的分类与编号 72

第三节 酶的组成与结构 73

一、酶的组成 73

二、酶的结构 74

第四节 酶的作用机制 76

一、酶的催化作用本质 76

二、酶与底物的结合 78

三、酶高效催化的机制 79

四、酶作用机制举例——胰凝乳蛋白酶 81

第五节 酶促反应动力学 84

一、酶浓度对酶促反应速率的影响 84

二、底物浓度对酶促反应速率的影响 84

三、pH对酶促反应速率的影响 89

四、温度对酶促反应速率的影响 90

五、激活剂对酶促反应速率的影响 91

六、抑制剂对酶促反应速率的影响 91

第六节 酶活力测定 95

一、酶活力 95

二、酶活力测定的基本原则 95

三、酶活力的表示 96

四、酶活力追踪 96

第七节 变构酶、同工酶、诱导酶 97

一、变构酶 97

二、同工酶 99

三、诱导酶 100

第八节 维生素和辅酶 101

一、水溶性维生素 101

二、脂溶性维生素 111

第五章 糖类代谢 116

第一节 新陈代谢概述 116

一、新陈代谢的概念 116

二、新陈代谢的研究 117

第二节 双糖和多糖的酶促降解 118

一、双糖的酶促降解 118

二、多糖的酶促降解 119

第四节 糖酵解 121

一、糖酵解的过程 121

二、糖酵解产生的ATP与生物学意义 126

三、丙酮酸的去路 126

四、糖酵解的调控 129

五、糖酵解的其他底物 129

第五节 三羧酸循环 130

一、丙酮酸氧化为乙酰CoA 130

二、三羧酸循环的过程 132

三、三羧酸循环的化学计量和特点 136

四、三羧酸循环的生物学意义 136

五、草酰乙酸的回补反应 137

六、三羧酸循环的调控 138

第六节 磷酸戊糖途径 138

一、磷酸戊糖途径的过程 139

二、磷酸戊糖途径的化学计量 143

三、磷酸戊糖途径的生物学意义 143

四、磷酸戊糖途径的调控 144

第七节 糖的生物合成 144

一、葡萄糖异生作用 144

二、蔗糖的生物合成 147

三、淀粉的生物合成 148

四、糖原的生物合成 149

五、纤维素的生物合成 150

第六章 生物氧化及氧化磷酸化 151

第一节 生物氧化 151

一、生物氧化概述 151

二、生物化学反应的自由能变化 153

三、高能化合物与ATP的作用 155

第二节 呼吸链（电子传递链） 158

一、线粒体 158

二、电子传递链的组成 160

三、专一性电子传递抑制剂 165

四、细胞质基质NADH进入线粒体的穿梭机制 166

第三节 氧化磷酸化作用 167

一、氧化磷酸化的概念及类型 167

二、电子传递与磷酸化的偶联 168

三、氧化磷酸化机制 169

四、氧化磷酸化的解偶联剂和抑制剂 171

第七章 脂质代谢 174

第一节 脂肪的分解代谢 174

一、脂肪的酶促降解 174

二、甘油的氧化 175

三、脂肪酸的分解 175

四、乙酰辅酶A的转化 181

第二节 脂肪的合成代谢 185

一、脂肪酸的生物合成 185

二、脂肪的生物合成 192

第三节 磷脂、糖脂和胆固醇的代谢 193

第八章 蛋白质降解及氨基酸代谢 194

第一节 蛋白质的酶促降解 194

一、蛋白质水解酶 194

二、蛋白质降解的场所 195

第二节 氨基酸的降解与转化 197

一、脱氨基作用 197

二、脱羧基作用 202

三、氨基酸分解产物的去向 203

四、氨基酸转化为其他生物物质 208

第三节 氨基酸的生物合成 209

一、生物固氮 209

二、硝酸还原作用 211

三、氨的同化 212

四、氨基酸的生物合成 214

五、SO4 2-的还原 221

六、一碳基团代谢 222

第九章 核酸降解和核苷酸代谢 224

第一节 核酸的酶促降解 224

一、核酸外切酶 225

二、核酸内切酶 225

第二节 核苷酸的降解 226

一、嘌呤的降解 227

二、嘧啶的降解 228

第三节 核苷酸的生物合成 229

一、嘌呤核苷酸的生物合成 229

二、嘧啶核苷酸的生物合成 233

三、脱氧核糖核苷酸的生物合成 235

四、核苷三磷酸的生物合成 236

第十章 DNA的生物合成 239

第一节 DNA复制概述 239

一、DNA半保留复制 239

二、DNA复制的起点与方向 240

三、DNA复制的方式 241

四、DNA的半不连续复制 243

五、DNA复制的化学反应 244

六、DNA复制的体系 244

第二节 原核生物的DNA复制 249

一、原核生物复制的起始 249

二、原核生物复制的延伸 250

三、原核生物复制的终止 251

四、DNA复制的保真性 252

第三节 真核生物DNA的复制 253

一、真核生物DNA复制的特点 253

二、真核生物的DNA聚合酶 254

三、真核生物染色体端粒的复制 255

第四节 逆转录 257

第五节 DNA的损伤修复与基因突变 258

一、DNA的损伤修复 258

二、基因突变 260

第六节 PCR技术 262

第十一章RNA的生物合成 264

第一节 转录概述 264

一、转录的基本特点 264

二、转录单元 265

第二节 RNA的生物合成 266

一、原核生物启动子的结构特征 266

二、原核生物的RNA聚合酶 266

三、原核生物的转录过程 268

四、真核生物与原核生物转录的区别 271

第三节 转录后的加工与修饰 273

一、mRNA前体的转录后加工 273

二、rRNA前体的转录后加工 275

三、tRNA前体的转录后加工 275

第四节 RNA转录的抑制 276

第十二章 蛋白质的生物合成 278

第一节 蛋白质生物合成体系 278

一、mRNA 278

二、tRNA 284

三、核糖体 285

四、氨酰tRNA合成酶 287

五、其他翻译因子 289

第三节 蛋白质的生物合成 290

一、原核生物多肽链合成的起始 290

二、原核生物翻译的延伸 292

三、原核生物翻译的终止 295

四、真核生物蛋白质合成 297

第四节 蛋白质前体的加工修饰 298

一、起始氨基酸的切除 299

二、肽链N端引导序列的切除 299

三、肽链内部的切割裂分 299

四、二硫键的形成 299

五、氨基酸侧链的修饰 299

六、分子伴侣 301

第五节 蛋白质合成的调节 301

第六节 蛋白质合成后的运输 301

第十三章 物质代谢的调节 303

第一节 物质代谢途径间的相互联系 303

一、糖类代谢与脂质代谢的相互联系 303

二、糖类代谢与蛋白质代谢的相互联系 304

三、脂质代谢与蛋白质代谢的相互联系 304

四、核酸代谢与糖类、脂质和蛋白质代谢的相互联系 305

第二节 物质代谢调节的主要方式 306

一、酶水平的调节 306

二、细胞内区域化的调节 317

三、能荷对代谢的调节作用 317