细菌分子遗传学 原书第5版PDF电子书下载

1核酸的结构和功能 1

1.1核酸结构 1

1.1.1 DNA 1

1.1.2 RNA 2

1.1.3疏水作用 3

1.1.4双螺旋的不同形式 3

1.1.5超螺旋 4

1.1.6变性与杂交 6

1.1.7核苷酸链的方向 7

1.2 DNA复制 8

1.2.1解链和复性 9

1.2.2复制保真；校对 9

1.3染色体复制和细胞分裂 10

1.4 DNA修复 13

1.4.1错配修复 13

1.4.2切除修复 14

1.4.3重组（复制后）修复 14

1.4.4 SOS修复 16

1.5基因表达 16

1.5.1转录 16

1.5.2翻译 19

1.5.3翻译后事件 23

1.6基因组织 25

2突变与变异 27

2.1变异与进化 27

2.1.1彷徨变异实验 28

2.1.2影印平板法 30

2.1.3细菌的定向突变 31

2.2突变的类型 31

2.2.1点突变 31

2.2.2条件性突变 33

2.2.3大片段DNA改变造成的变异 33

2.2.4染色体外遗传因子及水平基因转移 34

2.3重组 34

2.3.1一般性（同源）重组过程的模型 34

2.3.2重组过程中的酶 36

2.4表型 36

2.4.1表型修复 38

2.5突变的机制 40

2.5.1自发突变 40

2.5.2化学诱变剂 42

2.5.3紫外线照射 43

2.6突变体的分离与鉴定 45

2.6.1突变与筛选 45

2.6.2影印平板法 46

2.6.3其他类型突变株的分离 47

2.6.4分子生物学方法 47

3基因的表达调控 51

3.1基因拷贝数 52

3.2转录控制 52

3.2.1启动子 52

3.2.2终止子，衰减子及反终止子 60

3.2.3诱导和抑制：调节蛋白 60

3.2.4双组分调节系统 67

3.2.5全局调节系统 69

3.2.6群体感应 70

3.3翻译控制 73

3.3.1核糖体结合 73

3.3.2密码子用法 74

3.3.3应急反应 75

3.3.4调节性RNA 75

3.4相位变异 82

4噬菌体遗传学 83

4.1噬菌体的结构 84

4.2单链DNA噬菌体 85

4.2.1？X174 85

4.2.2 M13 87

4.3 RNA噬菌体：MS2 87

4.4双链DNA噬菌体 88

4.4.1 T4噬菌体 88

4.4.2 λ噬菌体 89

4.4.3 λ噬菌体的裂解和溶源调控 94

4.5限制和修饰 98

4.6细菌对噬菌体攻击的抗性 100

4.7互补和重组 100

4.8噬菌体为何如此重要 102

4.8.1噬菌体分型 102

4.8.2噬菌体治疗 103

4.8.3噬菌体展示 103

4.8.4自然环境中的噬菌体 104

4.8.5细菌毒力和噬菌体转化 105

5质粒 107

5.1质粒所决定的一些细菌特性 107

5.1.1抗生素抗性 107

5.1.2大肠杆菌素和细菌素 108

5.1.3毒力决定簇 108

5.1.4植物相关细菌的质粒 109

5.1.5代谢活性 109

5.2质粒的分子特性 110

5.2.1质粒的复制和控制 112

5.2.2分配 119

5.2.3宿主范围 120

5.2.4质粒不相容性 121

5.3质粒的稳定性 122

5.3.1质粒完整性 122

5.3.2分配 123

5.3.3生长率差异 126

5.4与表型相关的质粒 127

6基因转移 129

6.1转化 129

6.2接合 130

6.2.1接合的机制 132

6.2.2 F质粒 134

6.2.3其他细菌的接合 135

6.3转导 138

6.3.1特异性转导 138

6.4重组 140

6.4.1重组的结果 140

6.4.2位点特异性和非同源（异常）重组 142

6.5嵌合基因和染色体的可塑性 142

7基因组的适应性：可移动的基因和相位变化 144

7.1插入序列 144

7.1.1插入序列的结构 144

7.1.2插入序列的出现 145

7.2转座子 146

7.2.1转座子的结构 147

7.2.2整合子 149

7.2.3 ISCR元件 151

7.3转座的机制 151

7.3.1复制性转座 151

7.3.2非复制性（保守性）转座 154

7.3.3转座的调节 154

7.3.4转座元件引起的基因激活 155

7.3.5 Mu：一种转座噬菌体 155

7.3.6接合转座子 156

7.4相位变化 156

7.4.1简单的DNA倒位介导的变化 157

7.4.2巢式DNA倒位介导的变化 159

7.4.3淋球菌的抗原变异 160

7.4.4滑链错配导致的相位变化 161

7.4.5不同的DNA甲基化介导的相位变化 162

7.5规律性成簇的间隔短回文重复 163

8遗传修饰：细菌潜能的开发 165

8.1菌株的改良 165

8.1.1变异的产生 165

8.1.2目标变异菌株的筛选 166

8.2初级代谢产物的过量产生 166

8.2.1简单途径 166

8.2.2分支途径 167

8.3次级代谢产物的过量产生 169

8.4基因克隆 169

8.4.1 DNA的剪切与连接 170

8.4.2质粒载体 171

8.4.3 λ噬菌体载体 174

8.4.4大片段的克隆 175

8.4.5 M13噬菌体载体 176

8.5基因文库 176

8.5.1基因组文库的构建 177

8.5.2基因文库的筛选 178

8.5.3 PCR产物的克隆 179

8.5.4 cDNA文库的构建 180

8.6克隆基因的表达 181

8.6.1表达载体 181

8.6.2新基因的获得 182

8.6.3其他的细菌宿主 184

8.6.4新疫苗 186

8.7基因技术的其他应用 186

9细菌研究的遗传学方法 187

9.1代谢途径 187

9.1.1互补 187

9.1.2营养共生 188

9.2微生物生理学 189

9.2.1报道基因 190

9.2.2染色质免疫沉淀 191

9.2.3细胞分裂 192

9.2.4移动性和趋化性 193

9.2.5细胞分化 194

9.3细菌毒力 197

9.3.1细菌致病的全面机制 197

9.3.2毒力基因的发现 198

9.4特异性突变 204

9.4.1基因替代 204

9.4.2反义RNA 205

9.5分类学、进化和流行病学 206

9.5.1分子分类 206

9.5.2 GC含量 206

9.5.3 16S rRNA 206

9.5.4变性梯度凝胶电泳和温度梯度凝胶电泳 208

9.5.5应用PCR进行诊断 208

9.5.6分子流行病学 209

10基因组的基因定位及其他 214

10.1基因定位 214

10.1.1接合分析 214

10.1.2基因文库 216

10.1.3限制作图和脉冲场电凝胶电泳 217

10.2 DNA序列分析 217

10.2.1 Sanger测序法 218

10.2.2染料终止法测序 220

10.2.3焦磷酸测序 221

10.2.4大规模平行测序 221

10.3基因组测序 223

10.3.1基因组测序策略 223

10.3.2功能相关的序列 224

10.3.3宏基因组学 228

10.4比较基因组学 229

10.4.1微阵列 231

10.5基因表达分析 232

10.5.1转录分析 232

10.5.2翻译分析 236

10.6代谢组学 238

10.7系统生物学和合成基因组学 239

10.7.1系统生物学 239

10.7.2合成基因组学 239

10.8结论 240

A补充书目 241

B常用缩写 245

C词汇表 249

D酶及其他蛋白质 261

E基因 265

F标准遗传密码 269

G菌种 271