绪论 1
1.1 问题的提出 2
1.2 研究现状 5
1.3 核心概念的界定 25
1.4 研究意义 43
1.5 研究方法和思路 44
历史与现状 院系学术组织设置的历程与反省 49
2.1 现代大学院系学术组织设置的变迁历程 49
2.2 我国大学院系学术组织设置的现状审视 65
逻辑与理论 院系学术组织设置改革的依据 82
3.1 学科逻辑：知识的分化与融合 82
3.2 管理逻辑：知识管理与科层管理 98
3.3 理论基石：院系设置改革的工具 110
取向与原则 院系学术组织设置改革的基本构想 116
4.1 研究型大学的特征探析 117
4.2 院系学术组织设置改革的价值取向 120
4.3 院系设置改革的基本原则 125
理想与现实 院系学术组织设置的模式与实践 132
5.1 大学院系学术组织设置的理想模式 133
5.2 中国大学院系设置的实践探索：多个案例的分析 155
5.3 大学院系学术组织设置的反思 169
冲突与和谐 跨学科学术组织的成长逻辑与生态学治理 176
6.1 大学跨学科学术组织的成长逻辑 176
6.2 大学跨学科学术组织的生态学治理 187
6.3 大学跨学科学术组织的生态学治理路径 192
余论 196
7.1 研究反思 196
7.2 中国研究型大学院系学术组织设置的未来走向 198
7.3 本研究的创新与不足 203
参考文献 205
附录1 访谈提纲 221
附录2 浙江大学院系设置图 223
附录3 华中科技大学院系设置图 225
附录4 北京师范大学院系设置图 226
附录5 华中科技大学学术机构设置细则（2012年） 227
旅行与学术研究（后记） 230