目录 1
译者的话 1
第1篇 作为信息库的DNA 2
第1章 DNA是遗传物质 (杨秀琴 译) 2
遗传由大分子实现 2
序言 (吴经才 译) 3
蛋白质藉构象起作用 3
第1版序言 (吴经才 译) 4
蛋白质如何获得正确的构象 9
DNA的发现 11
DNA(几乎)是普遍的遗传物质 13
DNA的组成成分 15
DNA是双螺旋 18
DNA的半保留复制 19
补充读物 23
第2章 染色体携带基因 (杨秀琴 译) 24
基因的发现 24
染色体在遗传中的作用 28
每个基因都位于一个特定的染色体上 31
基因在染色体上呈线性排列 32
线性遗传图 36
一个基因一种蛋白质 37
顺反子的确切定义 39
有关术语的注解 41
补充读物 42
第3章 突变改变DNA序列 (杨秀琴 译) 43
遗传密码的三联体译读方式 43
点突变改变单个碱基对 46
突变集中在热点上 47
突变率 51
补充读物 53
第4章 核酸拓扑学 (杨秀琴 译) 54
单链核酸的二级结构 54
反向重复和二级结构 57
双链体DNA的互变双螺旋结构 59
左手螺旋型DNA 61
闭合的DNA能形成超螺旋 62
超螺旋影响双螺旋结构 65
DNA的变性和复性 66
碱基配对与核酸杂交 67
补充读物 68
第5章 分离基因 (董振芳 译) 69
限制酶将DNA切成专一性片段 70
用DNA片段作限制图 72
限制性部位可用作遗传标记 75
DNA的序列测定 79
原核生物基因和蛋白质的共线性 82
真核生物基因的间断性 82
某些DNA序列编码一种以上的蛋白质 84
模型所涉及的范围 86
补充读物 87
第2篇 从基因到蛋白质 90
第6章 遗传密码的破译 (董振芳 译) 90
蛋白质的单向合成 91
寻找信使RNA 91
转移RNA是转接子(adaptor) 92
核糖体结队行进 93
大多数密码子代表氨基酸 97
密码是否是通用的 99
补充读物 100
第7章 蛋白质合成的装配线 (董振芳 译) 101
核糖体的作用部位 101
多肽链的开始 103
起始转译需要30S亚基及辅助因子 104
30S亚基的短暂游离受IF3控制 106
IF2选出起始tRNA 107
真核生物转译的起始与多种因子有关 108
延伸——T因子将氨酰tRNA带进A部位 110
易位移动核糖体 112
终止——蛋白质合成的3个终止密码子 115
补充读物 116
第8章 转移RNA是转译过程的转接子 (董振芳 译) 117
通用的三叶草构象 117
呈L形的三级结构 119
合成酶如何识别tRNA? 122
合成氨酰tRNA过程中的识别作用 123
密码子-反密码子识别的变偶现象 125
tRNA含有许多修饰碱基 127
碱基修饰可以控制密码子的识别 129
线粒体具有最低数量的tRNA 131
突变型tRNA译读不同的密码子 131
抑制基因tRNA与正常氨酰tRNA竞争密码子 134
tRNA对读码的影响 137
补充读物 138
第9章 核糖体转译工厂 (董振芳 译) 139
核糖体是致密的核糖核蛋白颗粒 139
核糖体蛋白与rRNA的相互作用 143
摸拟体内装配过程的体外重建实验 146
亚基装配涉及拓扑学 148
突变可以改变核糖体的所有成分 149
核糖体有若干活性中心 151
转译的精确性 154
补充读物 155
第10章 信使RNA模板 (董振芳 译) 156
细菌信使的短暂性 156
大部分细菌mRNA是多顺反子 157
多顺反子信使的转译 159
真核生物mRNA功能成分的确定 161
体外转译系统的能力 162
真核生物mRNA3′末端的多聚腺苷化 164
所有真核生物mRNA的5′端都有一个甲基化帽子 166
起始作用可能与mRNA和rRNA间的碱基配对有关 167
真核生物核糖体小亚基可移动到mRNA的起始部位 170
蛋白质合成与细胞定位的关系 171
补充读物 175
第3篇 制造模板 178
第11章 RNA聚合酶——基本的转录装置 (吴经才 译) 178
RNA聚合酶对转录的催化作用 178
σ因子对RNA聚合酶与DNA结合的控制 180
合成RNA的核心酶 183
真核生物复杂的RNA聚合酶 186
补充读物 187
第12章 启动区——控制起始的部位 (吴经才 译) 188
大肠杆菌RNA聚合酶的结合部位 190
大肠杆菌启动区的共有序列 192
共有序列的功能 194
σ因子的置换可以控制起始作用 196
RNA聚合酶Ⅱ的启动区在起始点上游 201
多位分布的RNA聚合酶Ⅱ的启动区 204
增强区是有助于起始作用的双向元件 206
RNA聚合酶Ⅲ的下游启动区 208
补充读物 210
第13章 终止作用和抗终止作用 (吴经才 译) 211
大肠杆菌中涉及回文对称的两种终止方式 212
p因子如何起作用? 213
依赖特异性部位的抗终止作用 215
RNA聚合酶是否需要更多的亚基? 220
真核生物中的难题 221
补充读物 222
第4篇 原核生物基因表达的控制 226
第14章 操纵子——乳糖模型 (吴经才 译) 226
诱导和阻遏受小分子物质的控制 226
调节基因控制着结构基因 227
操纵子的控制回路 229
组成型突变解释了阻遏物的作用 230
顺式显性的操纵区 231
启动区或阻遏物的非诱导型突变 233
阻遏物如何阻止转录 233
操纵区中的接触部位 234
阻遏物亚基的相互作用 236
作为DNA结合蛋白的阻遏物 237
阻遏物从DNA上的脱落 238
剩余阻遏物的储存 240
诱导作用的矛盾统一 241
补充读物 242
第15章 控制回路——操纵子的防卫设施 (吴经才 译) 243
正控制和负控制的区别 243
色氨酸操纵子的可阻遏性 245
色氨酸操纵子受衰减作用的控制 247
互变的二级结构控制着衰减作用 247
衰减作用的普遍性 253
阻遏作用可以发生在多个基因座位上 255
分解代谢物阻遏涉及启动区的正调节 256
核糖体蛋白转译的自体控制 258
自体控制和大分子的装配 261
不利环境引起严紧型反应 262
补充读物 263
第16章 溶菌级联和溶源阻遏 (吴经才 译) 265
受级联控制的溶菌发育 265
噬菌体T7和T4的功能基因簇 267
λ的溶菌级联依靠抗终止作用 270
自体调节回路维持溶源性 271
在每一操纵区上阻遏物是协同结合的二聚体 274
阻遏物的合成是怎样建立的 280
溶菌侵染需要抗阻遏物 282
溶源和溶菌的微妙平衡 284
补充读物 285
第5篇 真核生物基因组的组成 288
第17章 DNA工程学的卓越力量 (林锦湖 译) 288
任何DNA序列都能在细菌里克隆 288
嵌合DNA的构建 290
由mRNA拷贝出DNA 293
从基因组分离特定的基因 294
染色体步查 296
真核生物基因能在细菌中转译 298
补充读物 299
描述基因组大小变化的C值矛盾 300
第18章 真核生物基因组——序列的连续统一体 (林锦湖 译) 300
依赖序列复杂度的复性动力学 302
真核生物基因组含有的几种序列组分 304
非重复DNA的复杂度可以估算基因组大小 305
真核生物基因组含有重复序列 306
中度重复DNA由许多不同序列组成 307
重复序列家族的成员彼此相关但并不相同 308
补充读物 310
第19章 体现在mRNA中的结构基因 (林锦湖 译) 311
大多数结构基因位于非重复DNA中 312
非重复基因得到表达的量 313
用RNA驱动反应动力学参数估计基因数目 314
基因表达的水平差异极大 316
mRNA群体之间的重叠 317
补充读物 319
第20章 间断基因的组构 (林锦湖 译) 320
间断基因的电镜观察 321
间断基因的限制图谱 324
基因组DNA片段的鉴定 327
形式和大小不一的基因 328
编码rRNA和tRNA的基因的内含子 330
外显子-内含子接界存在共有序列 331
一基因的内含子可以是另一基因的外显子 332
突变大多定位于外显子内 335
复合座位极大且参与调控 338
间断基因如何进化? 342
补充读物 346
第6篇 相关序列成簇排列 348
第21章 结构基因属于基因家族 (静天玉 译) 348
珠蛋白基因构成两个基因簇 349
基因簇因不等交换而重排 351
许多α地中海贫血症是不等交换的结果 352
β地中海贫血症产生的新基因 353
基因簇不断重新组构 355
以序列趋异度区别DNA中的两种部位 356
用进化钟追踪珠蛋白基因的发展 358
维持活性序列的机制 360
假基因是进化的死胡同 361
大量存在的蛋白质常由基因家族编码 362
补充读物 364
第22章 细胞器基因组 (静天玉 译) 365
细胞器基因表现非孟德尔遗传 365
细胞器基因组是环状DNA分子 366
细胞器自身基因的表达 367
酵母线粒体大基因组 370
哺乳动物紧凑的线粒体基因组 371
(某些)细胞器DNA的重组 373
酵母线粒体DNA的重排 374
补充读物 375
第23章 串联基因簇的同源性和突变 (静天玉 译) 376
为组蛋白编码的各种串联基因簇 377
rRNA和tRNA基因是重复基因 379
一个串联重复单位包含两种rRNA基因 380
某些rRNA基因是染色体外基因 382
关于非转录间隔和启动区 383
5S基因和假基因是分散基因 384
进化的困境 385
细菌rRNA基因与tRNA基因形成混合操纵子 386
tRNA基因可以成簇存在 387
补充读物 388
第24章 简单序列DNA的组构 (静天玉 译) 389
卫星DNA属于高度重复DNA 389
卫星DNA经常位于异染色质上 390
节肢动物卫星DNA有极短的同源重复 391
哺乳动物卫星DNA由不同层次的重复单位组成 392
小鼠卫星DNA进化阶段的再现 395
现有重复单位的突变 398
不等交换的结果 398
交换固定是维持同源重复的原因 400
补充读物 401
第7篇 RNA的加工成熟 404
第25章 稳定RNA的切割和修整 (王立 译) 404
磷酸二酯键的两种酶切方式 405
RNA酶Ⅲ释放噬菌体T7的早期mRNA 405
RNA酶Ⅲ从rRNA前体切下rRNA 408
真核生物前体RNA释放rRNA时的切割部位 409
几种酶对tRNA的切割和修整 410
补充读物 412
第26章 RNA是催化剂——RNA的剪接机制 (王立 译) 414
酵母tRNA剪接过程的切割与重新连接 414
四膜虫rRNA的异常剪接 418
RNA是催化剂——生物化学催化作用的扩充 420
可以编码调节蛋白的内含子 421
核RNA按最佳途径进行剪接 426
共有序列的突变影响剪接 428
细胞核RNA的剪接接界可以互换 430
snRNA是否与剪接有关? 432
补充读物 436
大而不稳定的hnRNA 438
第27章 RNA加工的控制 (董振芳 译) 438
mRNA来自hnRNA 440
多聚腺苷酸化及3′末端的产生 442
比mRNA更复杂的hnRNA 444
转录后还存在控制吗? 445
控制基因表达的模型 446
细胞多蛋白的潜力 449
补充读物 451
第8篇 DNA的包装 454
第28章 基因组和染色体 (静天玉 译) 454
病毒基因组于衣壳中的凝缩 455
细菌基因组是具有许多超螺旋回环的核质体 459
分裂间期染色质和有丝分裂染色体的比较 461
真核生物染色体是有丝分裂的分离装置 464
灯刷染色体的伸展状态 468
多线巨大染色体 470
转录使染色体结构松散 471
补充读物 473
第29章 染色质结构——核小体 (静天玉 译) 474
染色质的蛋白质组分 474
染色质含有非连续性颗粒 476
核小体是一切染色质的亚单位 477
极其保守的核心颗粒 479
DNA盘绕在组蛋白八聚体的周围 481
核酸酶对DNA的作用是对称的 483
有关DNA结构周期的悬而未决的问题 485
组蛋白和DNA的排列 486
核小体是否呈定相排列 488
核小体在染色质纤维中的排列方式 492
回环、结构域和骨架 494
补充读物 495
第30章 活性染色质的特性 (静天玉 译) 496
核小体的装配与染色质的再生 496
核小体的装配需要非组蛋白 500
被转录的基因是否在核小体中组构? 501
对DNA酶敏感的可转录染色质的结构域 504
非组蛋白造成染色质对DNA酶的敏感性 506
组蛋白的瞬间修饰 508
在核小体的一个亚单位上H2A与泛素的结合 510
基因表达与脱甲基化的关系 511
控制甲基化的一些模型 513
DNA酶超敏部位位于活化启动区的上游 514
核小体无超敏部位 517
有关基因活化性质的推测 520
补充读物 521
第9篇 永恒的DNA 524
第31章 复制子——DNA复制单位 (静天玉 译) 524
连续复制形成复制眼 525
细菌基因组是一个复制子 527
复制与细胞周期的联系 528
真核生物染色体含多个复制子 530
分离酵母复制子的起点 532
复制眼、滚环或D环是实现复制的几种形式 533
质粒不相容性与拷贝数的关系 537
补充读物 540
第32章 DNA的复制装置 (静天玉 译) 541
真核生物的DNA聚合酶 542
原核生物的DNA聚合酶有多种酶学活性 542
DNA的半间断合成 546
曲RNA引发冈崎片段的合成 548
细菌复制装置的复杂性 551
单链DNA的起始合成 552
引物体的移动 554
在双链体起点上起始复制 557
T4噬菌体的复制装置 561
T7噬菌体的复制装置 563
线性复制子所存在的问题 563
补充读物 566
第33章 DNA的防卫系统 (静天玉 译) 567
限制及修饰作用的运用 568
Ⅰ型酶的其他活性 570
Ⅲ型酶的双重活性 573
对损伤DNA的处理 574
大肠杆菌的切补系统 577
大肠杆菌的重组修复系统 579
许多基因的SOS反应系统 580
哺乳动物的修复系统 582
补充读物 583
第34章 DNA重组和其他拓扑学变换 (静天玉 译) 584
DNA的拓扑学变换 584
促旋酶使DNA产生负超螺旋 588
重组作用要求同源双链体DNA发生联会 589
断裂和复合与异源双链体DNA有关 590
双链DNA的断裂能起始重组作用吗? 593
重组中间体的分离 595
RecA的链交换装置 596
RecA和重组条件 598
基因转换是等位基因重组的原因 600
特殊重组识别特异性序列 602
核心的交错断裂与复合 603
补充读物 606
第10篇 动态基因组:状态变化不定的DNA 608
第35章 细菌的转座因子 (蒋如璋 译) 608
细菌中转座作用的发现 609
插入序列是基本的转座子 610
复合转座子具有IS组件 611
只有一个Tn10的组件是有功能的 614
序列几乎同源而功能相差很大的Tn5组件 615
转座与复制重组有关 616
通过共合体解离实现Tn3转座 619
转座噬菌体Mu的一些特殊性质 621
倒位引起沙门氏杆菌的相变 623
补充读物 625
第36章 真核生物的可移动遗传因子 (蒋如璋译) 626
与细菌的转座子相似的酵母Ty因子 627
果蝇中的几类转座因子 628
转座因子在杂种不育过程中的作用 630
转座是逆病毒生活史的一部分 632
逆病毒可以转导细胞DNA 635
在细胞中可能发生依赖于RNA的转座过程 636
Alu家族 637
玉米控制因子是可转座的 638
Ds因子可以转座或引起染色体断裂 640
Ds转座与DNA复制衔接 642
酵母具有缄默和活性接合型座位 643
有相同序列的缄默盒和活性盒 645
通过受体MAT座位起始的单方向转录 648
补充读物 649
第37章 重组体与免疫多样性的产生 (蒋如璋 译) 651
免疫球蛋白的组构 651
由多部分装配起来的免疫球蛋白基因 654
种质细胞系信息的多样性 656
连接反应产生更大的多样性 658
V基因和C基因重组产生的缺失和重排 659
等位基因排斥的一些可能的原因 661
DNA进一步重组导致类型变换 662
染色体重排使免疫球蛋白基因活化 664
RNA加工可以改变早期重链的表达 665
体细胞突变进一步产生多样性 667
T细胞受体与免疫球蛋白相关 668
主要组织相容性座位的复杂性 669
补充读物 671
第38章 用基因工程技术改变基因组 (蒋如璋 译) 672
果蝇基因组的组织特异性变异 672
基因组扩增序列的选择 675
外源DNA序列可以通过转染引入受体细胞 678
转染DNA可以进入种质细胞系 680
补充读物 683
名词解释 (静天玉 译) 684
补遗 703
《基因》第3版跋 (劳为德 译) 703
分子水平上发育研究的趋势 (劳为德) 705