如何使用本书 1
参考实验室的使用和运输规定 3
安全预防措施 7
第一部分 临床标本直接镜检 11
简介 11
组织学术语 13
真菌感染的组织反应 17
染色 21
表1 组织中真菌和（或）丝状真菌直接镜检的染色方法 22
直接镜检结果解释指南 23
详细描述 31
放线菌病 33
足菌肿（放线菌性或真菌性） 34
诺卡菌病 36
接合菌病（毛霉病） 37
曲霉病 38
其他透明丝孢霉病（曲霉病以外的） 40
皮肤癣菌病（癣，癣菌病） 42
花斑癣 43
掌黑癣 44
暗色丝孢霉病 45
着色芽生菌病 46
孢子丝菌病 47
荚膜组织胞浆菌病 48
马尔尼菲青霉病 50
芽生菌病 52
副球孢子菌病 53
念珠菌病（念珠菌病） 54
毛孢子菌病 56
隐球菌病 57
肺孢子菌病 59
无绿藻病 60
球孢子菌病 61
鼻孢子菌病 62
不育大孢子菌病 64
重要参考文献 65
第二部分 培养真菌的鉴定 69
培养真菌的鉴定指南 69
详细描述 101
丝状细菌 103
丝状细菌简介 105
表2 临床标本中分离的丝状需氧放线菌的鉴别 107
诺卡菌属 108
表3 临床常见诺卡菌的表型特征 110
链霉菌属 111
马杜拉放线菌属 112
达松威尔拟诺卡菌 113
酵母菌与酵母样菌 115
酵母菌与酵母样菌简介 117
白念珠菌 119
表4 临床常见酵母菌与酵母样菌特征 120
都柏林念珠菌 121
表5 临床实验室常见念珠菌属特征 122
表6 都柏林念珠菌与白念珠菌鉴别特征 124
热带念珠菌 125
近平滑念珠菌复合群 126
葡萄牙念珠菌 127
克柔念珠菌 128
表7 头状芽生裂殖菌与克柔念珠菌的鉴别特征 129
表8 克柔念珠菌、平常念珠菌及挪威念珠菌的鉴别特征 129
乳酒念珠菌（原称为假热带念珠菌） 130
皱褶念珠菌 131
季也蒙念珠菌复合群 132
表9 季也蒙念珠菌复合群与无名念珠菌的鉴别要点 133
解脂念珠菌 134
涎沫念珠菌 135
光滑念珠菌（原称为光滑球拟酵母） 136
新型隐球菌 137
格特隐球菌（原称为新型隐球菌格特变种） 138
表10 隐球菌属的特征 139
表11 除白念珠菌和隐球菌属外的其他酵母菌和酵母样菌的特征 140
红酵母菌属 141
赭色掷孢酵母 142
酿酒酵母 143
异常威克汉姆酵母（有性态；原称为异常毕赤酵母或异常汉逊酵母）；（无性态） 145
马拉色菌属 146
厚皮马拉色菌 148
黑粉菌属 149
无绿藻属 150
毛孢子菌属 151
表12 临床常见毛孢子菌属的主要特征 152
头状芽生裂殖酵母（又名头状地霉菌；原称为头状毛孢子菌） 153
白地霉 154
温度双相性真菌 155
温度双相性真菌简介 157
荚膜组织胞浆菌 158
皮炎芽生菌 160
巴西副球孢子菌 162
马尔尼菲青霉 164
申克孢子丝菌复合群 166
表13 申克孢子丝菌复合群中不同菌种的特点 168
温度单相性霉菌 169
接合菌 171
接合菌／球囊菌纲简介 173
表14 接合菌纲中相似菌属的区分要点 175
表15 临床上可遇见的根霉属的鉴别要点 175
根霉属 176
毛霉属 177
根毛霉属 178
伞状横梗霉复合群（原称为伞状犁头霉） 179
雅致鳞质霉 181
saksenaea vasiformis 183
弯曲科克霉 184
灰色小克银汉霉 185
总状共头霉 186
蛙粪霉属 187
冠状耳霉 188
暗色真菌 189
暗色真菌简介 191
裴氏着色霉 193
紧密着色霉（现认为其是裴氏着色霉的一种突变型） 195
喙枝孢霉属（部分种原称为剑顶属；其他为枝氯霉属） 196
疣状瓶霉 197
表16 瓶霉、Pleurostomophora、暗色枝顶孢、枝顶孢属、单孢瓶霉属和油瓶霉属的特征 198
原称为烂木瓶霉 199
寄生暗色枝顶孢（原称为寄生瓶霉） 200
单孢瓶霉属 201
枝孢霉属 203
表17 枝孢霉属与枝孢瓶霉属的特征 204
卡氏枝孢瓶霉（原称为卡氏枝孢霉） 205
斑替枝孢瓶霉（原称为斑替木丝霉属、班替枝孢霉和毛样枝孢霉） 206
波氏枝孢瓶霉（原称为双轴小带孢霉） 207
波氏假阿利什霉（有性期）／波氏赛多孢复合群（无性期） 208
表18 临床上波氏假阿利什霉复合群与多育赛多孢表型特征鉴别 210
多育赛多孢（原称为膨胀赛多孢） 211
奔马赭霉（原称为缢缩指孢霉奔马变种） 212
表19 临床常见奔马赭霉的鉴别 213
表20 某些“黑酵母”的特征 213
甄氏外瓶霉复合群 214
皮炎外瓶霉（皮炎王氏霉） 215
威尼克何德霉 216
足菌肿马杜拉菌 217
灰色马杜拉菌 218
何德毛结节菌 219
出芽短梗霉 220
表21 出芽短梗霉与Hormonema dematioides的不同特征 222
Hormonema demationides 223
对半新柱顶孢（原称为对半柱顶孢） 224
葡萄孢霉属 226
黑葡萄穗霉（原称为S.alternans，S.atra） 227
正形黏束孢霉 228
弯孢霉属 229
离蠕孢属 230
表22 离蠕孢属、德氏霉属及明脐霉属的特点 231
凸脐孢属 232
长蠕孢属 233
链格孢霉属 234
龈枝霉属 235
匍柄霉属 236
皮司霉属 237
附球菌属 238
黑孢子菌属 239
毛壳菌属 240
茎点霉属 241
皮肤癣菌 243
皮肤癣菌简介 245
奥杜盎小孢子菌 247
犬小孢子菌犬变种 248
犬小孢子菌歪斜变种 249
库克小孢子菌 250
石膏样小孢子菌复合群 251
鸡小孢子菌 252
猪小孢子菌 253
万博小孢子菌 254
铁锈色小孢子菌 255
须癣毛癣菌 256
表23 相似产孢型毛癣菌属菌种间的区别 257
红色毛癣菌 258
断发毛癣菌 259
土生毛癣菌 260
麦格尼毛癣菌 261
苏丹毛癣菌 262
表24 毛癣菌种在营养培养基上的生长模式 263
许兰毛癣菌 264
疣状毛癣菌 265
紫色毛癣菌 266
阿耶罗毛癣菌 267
絮状表皮癣菌 268
透明丝孢霉 269
透明丝孢霉简介 271
球孢子菌属 272
表25 产关节分生孢子为主的真菌鉴别特征 274
畸枝霉属 275
毡地丝霉 276
Arthrographis kalrae 277
Hormographiella aspergillata 278
伊蒙菌属 279
曲霉属 281
烟曲霉 283
黑曲霉 284
黄曲霉 285
表26 曲霉属常见菌种的鉴别特征 286
杂色曲霉 288
Aspergillus calidoustus（原称为A.ustus） 289
构巢曲霉（无性态），构巢裸孢壳（有性态） 290
灰绿曲霉（无性态），有性态 291
土曲霉 292
棒曲霉 293
青霉属 294
拟青霉属 295
帚霉属 297
表27 宛氏拟青霉与淡紫拟青霉的鉴别特征 299
表28 短帚霉与布朗帚霉的鉴别特征 299
黏帚霉属 300
木霉属 301
Beauveria bassiana 302
轮枝孢属 303
枝顶孢属（原称为头孢霉属） 304
镰刀菌属 305
油瓶霉属 307
粉红单端孢 308
金小孢子菌属 309
表29 金小孢子菌属与孢子丝菌属鉴别特征 311
Sporotrichum pruinosum 312
瘤孢菌属 313
Chrysonilia sitophila（原称为Monilia sitophila） 314
第三部分 真菌鉴定的分子技术基础 317
简介 317
分子术语 318
经典的分子鉴定方法概述 322
真菌靶标 322
目前分子鉴定方法学选编 323
扩增及非测序法的鉴定方法 323
PCR 323
巢式PCR 324
实时PCR 324
熔解曲线分析 324
荧光共振能量转移 325
TaqMan 5′核酸酶 325
分子信标 325
微阵列 326
重复序列PCR 327
基于测序的鉴定方法 327
Sanger测序 327
焦磷酸测序 328
DNA条码 329
DNA测序的应用 329
精准的分子鉴定 329
进化分析 330
生物分型 332
商品化平台及新开发的技术 332
Accu探针试验 332
肽核酸荧光原位杂交 332
Luminex xMAP 333
基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪 333
精选参考文献 334
第四部分 实验室技术 339
实验室程序 339
标本采集和制备 341
标本直接镜检法 344
初次分离 346
表30 真菌初次分离的培养基 347
表31 抑制性霉菌琼脂培养基与沙保弱葡萄糖琼脂培养基作为真菌初次分离培养基的比较 348
菌落形态观察 349
培养物显微镜检查 350
酵母菌鉴定程序 352
血培养中酵母菌的直接鉴定［采用肽核酸荧光原位杂交技术（PNA FISH）］ 354
混有细菌时的酵母菌分离 355
芽管试验用于推测性鉴定白念珠菌 356
快速酶试验用于推测性鉴定白念珠菌 356
咖啡酸纸片试验 357
橄榄油纸片用于马拉色菌属培养 357
通过培养对温度双相性真菌进行转化 358
雅致鳞质霉和Saksenaea的孢子诱导法 358
体外毛发穿孔试验（鉴别须癣毛癣菌和红色毛癣菌） 359
芽管试验用于鉴别一些暗色真菌 359
温度耐受试验 360
真菌培养物的保存 360
螨虫防控 361
染色方法 363
诺卡菌属改良Kinyoun抗酸染色 365
子囊孢子抗酸染色 366
子囊孢子染色 366
钙荧光白染色 366
吉姆萨染色 367
六胺银（GMS）染色 368
革兰染色（Hucker改良法） 370
乳酸酚棉蓝 371
含聚乙烯醇的乳酸酚棉蓝（改良Huber聚乙烯醇封固剂） 371
石蜡包埋组织的再水化（脱蜡处理） 372
培养基 373
乙酰胺琼脂 375
芳基硫酸酯酶肉汤 376
子囊孢子培养基 376
同化培养基（用于酵母菌） 377
鸟食琼脂（Niger种子琼脂；Staib琼脂） 381
脑心浸液（BHI）琼脂 382
缓冲活性炭酵母浸出液（BCYE）琼脂 382
刀豆氨酸-甘氨酸-溴麝香草酚蓝（CGB）琼脂 383
酪蛋白琼脂 384
科玛嘉念珠菌培养基 384
显色鉴定念珠菌培养基 385
枸橼酸盐琼脂 386
玉米琼脂 386
皮肤真菌检测培养基（DTM） 387
狄克逊（Dixon）琼脂（改良） 388
七叶苷琼脂培养基 388
酵母菌发酵肉汤 389
明胶培养基 389
抑制性霉菌琼脂（IMA） 391
Leeming-Notman琼脂培养基（改良） 391
吕氏（Loeffler）培养基 392
溶菌酶培养基 392
Middlebrook琼脂不透明试验用于皮疽诺卡菌的鉴定 393
海藻糖琼脂培养基 393
硝酸盐肉汤（用于硝酸盐还原试验） 394
精米或稻粒培养基 394
马铃薯葡萄糖琼脂和马铃薯薄片琼脂 395
快速海藻糖同化肉汤 395
快速产孢培养基（RSM） 397
SABHI琼脂 397
沙保弱葡萄糖琼脂（SDA） 398
15％氯化钠沙保弱葡萄糖琼脂 399
沙保弱葡萄糖肉汤 399
淀粉水解琼脂 399
毛癣菌属琼脂 400
酪氨酸、黄嘌呤或次黄嘌呤琼脂 401
尿素琼脂 401
水琼脂 402
含铵的酵母提取物-磷酸琼脂 402
彩图 405
术语 435
文献 447
精选的网站 465
索引 469