第一章 微生物学的研究领域和历史 1
为什么要学微生物学？ 2
微生物学的研究领域 3
微生物 3
微生物学家 4
历史渊源 6
疾病的微生物理论 9
早期研究 9
巴斯德的其他贡献 10
科赫的贡献 10
传染病的控制工作 11
微生物学中特殊领域的出现 12
免疫学 12
病毒学 12
化学疗法 13
遗传学和分子生物学 14
明天的历史 15
基因组学 18
知识点回顾 18
临床案例研究 19
辩证思考题 19
自测题 19
网上学习 20
第二章 化学基础 21
为什么要学习化学？ 22
化学结构单元与化学键 22
化学结构单元 22
原子结构 22
化学键 24
化学反应 25
水及溶液 25
水 25
溶液及胶体 26
酸，碱以及pH值 26
复杂有机分子 28
碳水化合物 28
脂类 29
蛋白质 32
核苷酸及核酸 34
知识点回顾 36
临床案例研究 37
辩证思考题 37
自测题 37
网上学习 38
第三章 显微镜与染色技术 39
显微镜的历史 40
显微镜原理 40
公制单位 40
光的属性：波长和分辨率 41
光的特性：光和物体 42
光学显微镜 44
复式光学显微镜 44
暗视野显微镜 44
相差显微镜 45
诺尔马斯基（微分干涉差）显微镜 45
荧光显微镜 45
共聚焦显微镜 46
数字显微镜 46
电子显微镜 47
透射电子显微镜 47
扫描电子显微镜 48
扫描隧道显微镜 49
光学显微镜技术 51
光学显微镜的样品制备 51
染色原理 51
知识点回顾 54
临床案例研究 55
辩证思考题 56
自测题 56
网上学习 57
第四章 原核细胞与真核细胞的特征 58
细胞的基本类型 59
原核细胞 60
大小、形状和排列 60
结构概观 60
细胞壁 62
细胞膜 66
内部结构 67
外部结构 69
真核细胞 72
结构概观 72
细胞质膜 72
内部结构 73
外部结构 75
内共生进化 76
物质跨膜运输 78
简单扩散 78
易化扩散 78
渗透作用 79
主动运输 80
细胞内吞和细胞外吐 80
知识点回顾 81
临床案例研究 82
辩证思考题 82
自测题 82
网上学习 84
第五章 新陈代谢的基本概念 85
新陈代谢：概述 86
酶 87
酶的特性 87
辅酶和辅因子的特性 88
酶的抑制 89
酶促反应的影响因素 90
厌氧代谢：糖酵解和发酵 91
糖酵解 91
糖酵解的替代途径 91
发酵 92
有氧代谢：呼吸作用 94
克雷布斯循环 94
电子传递和氧化磷酸化 95
获取能量的意义 97
脂肪和蛋白质的代谢 98
脂肪代谢 98
蛋白质代谢 99
其他代谢途径 99
光能自养 99
光能异养 100
化能自养 100
能量的利用 101
生物合成 101
跨膜运输和运动 101
生物发光 102
知识点回顾 103
临床案例研究 104
辩证思考题 104
自测题 104
网上学习 105
第六章 细菌的生长和培养 106
生长和细胞分裂 107
微生物生长的定义 107
细胞分裂 107
生长阶段 107
细菌生长的测定 109
细菌生长的影响因素 113
物理因素 113
营养因素 116
芽孢形成 118
其他类似芽孢的细菌结构 119
细菌培养 119
获得纯培养物的方法 119
培养基 120
复合检验的方法 123
活的，但无法培养的微生物 125
知识点回顾 125
临床案例研究 126
辩证思考题 126
自测题 126
网上学习 127
第七章 微生物遗传学 128
遗传学概述 129
遗传基础 129
核酸在遗传信息储存和传递中的作用 130
DNA复制 131
蛋白质合成 132
转录 132
RNA的种类 133
翻译 134
代谢调控 137
调控机制的意义 137
调控机制的分类 137
反馈抑制 137
酶诱导 138
酶的阻遏 138
突变 140
突变类型及其效应 140
表现型改变 141
自发突变和诱变 141
化学诱变 141
辐射诱变 142
DNA修复 142
突变的研究 143
Ames实验 146
知识点回顾 147
临床案例研究 148
辩证思考题 148
自测题 148
网上学习 150
第八章 基因传递和基因工程 151
基因传递的类型和意义 152
转化 152
发现转化现象 152
转化机制 153
转化的意义 154
转导 154
发现转导现象 154
转导的机制 154
转导的意义 156
接合 156
发现接合现象 156
接合的机制 156
接合的意义 158
基因传递机制的比较 158
质粒 159
质粒的特征 159
抗性质粒 159
转座子 160
细菌素原 161
基因工程 161
基因融合 162
原生质体融合 162
基因扩增 162
重组DNA技术 163
杂交瘤 166
重组DNA技术的利与弊 166
知识点回顾 167
临床案例研究 169
辩证思考题 169
自测题 169
网上学习 170
第九章 分类学引论——细菌 171
分类学：分类的科学 172
林奈，分类学之父 172
使用分类检索表 173
分类学中的问题 174
林奈时代后的发展 174
五界分类系统 175
原核生物界 175
原生生物界 176
真菌界 176
植物界 176
动物界 177
三域分类系统 177
原核生物的进化 177
以灌木取代生命之树 179
古生菌 179
病毒的分类 180
进化关系的研究 180
研究原核生物的特殊方法 181
数值分类学 182
基因同源性 182
其他技术 184
研究意义 185
细菌的分类和命名 185
细菌分类依据 185
伯杰氏手册的历史和意义 186
细菌分类的相关问题 187
细菌命名法 189
第一版伯杰氏手册的细菌部分 189
细菌分类与你的关系 190
知识点回顾 191
临床案例研究 192
辩证思考题 192
自测题 192
网上学习 193
第十章 病毒 194
病毒的一般特征 195
什么是病毒？ 195
病毒的组成 195
大小和形状 196
宿主范围及病毒专一性 196
病毒的起源 198
病毒的分类 198
RNA病毒 200
DNA病毒 202
新显病毒 204
病毒的复制 205
复制的一般特征 205
噬菌体的复制 205
溶原性 208
动物病毒的复制 210
隐性病毒感染 212
动物病毒的培养 212
培养方法的发展 212
细胞培养类型 213
病毒和畸形发生 214
病毒类似因子：卫星病毒，类病毒，朊病毒 214
卫星病毒 214
丁型肝炎病毒 214
类病毒 215
朊病毒 215
病毒和癌症 216
人类癌症病毒 216
癌症病毒是怎样致癌的 217
致癌基因 217
知识点回顾 218
临床案例研究 219
辩证思考题 219
自测题 219
网上学习 221
第十一章 真核微生物和寄生物 222
寄生物学原理 223
寄生的意义 223
寄生物与其宿主间的关系 223
原生生物 224
原生生物的特征 224
原生生物的重要性 224
原生生物的分类 225
真菌 229
真菌的特征 229
真菌的重要性 230
真菌的分类 231
蠕虫 233
蠕虫的特征 233
寄生性蠕虫 234
节肢动物 237
节肢动物的特征 237
节肢动物的分类 237
知识点回顾 239
临床案例研究 240
辩证思考题 240
自测题 240
网上学习 241
第十二章 灭菌和消毒 242
灭菌和消毒的原理 243
微生物生长的控制 243
化学抗微生物法 244
化学药剂的效力 244
化学药剂效力评价 244
消毒剂的选择 245
化学抗微生物剂的作用机理 245
特殊的化学抗微生物剂 246
物理抗微生物方法 250
热灭菌的原理和应用 250
干热灭菌、湿热灭菌和巴斯德法 250
冷藏、冷冻、干燥和冷冻干燥 253
微波辐射 255
声波和超声波 255
过滤 255
渗透压 256
知识点回顾 257
临床案例研究 258
辩证思考题 258
自测题 258
网上学习 259
第十三章 抗微生物疗法 260
抗微生物化学疗法 261
化学疗法的历史 261
抗微生物药物的一般性质 262
选择性毒性 262
活性谱 262
作用机理 263
几种副作用 265
微生物的耐药性 265
测定微生物对抗微生物药物的敏感性 268
纸片扩散法 268
稀释法 269
血清杀伤力 269
自动化方法 269
理想抗微生物药物的属性 269
抗菌药物 270
细胞壁合成抑制剂 270
细胞膜破坏剂 272
蛋白质合成抑制剂 273
核酸合成抑制剂 274
抗代谢药物和其他抗菌药物 274
抗真菌药物 277
抗病毒药物 278
抗原生动物药物 279
抗蠕虫类药物 279
耐药性医院内感染的特殊问题 281
知识点回顾 282
临床案例研究 284
辩证思考题 284
自测题 284
网上学习 285
第十四章 宿主-微生物关系和致病过程 286
宿主-微生物关系 287
共生 287
污染、感染和疾病 288
病原体、致病性和毒力 288
正常（固有）微生物菌群 288
科赫定理 290
疾病种类 291
感染性和非感染性疾病 291
疾病的分类 291
传染病和非传染病 292
疾病过程 292
微生物是如何致病的 292
症状、体征和综合征 297
感染性疾病的种类 297
感染性疾病的分期 298
感染性疾病——过去、现在和将来 300
知识点回顾 301
临床案例研究 302
辩证思考题 303
自测题 303
网上学习 304
第十五章 流行病学和院内感染 305
流行病学 306
什么是流行病学？ 306
群体中的疾病 306
流行病学研究 308
传染源 309
入口 311
出口 312
疾病传播方式 312
疾病周期 315
群体免疫 315
控制疾病的传播 316
公共卫生组织 318
须申报疾病 319
院内感染 322
院内感染流行病学 322
院内感染的预防与控制 324
生物恐怖 325
知识点回顾 328
临床案例研究 328
辩证思考题 329
自测题 329
网上学习 330
第十六章 天然宿主防御 331
天然免疫和适应性免疫 332
物理屏障 332
化学屏障 332
细胞防御 333
防御细胞 333
吞噬细胞 334
吞噬过程 335
细胞外杀菌 336
淋巴系统 336
炎症 338
炎症的特征 338
急性炎症过程 338
修复和再生 339
慢性炎症 339
发烧 340
分子防御 340
干扰素 340
补体 342
急性期反应 344
知识点回顾 345
临床案例研究 346
辩证思考题 346
自测题 346
网上学习 347
第十七章 免疫学Ⅰ：适应性免疫及免疫作用的基本原理 348
免疫学和免疫 349
免疫的类型 349
适应性免疫 349
主动免疫和被动免疫 349
免疫系统的特征 350
抗原和抗体 350
免疫细胞和免疫组织 351
免疫系统的双重应答 351
免疫应答的一般特性 352
体液免疫 353
抗体（免疫球蛋白）的特性 354
初次应答和再次应答 356
抗原-抗体反应的种类 357
单克隆抗体 358
细胞介导免疫 359
细胞介导的免疫反应 359
杀伤细胞的作用机理 360
激活巨噬细胞的作用 360
超抗原 360
黏膜免疫系统 361
修饰免疫应答的因素 361
免疫接种 362
主动免疫接种 362
疫苗的危险性 364
被动免疫接种 366
免疫接种的未来发展 366
对各种病原体的免疫 367
细菌 367
病毒 367
真菌 368
原生动物及寄生虫 368
知识点回顾 369
临床案例研究 371
辩证思考题 371
自测题 371
网上学习 372
第十八章 免疫学Ⅱ：免疫性疾病及其检验 373
免疫性疾病概述 374
超敏反应 374
免疫缺陷 374
速发型（Ⅰ型）超敏反应 374
变应原 375
速发型超敏反应机制 375
局部过敏反应 376
全身过敏反应 377
过敏症的遗传因素 377
过敏症治疗 377
细胞毒性（Ⅱ型）超敏反应 378
细胞毒性超敏反应机制 378
细胞毒性反应举例 378
免疫复合物（Ⅲ型）超敏反应 380
免疫复合物疾病的机制 380
免疫复合物疾病举例 380
细胞介导（Ⅳ型）超敏反应 381
细胞介导反应的作用机制 381
细胞介导疾病举例 381
自身免疫性疾病 383
自身免疫 383
自身免疫性疾病举例 384
移植 385
组织相容性抗原 386
移植排斥 387
妊娠期胎儿的耐受性 387
免疫抑制 387
药物反应 388
免疫缺陷疾病 388
原发性免疫缺陷疾病 388
获得性免疫缺陷疾病 389
免疫学检测 393
沉淀素试验 393
凝集反应 394
标记抗体试验 396
知识点回顾 397
临床案例研究 399
辩证思考题 399
自测题 399
网上学习 400
第十九章 皮肤和眼睛疾病；创口和咬伤 401
皮肤、黏膜和眼睛 402
皮肤 402
黏膜 402
眼睛 402
皮肤的正常菌群 403
皮肤病 403
细菌性皮肤病 404
病毒性皮肤病 406
真菌性皮肤病 411
其他皮肤病 413
眼睛疾病 414
细菌性眼病 414
病毒性眼病 415
寄生虫性眼病 415
创口和咬伤 417
创口感染 417
其他厌氧菌感染 417
节肢动物咬伤及相关疾病 418
知识点回顾 420
临床案例研究 421
辩证思考题 421
自测题 421
网上学习 422
第二十章 泌尿生殖系统及性传播性疾病 423
泌尿生殖系统的组成 424
泌尿系统 424
女性生殖系统 424
男性生殖系统 425
泌尿生殖系统的正常微生物菌群 425
通常为非性传播的泌尿生殖系统疾病 426
细菌性泌尿生殖系统疾病 426
寄生虫性泌尿生殖系统疾病 429
性传播疾病 430
获得性免疫缺陷综合征（艾滋病） 430
细菌性性传播疾病 430
病毒性性传播疾病 437
知识点回顾 442
临床案例研究 443
辩证思考题 443
自测题 443
网上学习 444
第二十一章 呼吸系统疾病 445
呼吸系统的组成 446
上呼吸道 446
下呼吸道 446
耳 447
呼吸系统的正常微生物菌群 447
上呼吸道疾病 448
细菌性上呼吸道疾病 448
病毒性上呼吸道疾病 450
下呼吸道疾病 452
细菌性下呼吸道疾病 452
病毒性下呼吸道疾病 459
真菌性下呼吸道疾病 464
寄生虫性下呼吸道疾病 465
知识点回顾 466
临床案例研究 467
辩证思考题 467
自测题 468
网上学习 469
第二十二章 口腔和胃肠道疾病 470
消化系统的组成 471
口腔 471
胃 471
小肠 471
大肠 472
口腔和消化系统的正常微生物菌群 472
口腔疾病 472
口腔的细菌性疾病 472
口腔的病毒性疾病 475
由细菌引起的胃肠道疾病 476
细菌性食物中毒 476
细菌性肠炎和肠炎热症 477
胃、食管和肠道的细菌性感染 483
胆囊和胆道的细菌性感染 484
由其他病原体引起的胃肠道疾病 485
病毒性胃肠道疾病 485
原生动物引起的胃肠道疾病 487
真菌毒素的效应 489
蠕虫性胃肠道疾病 490
知识点回顾 496
临床案例研究 497
辩证思考题 497
自测题 497
网上学习 498
第二十三章 心血管、淋巴及其系统性疾病 499
心血管系统 500
心脏和血管 500
血液 500
心血管系统的正常微生物菌群 500
心血管和淋巴系统疾病 501
细菌性败血症及相关疾病 501
血液和淋巴的肠虫病 503
系统性疾病 504
细菌性系统性疾病 504
立克次体及其相关系统性疾病 511
病毒性系统性疾病 515
原生动物系统性疾病 518
知识点回顾 522
临床案例研究 523
辩证思考题 523
自测题 523
网上学习 524
第二十四章 神经系统疾病 525
神经系统的组成 526
神经系统的正常微生态 526
脑和脑膜的疾病 526
脑和脑膜的细菌性疾病 526
脑和脑膜的病毒性疾病 528
神经系统的其他疾病 532
神经的细菌性疾病 532
神经的病毒性疾病 535
神经系统的朊病毒疾病 536
神经系统的寄生虫疾病 538
知识点回顾 541
临床案例研究 542
辩证思考题 542
自测题 542
网上学习 543
第二十五章 环境微生物学 544
生态学基础 545
生态系统的特性 545
生态系统中的能量流 545
生物地球化学循环 546
水循环 546
碳循环 546
氮循环和氮细菌 547
硫循环和硫细菌 550
其他生物地球化学循环 551
深层热生物圈 551
空气 551
空气中的微生物 552
控制空气中微生物的方法 552
土壤 553
土壤的成分 553
土壤中的微生物 553
土壤中的病原体 554
洞穴 555
水 555
淡水环境 555
海洋环境 556
深海火山口 557
水污染 557
水净化 559
污水处理 561
一级处理 561
二级处理 561
三级处理 562
化粪池 562
生物修复 562
知识点回顾 564
临床案例研究 565
辩证思考题 565
自测题 565
网上学习 566
第二十六章 应用微生物学 567
食物中发现的微生物 568
谷物类 568
果蔬类 568
肉禽类 569
鱼贝类 570
牛奶 571
其他食品 572
防止食物变质和疾病传播 572
食品保藏 573
干燥与冷冻干燥 574
牛奶巴斯德灭菌 575
食品与牛奶的生产标准 576
食用微生物和食品生产中的微生物 576
食用藻类、真菌和细菌 576
食品生产 577
啤酒、果酒和白酒 580
工业和制药微生物学 581
有用的代谢过程 581
工业微生物学中的难题 582
有用的有机产物 582
简单有机化合物 582
抗生素 583
酶 583
氨基酸 584
其他生物产品 584
微生物采矿 584
微生物废物处理 585
知识点回顾 585
临床案例研究 586
辩证思考题 586
自测题 586
网上学习 588
附录A 公制计量单位，换算及数学工具 589
附录B 细菌和病毒的分类 591
附录C 微生物学中的常见词根 608
附录D 处理临床样本中的安全防护 610
附录E 代谢途径 611
附录F 疾病与对应的病原体 615
附录G 病原体及其引起的疾病 620
附录H 词汇表 625
索引 652