第一篇 蛋白质结构和功能 3
第一章 蛋白质概论多聚物的构建 3
多聚物的折叠 6
顺序决定折叠 8
蛋白质的分类 12
酶 12
运输蛋白 15
贮藏蛋白 15
收缩系统的蛋白质 15
抗体 16
毒蛋白 16
激素 17
结构蛋白 18
结构的等级 19
蛋白质都是信息大分子 20
最后的加工：翻译后的修饰 24
蛋白质家族 25
分子结构的形象化 30
第二章 蛋白质结构的分析技术蛋白质的化学结构 33
氨基酸组分的测定 33
一级结构的测定 36
肽的化学合成 40
蛋白质的溶解性质 43
蛋白质的溶解度 43
蛋白质的变性 44
物理化学分离和鉴定技术 45
以蛋白质电荷为依据的分离和鉴定方法 45
以分子量为依据的方法 47
以蛋白质的特异性相互作用为依据的分离方法 51
测定辐射的吸收或发射的方法 52
选读材料 56
第三章 蛋白质结构解剖学蛋白质的一级结构决定其折叠结构 59
水的化学性质是决定蛋白质构象的重要因素 60
决定蛋白质构象的作用力 62
蛋白质的折叠与蛋白质结构的等级 67
肽链可能构象的空间限制 67
二级结构 72
氨基酸顺序和二级结构形成间的某些关系 75
二级结构和纤维蛋白 76
球蛋白的结构组建 80
肽链的手性对蛋白质结构组建的影响 80
二级结构间的聚集与结构域的形成 84
膜蛋白特殊的结构特征 90
四级结构 92
血红蛋白：一种变构蛋白 96
功能与可变动部分有关的蛋白质 96
肌肉：一种超分子聚集体 103
蛋白质的功能多样化 106
带有辅基的蛋白质 106
蛋白质进化中的多样化现象 108
分子进化与基因剪接 110
蛋白质在作用中的多样化：抗体 110
选读材料 113
第四章 酶的催化作用Ⅰ酶催化什么样的反应？ 114
化学催化的某些通性 114
化学反应速度 114
速度是由反应物之间的有效碰撞决定的 117
催化剂的功能 118
酶催化反应的动力学 119
Michaelis-Menten方程 119
Michaelis-Menten方程的应用 121
酶催化反应的其他特性 122
胰蛋白酶家族 124
胰凝乳蛋白酶的催化机制 125
胰凝乳蛋白酶活性的动力学测定 132
活性部位中有关基团的类型 134
酶的抑制作用 134
胰蛋白酶的可逆抑制剂和不可逆抑制剂 136
pH对酶活力的影响 137
底物专一性 139
羧肽酶A 139
酶-底物复合物的结构 140
反应的机制 140
胰RNaseA 143
溶菌酶 148
选读材料 153
第五章 酶的催化作用Ⅱ双底物反应的机制 154
乳酸脱氢酶 155
NAD＋-乳酸反应的动力学研究 156
与辅酶和底物结合后发生的构象变化 157
乳酸脱氢酶的同功酶及其功能 159
酶反应的假设机制 159
酶活性的调节 160
酶活性的调节方式 161
天冬氨酸转氨甲酰酶：别构调节酶的一个实例 162
别构效应影响酶活性的不同模型 166
大肠杆菌RNA聚合酶 167
选读材料 169
第六章 辅酶的结构和功能硫胺焦磷酸（TPP） 171
5′-磷酸吡哆醛 174
烟酰胺类辅酶 180
结构 185
黄素类辅酶 185
磷酸泛酰巯基乙胺类辅酶 189
α-硫辛酸 192
生物素 195
叶酸类辅酶 197
维生素B12类辅酶 200
作为辅酶的金属离子 204
金属酶类与金属激活酶类 204
含铁酶类 205
含锌金属酶类 206
含铜金属酶类 207
其他金属酶和金属 208
选读材料 209
第二篇 糖代谢和化学能的生成 211
第七章 生物化学中的热力学热力学概念 211
热力学量 211
内能和热力学第一定律 212
焓 212
熵和热力学第二定律 214
自由能：自发性的判据 219
溶液热力学和化学势 221
溶质浓度对溶剂化学势的影响 222
相平衡 222
热力学在生物化学中的应用 222
膜平衡 223
溶液中的化学平衡 224
生物高聚物构象的能力学 234
选读材料 237
第八章 无氧条件下ATP的生成化养生物的能量代谢 238
对能量的需求 238
能源 239
代谢途径 239
腺苷三磷酸（ATP）：自然界的货币 240
生物氧化 242
葡萄糖的生物氧化 243
呼吸和发酵 245
通过糖酵解生成ATP 245
糖酵解的第一阶段 247
糖酵解的第二阶段 250
糖酵解的第三阶段 252
发酵：厌氧选择 254
丙酮酸是分支点 254
乳酸发酵 255
乙醇发酵 256
发酵能力学 257
其他发酵选择 257
糖酵解的其他底物 258
其他糖的分解代谢 258
贮存多糖的分解代谢 260
甘油的分解代谢 262
糖酵解的调节 262
糖原动用的调控 262
糖酵解途径的调控 264
磷酸葡萄糖酸途径 265
葡萄糖氧化和NADPH的生成 265
戊糖间互变 267
糖磷酸盐的进一步互变 268
磷酸葡萄糖酸途径的总结 269
选读材料 270
第九章 有氧条件下ATP的生成：TCA循环三羧酸循环 273
丙酮酸的氧化脱羧作用 273
TCA循环的第一阶段：乙酸的进入 276
TCA循环的第二阶段：氧化脱羧步骤 276
TCA循环的第三阶段：草酰乙酸的再生 279
TCA循环的总结 282
碳经过TCA循环的流动途径 283
TCA循环活性的调节 285
TCA循环的双重性 286
由TCA循环中间物起始的合成途径 287
TCA循环中间物的补充 288
TCA循环中乙酰辅酶A的其他来源 290
脂肪作为能源 290
脂肪酸的β氧化作用 291
蛋白质作为能源 294
氨基酸的分解代谢 295
乙醛酸循环：乙酰辅酶A的另一去向 297
乙醛酸循环作为合成途径 297
乙醛酸循环的总结 300
琥珀酸的葡糖异生作用 300
脂肪酸的葡糖异生作用 301
选读材料 302
第十章 有氧条件下ATP的生成：电子传递电子传递 303
还原电位 304
电子传递链 307
电子传递链上的电子传递体 308
确定传递体的次序 311
电子传递链的组织和功能 314
电子传递的总结 317
氧化磷酸化作用 318
P/O比值和ATP合成的位置 318
呼吸状态和构象上的变化 319
与电子传递相偶联的ATP合成 319
氧化磷酸化作用的解偶联剂和抑制剂 320
氧化磷酸化的偶联机制 321
偶联的化学渗透模型 323
跨膜的质子迁移力 323
传递体的不对称性和质子的定向泵动 324
质子迁移力在ATP合成中的作用 325
线粒体的ATP生成系统：F1和F0 325
呼吸代谢的总结 328
呼吸代谢中ATP的产量 328
线粒体的发现和早期研究 329
呼吸代谢的基地：线粒体的结构和功能 329
呼吸代谢的效率 329
存在和大小 330
结构和功能 330
线粒体内功能的区域化 331
丙酮酸和其他底物进入线粒体 331
电子进入线粒体 332
线粒体向外转运ATP 334
呼吸代谢的整合作用 335
能量载荷 336
磷酸化位 336
巴斯德效应 336
选读材料 337
光的物理定义 338
第十一章 光合作用光合作用中电磁能被转化为化学能 338
光合作用在膜上进行 340
叶绿素的光化学 340
光合作用依靠叶绿素的光化学反应性 340
光是如何与分子相互作用的 342
光导致了电子传递反应 343
叶绿素的光氧化生成了阳离子自由基 344
活性的叶绿素位于称为反应中心的复合物中 344
天线系统将能量传给反应中心 345
电子传递链将电子还给P870并且使质子跨膜移动 347
细菌的电子传递系统 347
由P870释放的电子依次流向细菌叶绿素、细菌脱镁叶绿素和醌 347
叶绿体电子传递系统 348
叶绿体有两个顺序连接的光系统 348
产生O2需要在系统Ⅱ中积累4个氧化态相当物 351
系统Ⅱ先还原脱镁叶绿素再还原醌 352
系统Ⅰ先还原叶绿素再还原铁硫蛋白 353
碳的固定 354
还原性戊糖循环 354
光呼吸和C-4循环 355
选读材料 358
第十二章 糖的结构和合成单糖及其有关的化合物 360
糖可形成分子内的半缩醛 361
结构相关的糖族 363
糖苷键连接形成双糖和多糖 363
双糖 363
多糖 364
葡糖异生作用 369
糖苷键的合成 372
形成活化的单体结构单元 372
双糖的合成 373
贮能多糖的合成 373
糖原的裂解 374
结构多糖的合成 375
细菌细胞壁的合成 375
肽聚糖结构 375
肽聚糖的生物合成 376
O-抗原的合成 383
选读材料 385
第三篇 脂质和生物胰 388
第十三章 脂肪酸和三酰基甘油的代谢脂肪酸 388
脂肪酸的结构 388
脂肪酸的性质和分析 390
三酰基甘油中脂肪酸的动用 392
脂肪组织中脂肪酸的动用和转移 392
三酰基甘油（甘油三酯） 392
清蛋白：血浆中脂肪酸的一个主要载体 393
酰基辅酶A合成酶：活化脂肪酸的酶类 394
脂肪酸进入线粒体的传送 395
脂肪酸的氧化作用 395
历史背景 395
β氧化作用的概貌——脂肪酸分解的主要路线 396
β氧化作用的酶学 397
不饱和脂肪酸的氧化作用 397
奇数碳原子脂肪酸的氧化作用 398
α氧化作用和雷富孙氏病 400
ω氧化作用 402
酮体的形成和利用 402
脂肪酸的生物合成 403
历史进展 403
饱和脂肪酸生物合成的反应 404
乙酰辅酶A羧化酶 406
大肠杆菌的脂肪酸合成酶 407
耻垢分枝杆菌的脂肪酸合成酶 409
真核生物的脂肪酸合成酶 409
单不饱和脂肪酸的生物合成 410
与脂肪酸合成有关的代谢 412
多不饱和脂肪酸的生物合成 412
脂肪酸代谢的调控 413
乙酰辅酶A羧化酶和脂肪酸合成酶的浓度 415
底物和产物 415
辅助因子的供应 416
激活剂和抑制剂 416
结论 416
选读材科 417
第十四章 甘油脂、神经鞘脂和前列腺素的代谢甘油脂 418
磷脂的结构 418
大肠杆菌中磷脂的合成 422
三酰基甘油的合成 425
真核生物中甘油脂的合成 425
真核生物中磷脂的生物合成 428
烷基醚和烯基醚的生物合成 432
真核生物中磷脂生物合成的调控 434
大肠杆菌中脂肪酸和磷脂生物合成的调控 435
磷脂酶 437
磷脂在膜中的合成和装配 438
磷脂交换蛋白 438
鞘脂 439
结构 439
鞘脂的生物合成 441
鞘脂的分解代谢及其有关的代谢病 443
糖鞘脂的特化功能 447
前列腺素及其有关化合物 447
历史进展 447
结构 448
分析 449
生物合成 449
分解代谢 452
前列腺素的功能 454
选读材料 455
胆固醇的结构 456
第十五章 甾类化合物和脂蛋白的代谢胆固醇和有关的甾醇 456
胆固醇的生物合成 457
脂蛋白代谢 466
脂蛋白的结构和分类 466
脂蛋白的合成和分泌 468
乳糜微粒和极低密度脂蛋白（VLDL）的分解代谢 468
低密度脂蛋白（LDL）的分解代谢 469
家族性高胆固醇血症：一种由胆固醇堆积引起的严重疾病 470
高密度脂蛋白（HDL）的分解代谢 470
胆汁酸 471
哺乳动物的胆固醇代谢 474
甾类激素 474
脂溶性的维生素、萜和多聚乙酰 476
脂溶性维生素 476
萜 477
多聚乙酰（聚交酯） 481
选读材料 483
第十六章 生物膜：结构和装配生物膜的组分 485
真核细腮膜的分离 485
细菌细胞被膜的组分 488
膜脂 490
膜脂自发地形成有序的结构 494
生物膜蛋白 496
生物膜的结构 504
流动镶嵌模型 504
影响膜物理性质的因素 508
生物膜的不对称性 511
生物膜的生物合成和装配 513
膜装配的拓扑学和组分协调 514
膜蛋白的生源机制同题 516
信号假说 516
有别于信号机制的其他机制 520
选读材料 522
简单扩散和载体媒介的传送 524
第十七章 生物膜：传送生物传送的理论和热力学 524
跨膜传送的能力学 527
主动传送和基团移位 528
生物传送中的能量偶联机制 530
膜传送研究的实验方法 530
促进扩散的传送系统 532
初级主动传送：Na＋-K＋ATP酶 533
其他离子移位ATP酶 534
由电子传递和光驱动的初级系统 537
细菌结合蛋白的传送系统 538
次级主动传送：离子梯度和电梯度 541
线粒体ATP/ADP交换器 543
基团移位：细菌的磷酸烯醇丙酮酸（PEP）：糖磷酸转移酶系统 544
细菌中的能量互变和主动传送 546
透性酶功能的调节 547
生物传送的分子机制 547
概念模型：运动载体与微孔 547
传送蛋白：运动载体还是微孔？ 551
生物膜中的分子传送机制 554
纯化传送蛋白的重建 557
结束语 560
选读材料 560