生物化学（上册）PDF电子书下载

第一篇 蛋白质结构和功能 3

第一章 蛋白质概论多聚物的构建 3

多聚物的折叠 6

顺序决定折叠 8

蛋白质的分类 12

酶 12

运输蛋白 15

贮藏蛋白 15

收缩系统的蛋白质 15

抗体 16

毒蛋白 16

激素 17

结构蛋白 18

结构的等级 19

蛋白质都是信息大分子 20

最后的加工：翻译后的修饰 24

蛋白质家族 25

分子结构的形象化 30

第二章 蛋白质结构的分析技术蛋白质的化学结构 33

氨基酸组分的测定 33

一级结构的测定 36

肽的化学合成 40

蛋白质的溶解性质 43

蛋白质的溶解度 43

蛋白质的变性 44

物理化学分离和鉴定技术 45

以蛋白质电荷为依据的分离和鉴定方法 45

以分子量为依据的方法 47

以蛋白质的特异性相互作用为依据的分离方法 51

测定辐射的吸收或发射的方法 52

选读材料 56

第三章 蛋白质结构解剖学蛋白质的一级结构决定其折叠结构 59

水的化学性质是决定蛋白质构象的重要因素 60

决定蛋白质构象的作用力 62

蛋白质的折叠与蛋白质结构的等级 67

肽链可能构象的空间限制 67

二级结构 72

氨基酸顺序和二级结构形成间的某些关系 75

二级结构和纤维蛋白 76

球蛋白的结构组建 80

肽链的手性对蛋白质结构组建的影响 80

二级结构间的聚集与结构域的形成 84

膜蛋白特殊的结构特征 90

四级结构 92

血红蛋白：一种变构蛋白 96

功能与可变动部分有关的蛋白质 96

肌肉：一种超分子聚集体 103

蛋白质的功能多样化 106

带有辅基的蛋白质 106

蛋白质进化中的多样化现象 108

分子进化与基因剪接 110

蛋白质在作用中的多样化：抗体 110

选读材料 113

第四章 酶的催化作用Ⅰ酶催化什么样的反应？ 114

化学催化的某些通性 114

化学反应速度 114

速度是由反应物之间的有效碰撞决定的 117

催化剂的功能 118

酶催化反应的动力学 119

Michaelis-Menten方程 119

Michaelis-Menten方程的应用 121

酶催化反应的其他特性 122

胰蛋白酶家族 124

胰凝乳蛋白酶的催化机制 125

胰凝乳蛋白酶活性的动力学测定 132

活性部位中有关基团的类型 134

酶的抑制作用 134

胰蛋白酶的可逆抑制剂和不可逆抑制剂 136

pH对酶活力的影响 137

底物专一性 139

羧肽酶A 139

酶-底物复合物的结构 140

反应的机制 140

胰RNaseA 143

溶菌酶 148

选读材料 153

第五章 酶的催化作用Ⅱ双底物反应的机制 154

乳酸脱氢酶 155

NAD＋-乳酸反应的动力学研究 156

与辅酶和底物结合后发生的构象变化 157

乳酸脱氢酶的同功酶及其功能 159

酶反应的假设机制 159

酶活性的调节 160

酶活性的调节方式 161

天冬氨酸转氨甲酰酶：别构调节酶的一个实例 162

别构效应影响酶活性的不同模型 166

大肠杆菌RNA聚合酶 167

选读材料 169

第六章 辅酶的结构和功能硫胺焦磷酸（TPP） 171

5′-磷酸吡哆醛 174

烟酰胺类辅酶 180

结构 185

黄素类辅酶 185

磷酸泛酰巯基乙胺类辅酶 189

α-硫辛酸 192

生物素 195

叶酸类辅酶 197

维生素B12类辅酶 200

作为辅酶的金属离子 204

金属酶类与金属激活酶类 204

含铁酶类 205

含锌金属酶类 206

含铜金属酶类 207

其他金属酶和金属 208

选读材料 209

第二篇 糖代谢和化学能的生成 211

第七章 生物化学中的热力学热力学概念 211

热力学量 211

内能和热力学第一定律 212

焓 212

熵和热力学第二定律 214

自由能：自发性的判据 219

溶液热力学和化学势 221

溶质浓度对溶剂化学势的影响 222

相平衡 222

热力学在生物化学中的应用 222

膜平衡 223

溶液中的化学平衡 224

生物高聚物构象的能力学 234

选读材料 237

第八章 无氧条件下ATP的生成化养生物的能量代谢 238

对能量的需求 238

能源 239

代谢途径 239

腺苷三磷酸（ATP）：自然界的货币 240

生物氧化 242

葡萄糖的生物氧化 243

呼吸和发酵 245

通过糖酵解生成ATP 245

糖酵解的第一阶段 247

糖酵解的第二阶段 250

糖酵解的第三阶段 252

发酵：厌氧选择 254

丙酮酸是分支点 254

乳酸发酵 255

乙醇发酵 256

发酵能力学 257

其他发酵选择 257

糖酵解的其他底物 258

其他糖的分解代谢 258

贮存多糖的分解代谢 260

甘油的分解代谢 262

糖酵解的调节 262

糖原动用的调控 262

糖酵解途径的调控 264

磷酸葡萄糖酸途径 265

葡萄糖氧化和NADPH的生成 265

戊糖间互变 267

糖磷酸盐的进一步互变 268

磷酸葡萄糖酸途径的总结 269

选读材料 270

第九章 有氧条件下ATP的生成：TCA循环三羧酸循环 273

丙酮酸的氧化脱羧作用 273

TCA循环的第一阶段：乙酸的进入 276

TCA循环的第二阶段：氧化脱羧步骤 276

TCA循环的第三阶段：草酰乙酸的再生 279

TCA循环的总结 282

碳经过TCA循环的流动途径 283

TCA循环活性的调节 285

TCA循环的双重性 286

由TCA循环中间物起始的合成途径 287

TCA循环中间物的补充 288

TCA循环中乙酰辅酶A的其他来源 290

脂肪作为能源 290

脂肪酸的β氧化作用 291

蛋白质作为能源 294

氨基酸的分解代谢 295

乙醛酸循环：乙酰辅酶A的另一去向 297

乙醛酸循环作为合成途径 297

乙醛酸循环的总结 300

琥珀酸的葡糖异生作用 300

脂肪酸的葡糖异生作用 301

选读材料 302

第十章 有氧条件下ATP的生成：电子传递电子传递 303

还原电位 304

电子传递链 307

电子传递链上的电子传递体 308

确定传递体的次序 311

电子传递链的组织和功能 314

电子传递的总结 317

氧化磷酸化作用 318

P/O比值和ATP合成的位置 318

呼吸状态和构象上的变化 319

与电子传递相偶联的ATP合成 319

氧化磷酸化作用的解偶联剂和抑制剂 320

氧化磷酸化的偶联机制 321

偶联的化学渗透模型 323

跨膜的质子迁移力 323

传递体的不对称性和质子的定向泵动 324

质子迁移力在ATP合成中的作用 325

线粒体的ATP生成系统：F1和F0 325

呼吸代谢的总结 328

呼吸代谢中ATP的产量 328

线粒体的发现和早期研究 329

呼吸代谢的基地：线粒体的结构和功能 329

呼吸代谢的效率 329

存在和大小 330

结构和功能 330

线粒体内功能的区域化 331

丙酮酸和其他底物进入线粒体 331

电子进入线粒体 332

线粒体向外转运ATP 334

呼吸代谢的整合作用 335

能量载荷 336

磷酸化位 336

巴斯德效应 336

选读材料 337

光的物理定义 338

第十一章 光合作用光合作用中电磁能被转化为化学能 338

光合作用在膜上进行 340

叶绿素的光化学 340

光合作用依靠叶绿素的光化学反应性 340

光是如何与分子相互作用的 342

光导致了电子传递反应 343

叶绿素的光氧化生成了阳离子自由基 344

活性的叶绿素位于称为反应中心的复合物中 344

天线系统将能量传给反应中心 345

电子传递链将电子还给P870并且使质子跨膜移动 347

细菌的电子传递系统 347

由P870释放的电子依次流向细菌叶绿素、细菌脱镁叶绿素和醌 347

叶绿体电子传递系统 348

叶绿体有两个顺序连接的光系统 348

产生O2需要在系统Ⅱ中积累4个氧化态相当物 351

系统Ⅱ先还原脱镁叶绿素再还原醌 352

系统Ⅰ先还原叶绿素再还原铁硫蛋白 353

碳的固定 354

还原性戊糖循环 354

光呼吸和C-4循环 355

选读材料 358

第十二章 糖的结构和合成单糖及其有关的化合物 360

糖可形成分子内的半缩醛 361

结构相关的糖族 363

糖苷键连接形成双糖和多糖 363

双糖 363

多糖 364

葡糖异生作用 369

糖苷键的合成 372

形成活化的单体结构单元 372

双糖的合成 373

贮能多糖的合成 373

糖原的裂解 374

结构多糖的合成 375

细菌细胞壁的合成 375

肽聚糖结构 375

肽聚糖的生物合成 376

O-抗原的合成 383

选读材料 385

第三篇 脂质和生物胰 388

第十三章 脂肪酸和三酰基甘油的代谢脂肪酸 388

脂肪酸的结构 388

脂肪酸的性质和分析 390

三酰基甘油中脂肪酸的动用 392

脂肪组织中脂肪酸的动用和转移 392

三酰基甘油（甘油三酯） 392

清蛋白：血浆中脂肪酸的一个主要载体 393

酰基辅酶A合成酶：活化脂肪酸的酶类 394

脂肪酸进入线粒体的传送 395

脂肪酸的氧化作用 395

历史背景 395

β氧化作用的概貌——脂肪酸分解的主要路线 396

β氧化作用的酶学 397

不饱和脂肪酸的氧化作用 397

奇数碳原子脂肪酸的氧化作用 398

α氧化作用和雷富孙氏病 400

ω氧化作用 402

酮体的形成和利用 402

脂肪酸的生物合成 403

历史进展 403

饱和脂肪酸生物合成的反应 404

乙酰辅酶A羧化酶 406

大肠杆菌的脂肪酸合成酶 407

耻垢分枝杆菌的脂肪酸合成酶 409

真核生物的脂肪酸合成酶 409

单不饱和脂肪酸的生物合成 410

与脂肪酸合成有关的代谢 412

多不饱和脂肪酸的生物合成 412

脂肪酸代谢的调控 413

乙酰辅酶A羧化酶和脂肪酸合成酶的浓度 415

底物和产物 415

辅助因子的供应 416

激活剂和抑制剂 416

结论 416

选读材科 417

第十四章 甘油脂、神经鞘脂和前列腺素的代谢甘油脂 418

磷脂的结构 418

大肠杆菌中磷脂的合成 422

三酰基甘油的合成 425

真核生物中甘油脂的合成 425

真核生物中磷脂的生物合成 428

烷基醚和烯基醚的生物合成 432

真核生物中磷脂生物合成的调控 434

大肠杆菌中脂肪酸和磷脂生物合成的调控 435

磷脂酶 437

磷脂在膜中的合成和装配 438

磷脂交换蛋白 438

鞘脂 439

结构 439

鞘脂的生物合成 441

鞘脂的分解代谢及其有关的代谢病 443

糖鞘脂的特化功能 447

前列腺素及其有关化合物 447

历史进展 447

结构 448

分析 449

生物合成 449

分解代谢 452

前列腺素的功能 454

选读材料 455

胆固醇的结构 456

第十五章 甾类化合物和脂蛋白的代谢胆固醇和有关的甾醇 456

胆固醇的生物合成 457

脂蛋白代谢 466

脂蛋白的结构和分类 466

脂蛋白的合成和分泌 468

乳糜微粒和极低密度脂蛋白（VLDL）的分解代谢 468

低密度脂蛋白（LDL）的分解代谢 469

家族性高胆固醇血症：一种由胆固醇堆积引起的严重疾病 470

高密度脂蛋白（HDL）的分解代谢 470

胆汁酸 471

哺乳动物的胆固醇代谢 474

甾类激素 474

脂溶性的维生素、萜和多聚乙酰 476

脂溶性维生素 476

萜 477

多聚乙酰（聚交酯） 481

选读材料 483

第十六章 生物膜：结构和装配生物膜的组分 485

真核细腮膜的分离 485

细菌细胞被膜的组分 488

膜脂 490

膜脂自发地形成有序的结构 494

生物膜蛋白 496

生物膜的结构 504

流动镶嵌模型 504

影响膜物理性质的因素 508

生物膜的不对称性 511

生物膜的生物合成和装配 513

膜装配的拓扑学和组分协调 514

膜蛋白的生源机制同题 516

信号假说 516

有别于信号机制的其他机制 520

选读材料 522

简单扩散和载体媒介的传送 524

第十七章 生物膜：传送生物传送的理论和热力学 524

跨膜传送的能力学 527

主动传送和基团移位 528

生物传送中的能量偶联机制 530

膜传送研究的实验方法 530

促进扩散的传送系统 532

初级主动传送：Na＋-K＋ATP酶 533

其他离子移位ATP酶 534

由电子传递和光驱动的初级系统 537

细菌结合蛋白的传送系统 538

次级主动传送：离子梯度和电梯度 541

线粒体ATP/ADP交换器 543

基团移位：细菌的磷酸烯醇丙酮酸（PEP）：糖磷酸转移酶系统 544

细菌中的能量互变和主动传送 546

透性酶功能的调节 547

生物传送的分子机制 547

概念模型：运动载体与微孔 547

传送蛋白：运动载体还是微孔？ 551

生物膜中的分子传送机制 554

纯化传送蛋白的重建 557

结束语 560

选读材料 560