第一篇 临床微生物学实验室的一般管理 1
第一章 临床微生物学实验室的一般管理 1
第一节 临床微生物学实验室的基本建设 1
第二节 临床微生物学实验室的生物安全管理 2
第三节 临床微生物学实验室的人力资源管理 3
第二章 临床微生物学实验室的专业管理 5
第一节 临床微生物学实验室的作业指导书编写 5
第二节 临床微生物学实验室的质量保证管理 6
第三节 临床微生物学实验室的信息管理 8
第三章 临床微生物学实验室菌株保存和管理 11
第四章 临床微生物学实验室的优化管理 13
第一节 实验室流程优化管理 13
第二节 医学实验室质量和能力认可准则 14
第二篇 样本采集运送和处理 19
第一章 无菌体液的采集、接种、运送、增菌培养与次代处理 19
第一节 血液及骨髓标本的采集、接种、运送、增菌培养与次代处理 19
第二节 脑脊液标本的采集、送检、预处理以及接种方案 25
第三节 胸腹水、胆汁标本的采集、送检和接种处理 27
第四节 心包液、关节液和鞘膜积液的采集、送检和接种处理 29
第二章 呼吸道标本的采集、送检和接种处理 30
第一节 痰标本的采集、送检、初筛、预处理、涂片及接种处理 30
第二节 肺泡灌洗液的采集、送检和接种处理 35
第三节 鼻咽喉拭子的采集、送检和接种处理 36
第三章 消化道标本的采集、送检和接种处理 41
第四章 化脓和创伤标本的采集、送检和接种处理 48
第一节 脓肿标本的采集、送检和接种处理 48
第二节 创面分泌物的采集、送检和接种处理 49
第五章 泌尿生殖道标本的采集、送检、筛选和接种处理 52
第一节 尿液标本的采集、送检和接种处理 52
第二节 女性生殖系统标本的采集、送检和接种处理 55
第三节 男性生殖系统标本的采集、送检和接种处理 59
第六章 组织标本的采集、送检、预处理和接种 61
第一节 浅表组织（皮肤、黏膜、指甲、毛发）标本的采集、送检和接种处理 61
第二节 深部组织标本的采集、送检和接种处理 62
第三节 尸检标本的采集、送检和接种处理 63
第七章 真菌培养标本的采集、送检和接种处理 64
第一节 浅部真菌培养标本的采集、送检和接种处理 64
第二节 深部真菌培养标本的采集、送检和接种处理 66
第八章 结核标本的采集、送检和前处理 70
第一节 痰标本结核菌检测的采集、送检和接种处理 70
第二节 分枝杆菌培养其他类型标本的采集、送检和接种处理 75
第九章 厌氧菌标本采集、送检、验收和接种处理 77
第三篇 病原分离及鉴定 79
第一章 细菌的分类与命名 79
第一节 细菌分类的基本概念和知识 79
第二节 细菌的分类和鉴定 82
第三节 细菌的命名和认可 84
第二章 革兰阳性球菌 88
第一节 葡萄球菌属 88
第二节 微球菌属及相关菌属 90
第三节 肺炎链球菌 92
第四节 肠球菌 93
第五节 链球菌及其他相关革兰阳性球菌 95
第三章 革兰阳性需氧杆菌的分离和鉴定 99
第一节 概述 99
第二节 李斯特菌属的分离和鉴定 100
第三节 丹毒丝菌属的分离和鉴定 102
第四节 库特菌属的分离和鉴定 104
第五节 棒杆菌属的分离和鉴定 104
第六节 其他不规则革兰阳性需氧杆菌的分离和鉴定 110
第七节 需氧放线菌的分离和鉴定 112
第八节 革兰阳性需氧芽胞杆菌 119
第四章 革兰阴性菌的分离和鉴定 125
第一节 肠杆菌科细菌的分类 125
第二节 肠杆菌科细菌分离和鉴定的基本方法 126
第三节 肠杆菌科细菌分离和鉴定 128
第四节 埃希菌属 129
第五节 沙门菌属 131
第六节 志贺菌属 133
第七节 克雷伯菌属 135
第八节 肠杆菌属 135
第九节 沙雷菌属 136
第十节 枸橼酸杆菌属 137
第十一节 哈夫尼亚菌属 138
第十二节 变形杆菌属 138
第十三节 普罗威登斯菌属 140
第十四节 摩根菌属 140
第十五节 爱德华菌属 140
第十六节 耶尔森菌属 140
第十七节 其他少见肠杆菌科细菌 141
第十八节 非发酵菌 143
第五章 弧菌科的分离与鉴定 155
第一节 弧菌科的分类 155
第二节 弧菌属的鉴定 155
第三节 气单胞菌的分离和鉴定 158
第六章 革兰阴性球菌 160
第七章 革兰阴性苛养菌的分离与鉴定 164
第一节 概述 164
第二节 嗜血杆菌属 165
第三节 放线杆菌属 169
第四节 心杆菌属 172
第五节 艾肯菌属 172
第六节 金氏杆菌属 173
第七节 军团菌属 174
第八节 巴斯德菌属 177
第九节 博德特菌属 178
第十节 布鲁菌属 180
第十一节 弗朗西斯菌属 183
第十二节 巴尔通体属 185
第十三节 阿菲波菌属 186
第十四节 二氧化碳嗜纤维菌属 187
第十五节 链杆菌属 188
第十六节 萨顿菌属 190
第十七节 Dysgonomonas相关细菌 191
第十八节 未命名革兰阴性苛养细菌 192
第八章 分枝杆菌的分离和鉴定 193
第一节 分枝杆菌的分类与命名 193
第二节 分枝杆菌的生物学特征 194
第三节 分枝杆菌的实验室诊断 195
第四节 分枝杆菌的鉴定 200
第五节 分枝杆菌的致病性 202
第六节 分枝杆菌对抗菌药物的敏感性 203
第九章 厌氧细菌的分离和鉴定 206
第一节 厌氧菌概述 206
第二节 厌氧菌的分离培养 208
第三节 厌氧菌的鉴定法则 208
第四节 革兰阳性厌氧球菌 210
第五节 革兰阴性厌氧球菌 212
第六节 革兰阴性厌氧无芽胞杆菌的分离和鉴定 216
第七节 革兰阳性厌氧无芽胞杆菌的分离和鉴定 221
第八节 革兰阳性厌氧有芽胞杆菌的分离和鉴定 230
第十章 其他病原微生物的分离和鉴定 238
第一节 螺旋体 238
第二节 支原体和脲原体的分离和鉴定 241
第三节 衣原体 243
第四节 立克次体的分离和鉴定 245
第十一章 微需氧菌的分离与鉴定 249
第一节 弯曲菌属 249
第二节 螺杆菌属 251
第三节 弓形菌属 252
第十二章 致病性真菌及鉴定特征 254
第一节 概述 254
第二节 临床常见深部真菌的致病性及鉴定依据 258
第三节 其他真菌鉴定依据 262
第四节 侵袭性真菌病和真菌定植 264
第四篇 药物敏感性试验 265
第一章 药物敏感性试验的方法学 265
第一节 常规药物敏感性试验选择抗菌药的原则及基本知识 265
第二节 常规药物敏感性试验抗菌药种类的确定 269
第三节 纸片扩散法药敏试验 270
第四节 稀释法药敏试验 274
第五节 E-test法药敏试验 278
第二章 真菌药敏试验 282
第一节 真菌药敏试验的判断标准 282
第二节 真菌药敏试验的方法 283
第三节 真菌药敏试验的临床价值 286
第三章 厌氧菌药敏试验 288
第一节 简介 288
第二节 厌氧菌药敏试验方法 288
第四章 细菌耐药监测软件Whonet5.6的应用 293
第一节 简介及软件安装 293
第二节 软件设置 294
第三节 软件应用 301
第四节 统计功能 305
第五节 BackLink 2导入程序的应用 310
第五章 耐药菌株的实验室检测 318
第一节 耐药菌株的常规检测方法 318
第二节 三维试验 325
第三节 碳青霉烯酶测定 327
第六章 药敏试验相关问题解答 329
第五篇 临床微生物学实验室的分子生物学诊断 337
第一章 耐药基因的检测 337
第二章 病原微生物的分子诊断 341
第一节 核酸的分离和纯化 341
第二节 分子生物学技术在感染性疾病诊断中的应用 342
第三节 病原细菌、真菌的DNA测序鉴定 345
第六篇 医院感染控制 349
第一章 医院感染监测的基本概念 349
第一节 医院感染监测对象与内容 349
第二节 医院感染环境监测 349
第三节 医院感染中的消毒和灭菌 351
第二章 消毒灭菌剂（设备）监测 358
第一节 压力蒸汽灭菌器的监测 358
第二节 干热灭菌设备的监测 360
第三节 环氧乙烷灭菌设备的监测 361
第四节 紫外线消毒设备监测 362
第五节 使用过程化学消毒、灭菌剂的监测 363
第三章 消毒灭菌效果监测 366
第一节 消毒灭菌后内镜的监测 366
第二节 环境空气的监测 366
第三节 物体表面的监测 367
第四节 手、皮肤黏膜的监测 368
第五节 医疗器械采样及检查方法 368
第六节 手术室环境的监测 369
第七节 血液净化系统的监测 371
第四章 医院感染管理方法学进展 372
第一节 医院感染监测分子流行病学方法 372
第二节 感染源同源性监测方法学 373
第三节 感染源鉴定方法学 374
第七篇 实验室与临床 379
第一章 感染与致病菌 379
第一节 感染性疾病的基本概念 379
第二节 呼吸道标本中致病菌的确定 380
第三节 肠道标本中的致病菌的确定 382
第四节 血液及骨髓标本的微生物感染 383
第五节 尿液标本的微生物感染 385
第六节 化脓和创伤标本的微生物感染 386
第七节 生殖道标本的微生物检验 387
第八节 厌氧菌感染 387
第九节 真菌感染 388
第二章 药敏试验与用药 390
第一节 药敏试验的临床价值 390
第二节 药敏试验的局限性 392
第三节 药敏标准和疗效标准 393
第三章 经验用药和病原检测 397
第一节 经验用药依据 397
第二节 微生物实验室数据在特殊治疗方案中的价值 408
第三节 真菌药敏试验的临床价值 410
第八篇 抗菌药物 413
第一章 作用机制 413
第一节 抗菌药物相关的名词解释 413
第二节 抗菌药物的作用机制 414
第三节 细菌对抗菌药物的耐药机制 420
第四节 临床上重要致病菌的耐药性变迁和耐药机制 438
第五节 细菌耐药性的防治 456
第二章 抗菌药物临床药理 459
第一节 抗菌药物药代动力学 459
第二节 抗菌药物药代动力学和药效学结合与临床疗效 462
第三节 治疗药物浓度监测与个体化给药方案的制订 465
第三章 抗生素的分类和名称 468
第一节 β-内酰胺类抗菌药物 468
第二节 氨基苷类抗菌药物 471
第三节 喹诺酮类药物 473
第四节 大环内酯类药物 474
第五节 四环素类药物 476
第六节 多肽类 477
第七节 林可酰胺类药物 477
第八节 磷霉素 478
第九节 夫西地酸 478
第十节 利奈唑胺 479
第十一节 利福霉素 479
第十二节 莫匹罗星 480
第十三节 甘氨酰环素 480
第十四节 奎奴普丁/达福普汀 480
第十五节 达托霉素 481
第十六节 磺胺类 481
第十七节 抗真菌药物 481
第十八节 抗厌氧菌药物 483
第十九节 抗结核药物 484
第九篇 临床微生物学实验室的法律法规 485
第一章 临床微生物学实验室的通用法规 485
第一节 病原微生物危害评估 485
第二节 实验室的分类、分级及适用法规 486
第三节 细菌（毒）种保藏机构法规 487
第二章 特殊病原微生物学实验室活动生物安全法规 489
第一节 艾滋病实验室生物安全法规 489
第二节 结核实验室生物安全法规 490
第三节 可感染人类高致病性病原微生物的运输法规 490
第三章 病原微生物菌（毒）种实验室保留资质法规 492
第一节 卫生部对病原微生物菌（毒）种保藏的最新文件 492
第二节 管理办法总则 492
第三节 病原微生物保藏机构的职责 492
第四节 非保藏高致病性微生物菌（毒）种机构实验活动法规 493
第四章 抗菌药物合理应用相关法规 494
第一节 抗感染药物合理应用基本概念和要求 494
第二节 在抗菌药物专项整治中微生物学实验室的任务和职责 495
第十篇 商品试剂和设备 499
第一章 细菌鉴定和药敏 499
第一节 API鉴定系统 499
第二节 ATB细菌鉴定和药敏系统 501
第三节 自动细菌鉴定和药敏系统 506
第四节 MALDI-TOP质谱技术 510
第二章 自动血液培养系统 512
第一节 BACTEC 9000系列全自动血培养系统 512
第二节 BacT/Alert 3D全自动细菌、分枝杆菌培养检测系统 512
第三章 深部真菌感染的实验室诊断 515
第一节 1，3-β-D-葡聚糖测定 515
第二节 念珠菌抗原和抗体测定 517
第三节 曲霉菌抗原和抗体测定 520
第四节 新型隐球菌抗原测定 522
第四章 成品培养基性能评价 524
第一节 首代固体分离培养基性能评价方法学与主要评价指标 524
第二节 药敏培养基性能评价 529
第三节 运送培养基性能评价 530
附录1 WHONET软件中常用抗菌药物中英文对照及其代码 533
附录2 WHONET软件中常用细菌中英文对照及其代码 540