模块一 目的基因的克隆及序列分析 1
1-1 RNA的提取及检测 4
1-2 RT-PCR方法扩增目的基因 13
1-3 cDNA末端快速扩增法（RACE）合成目的基因 22
1-4目的基因的克隆 37
1-5目的基因的序列测定及初步分析 54
1-6 cDNA文库的构建及目的基因的筛选 57
1-7 mRNA差别显示克隆差异表达基因 72
1-8电子克隆法获得目的基因 80
1-9化学合成法获得目的基因 84
模块二 核酸分子杂交 87
2-1 Southern杂交 90
2-2 Northern杂交 108
2-3原位杂交 114
2-4原位RT-PCR 127
模块三 大规模基因差异表达分析 132
3-1基因芯片分析 135
3-2基于第二代高通量测序技术的转录组测序分析 140
3-3差异表达基因功能富集分析 146
3-4实时荧光定量PCR检测基因表达 151
模块四 单核苷酸多态性的检测 157
4-1衍生酶切扩增多态性序列法 160
4-2 Taqman荧光探针法 165
4-3高分辫率熔解曲线法 171
4-4定向诱导基因组局部突变技术 178
模块五 目的基因的遗传转化 182
5-1 PCR法克隆目的基因全长 185
5-2 Gateway技术构建表达载体 188
5-3农杆菌真空渗入法遗传转化 193
5-4水稻愈伤组织的遗传转化 197
5-5 RNAi发夹式载体构建及转化 203
5-6 CRISPR/Cas9技术构建表达载体 208
5-7大规模突变体库的构建 214
模块六 蛋白质样品的制备、分离与鉴定 219
6-1蛋白质样品的制备 222
6-2蛋白质的定量 227
6-3 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳分离蛋白质 231
6-4双向电泳分离蛋白质 238
6-5荧光标记差异分析凝胶电泳法分析差异表达蛋白质 253
6-6蛋白质样品的质谱鉴定 264
模块七 目的蛋白质表达、纯化与检测 281
7-1目的基因原核表达质粒的构建 284
7-2谷胱甘肽S-转移酶（GST）融合蛋白的表达与纯化 289
7-3组氨酸标签融合蛋白的表达与纯化 293
7-4麦芽糖结合蛋白（MBP）融合蛋白的表达与纯化 296
7-5免疫印迹检测目的蛋白质的表达 300
模块八 蛋白质相互作用的研究 305
8-1经典酵母双杂交 308
8-2 Pull-down分析蛋白质相互作用 319
8-3蛋白质亚细胞共定位 328
8-4免疫共沉淀 333
8-5 T7噬菌体展示筛选技术 339
8-6细胞质酵母双杂交系统 349
模块九 激光扫描共聚焦显微镜的应用 355
9-1激光扫描共聚焦显微镜的基本使用 358
9-2花粉管内钙离子梯度分布的观察 363
9-3动物细胞微丝微管细胞核共定位观察 369
9-4激光扫描共聚焦显微镜检测荧光蛋白 372
模块十 生物信息学软件与数据库应用 377
10-1常用分子生物学数据库检索 380
10-2常用分子生物学软件使用 391
10-3蛋白质结构及其相互作用预测 405
附录 409