第一篇 组学生物信息学基础 3
第一章 组学技术、数据和生物信息学原理 3
第二章 组学数据的数据标准：数据共享和重用 31
第三章 组学数据管理和注释 71
第四章 交叉组学研究项目的数据和知识管理 97
第五章 组学数据的统计分析原理 113
第六章 不同层次组学数据综合分析的统计方法和模型 133
第七章 时序组学数据集的分析 153
第八章“组学”术语的恰当使用 173
第二篇 几种常用组学数据及分析方法 199
第九章 高通量测序数据的计算分析 199
第十章 对照研究中的单核苷酸多态性分析 219
第十一章 拷贝数变异数据的生物信息学分析 235
第十二章 基于免疫共沉淀的芯片数据处理：从原始图像生成到分析结果浏览 251
第十三章 基于基因表达谱的全局机制分析和疾病相关性 269
第十四章 转录组数据的生物信息学分析 299
第十五章 定性和定量蛋白组数据的生物信息学分析 331
第十六章 质谱数据代谢组数据的生物信息学分析 351
第三篇 实用组学生物信息学 379
第十七章 组学数据处理过程中的计算分析流程 379
第十八章 组学数据的整合、储存和分析策略 399
第十九章 信号通路、相互作用网络构建和功能分析研究中组学数据的整合 415
第二十章 时间依赖型组学数据的网络推断 435
第二十一章 组学和文献挖掘 457
第二十二章 组学和生物信息学在临床数据处理中的应用 479
第二十三章 基于组学的病理和生理过程分析 499
第二十四章 基于组学的生物标记发现中的数据挖掘方法 511
第二十五章 癌症靶标识别的综合生物信息学分析 527
第二十六章 基于组学的分子靶标和生物标记鉴定 547
索引 573