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卷一玉石（上品）丹沙 3

云母 4

玉泉 5

石钟乳 6

涅石 7

消石 8

朴消 9

滑石 9

石胆 10

空青 11

曾青 12

禹余粮 12

太一余粮 13

白石英 14

紫石英 14

青石、赤石、黄石、白石、黑石脂 15

白青 16

扁青 16

草（上品）昌蒲 17

鞠华 18

人参 19

天门冬 20

甘草 21

干地黄 21

术 22

兔丝子 23

牛膝 24

充蔚子 25

女萎 25

防葵 26

茈胡 27

麦门冬 28

独活 29

车前子 30

木香 31

署豫 31

薏苡仁 32

泽泻 33

远志 34

龙胆 34

细辛 35

石斛 35

巴戟天 36

白英 36

白蒿 36

赤箭 37

奄闾子 38

析蓂子 39

蓍实 40

赤芝、黑芝、青芝、白芝、黄芝、紫芝 40

卷柏 42

蓝实 43

芎 43

蘼芜 44

黄连 45

络石 45

疾藜子 46

黄耆 47

肉松容 47

防风 48

蒲黄 49

香蒲 49

续断 50

漏芦 50

营实 51

天名精 51

决明子 52

丹参 53

茜根 53

飞廉 54

五味子 54

旋华 55

兰草 55

蛇床子 56

地肤子 57

景天 58

因陈 58

杜若 59

沙参 60

白兔藿 60

徐长卿 61

石龙刍 61

薇衔 62

云实 63

王不留行 63

升麻 64

青蘘 64

姑活 65

别羁 65

屈草 66

淮木 66

木（上品）牡桂 67

菌桂 68

松脂 68

槐实 68

枸杞 69

柏实 70

伏苓 70

榆皮 71

酸枣 72

檗木 72

干漆 73

五加皮 73

蔓荆实 74

辛夷 74

桑上寄生 75

杜仲 76

女贞实 76

木兰 77

蕤核 77

橘柚 78

人发髲 79

兽（上品）龙骨 79

麝香 80

牛黄 81

熊脂 81

白胶 81

阿胶 82

禽（上品）丹雄鸡 82

雁肪 83

虫鱼（上品）石蜜 84

蜂子 85

蜜蜡 86

牡蛎 86

龟甲 87

桑蜱蛸 87

海蛤 88

文蛤 88

蠡鱼 89

鲤鱼胆 89

果（上品）藕实茎 90

大枣 91

蒲萄 91

蓬蘽 92

鸡头实 93

米谷（上品）胡麻 93

麻蕡 94

菜（上品）冬葵子 96

苋实 96

瓜蒂 97

瓜子 97

苦菜 98

卷二玉石（中品）雄黄 100

石流黄 101

雌黄 102

水银 102

石膏 103

慈石 103

凝水石 104

阳起石 104

孔公孽 105

殷孽 105

铁精 105

理石 106

长石 106

肤青 106

草（中品）干姜 107

枲耳实 107

葛根 108

括楼根 109

苦参 109

当归 110

麻黄 110

通草 111

芍药 112

蠡实 113

瞿麦 114

元参 114

秦艽 115

百合 115

知母 116

贝母 117

白芷 117

淫羊藿 118

黄芩 119

狗脊 120

石龙芮 120

茅根 121

紫菀 121

紫草 122

败酱 122

白鲜 123

酸酱 123

紫参 124

藁本 124

石韦 125

萆薢 125

白薇 125

水萍 126

王瓜 127

地榆 127

海藻 128

泽兰 128

防己 129

款冬花 129

牡丹 130

马先蒿 131

积雪草 131

女菀 132

王孙 132

蜀羊泉 133

爵床 133

假苏 133

翘根 134

木（中品）桑根白皮 134

竹叶 135

吴茱萸 136

栀子 137

芜荑 137

枳实 138

厚朴 138

秦皮 139

秦椒 140

山茱萸 141

紫葳 141

猪苓 142

白棘 143

龙眼 143

松萝 144

卫矛 144

合欢 145

兽（中品）白马茎 145

鹿茸 146

牛角 146

羖羊角 146

牡狗阴茎 146

羚羊角 147

犀角 147

禽（中品）燕屎 148

天鼠屎 149

虫鱼（中品）猬皮 149

露蜂房 149

鳖甲 150

蟹 150

柞蝉 150

蛴螬 151

乌贼鱼骨 152

白僵蚕 153

鱼甲 153

樗鸡 154

活蝓 154

石龙子 155

木虻 156

蜚虻 156

蜚廉 156

虫 157

伏翼 158

果（中品）梅实 159

米谷（中品）大豆黄卷、生大豆、赤小豆 159

粟米 160

黍米 161

菜（中品）蓼实 161

葱实 162

薤 162

水苏 163

卷三玉石（下品）石灰 165

礜石 166

铅丹 167

粉锡 167

代赭 167

戎盐 168

白垩 169

冬灰 169

青琅玕 169

草（下品）附子 170

乌头 171

天雄 172

半夏 172

虎掌 173

鸢尾 174

大黄 174

亭历 175

桔梗 175

莨荡子 176

草蒿 177

旋复花 177

藜芦 178

钩吻 179

射干 179

蛇合 180

恒山 180

蜀漆 181

甘遂 182

白敛 182

青葙子 183

雚菌 183

白及 184

大戟 184

泽漆 185

茵芋 185

贯众 185

荛花 186

牙子 187

羊蹢躅 187

商陆 188

羊蹄 188

萹蓄 189

狼毒 190

白头翁 190

鬼臼 191

羊桃 191

女青 192

连翘 193

闾茹 193

乌韭 194

鹿藿 194

蚤休 195

石长生 195

陆英 195

荩草 196

牛扁 197

夏枯草 197

芫华 197

木（下品）巴豆 198

蜀椒 199

皂荚 200

柳华 200

楝实 201

郁李仁 201

莽草 202

雷丸 203

桐叶 204

梓白皮 204

石南 205

黄环 205

溲疏 206

鼠李 206

药实根 207

栾华 207

蔓椒 207

兽（下品）豚卵 208

麋脂 208

鼠 208

六畜毛蹄甲 209

虫鱼（下品）虾蟆 209

马刀 210

蛇蜕 211

蚯蚓 212

蠮螉 212

吴蚣 213

水蛭 213

班苗 214

贝子 214

石蚕 215

雀瓮 215

蜣螂 216

蝼蛄 216

马陆 217

地胆 218

鼠妇 218

荧火 219

衣鱼 220

木（下品）桃核仁 221

杏核仁 221

米谷（下品）腐婢 222

菜（下品）苦瓠 222

水斳 223

未详彼子 223

序例白字 224

《本草经》佚文 226

附《吴氏本草》十二条 229

附诸药制使 231

附《药对》主统之本 246