分子生物学 原核生物和真核生物总论 上PDF电子书下载

第一章 分子生物学的系统和方法 1

分子生物学概述 1

本书如何讲述分子生物学 1

分子生物学问题中的物理学方法 2

研究生物反应的体外试验方法 3

分子生物学的逻辑 4

效率论点 4

模型分析 4

强烈推理 5

分子生物学中研究的几个问题 5

什么不是分子生物学 6

原核生物和真核生物 7

细菌 7

细菌的生长 8

细菌计数 9

细菌营养需要的测定 10

细菌的物理构造 11

细菌的代谢调节 12

噬菌体 12

噬菌体结构 12

噬菌体生活周期概述 13

噬菌体增殖非常迅速 14

噬菌体计数 14

噬菌体生活周期的调节 15

用纯化的噬菌体DNA感染细菌 15

酵母 15

动物细胞 17

非天然状态的动物细胞培养物 17

原始细胞培养物和确立细胞株 18

有用的原始细胞培养物 19

卵和卵母细胞 19

动物细胞计数 19

动物病毒 20

属、种和株系 20

以遗传学分析研究解决生物学问题 20

遗传学符号、规定和术语 21

突变型 22

突变型中的突变数目 22

回复子和回复 23

突变型的应用：一些实例 24

突变型的遗传学分析 26

遗传重组 26

遗传作图 26

连锁和多因子交叉 27

互补作用 28

互补分析：一个实例 29

噬菌体感染的细菌中的互补作用 31

细菌的遗传系统 31

Hfr细胞 32

用Hfr×F？交配进行基因定位 33

大肠杆菌的环状遗传图 34

大肠杆菌有关重组的基因 34

F’质粒 34

参考文献 35

第二章 生物化学基础 36

生物体系中的分子 36

官能团和键的类型 36

生物化学中的几类主要有机化合物 37

蛋白质的组分 38

嘧啶和嘌呤--核酸的组分 39

大分子 39

细胞的营养需要 40

细菌的营养需要 40

不溶性离子化合物不出现沉淀 41

影响细菌生长率的因素 42

藻类、酵母和原生动物的营养需要 42

动物细胞的营养需要 43

代谢和生化途径 43

酶 43

降解和生物合成反应 43

多步反应途径 44

降解和生物合成途径的能量学 44

能量代谢和贮存：ATP 44

ATP的合成 46

ATP能量的利用 47

如何阐明代谢途径 48

参考文献 49

第三章 大分子 50

几类主要大分子的化学结构 50

蛋白质 50

核酸 52

多糖 53

决定蛋白质和核酸三维结构的非共价相互作用 54

无规线团 54

氢键 54

疏水性相互作用 54

离子键 55

范德瓦耳斯引力 56

非共价相互作用效应小结 56

研究大分子所用的方法 57

沉降速度法 57

平衡离心法 58

电泳法 59

电子显微镜 60

大分子分子量的测定 63

DNA分子量的测定 63

蛋白质分子量的测定 64

参考文献 65

第四章 核酸 66

DNA的物理和化学结构 66

碱基配对和DNA双螺旋 66

DNA双链的反平行方向 67

不同生物中DNA碱基组成的变化 68

DNA螺旋的形式 68

DNA分子的大小 69

DNA分子的脆性 70

决定DNA结构的因素 70

变性和解链曲线 70

DNA中氢键的证据 71

DNA中疏水性相互作用的证据 72

碱基堆集 73

碱基堆集的协同性 73

溶液中离子强度对DNA结构的影响 74

DNA分子结构的变动 75

变性和链的分离 75

解链蛋白对DNA的变性 76

DNA的碱变性 76

变性DNA的结构 77

复性 78

复性的要求 78

复性的机制 78

不同生物DNA的杂交 79

复性的滤膜结合试验 79

复性的浓度相关性：C。t曲线 80

DNA异源双链 83

环状和超螺旋DNA 84

扭曲环 85

超螺旋中的单链区 85

超螺旋的起源 86

共价闭合环的实验检测 86

超螺旋的实验检测 87

RNA的结构 88

核酸的水解 88

多核苷酸激酶：一种有用的酶 90

核酸的放射性标记 90

核酸顺序测定 91

左手螺旋DNA 94

卫星DNA 97

参考文献 97

第五章 蛋白质分子的物理结构 99

蛋白质分子的大小 99

多肽链的结构 99

多肽链的折叠 99

氢键和α螺旋 101

β结构 102

纤维状蛋白和球状蛋白 103

蛋白质的结合部位 105

具有亚基的蛋白质 106

研究蛋白质的几种方法 107

蛋白质的变性 107

蛋白质的复性 108

蛋白质的水解 109

蛋白质氨基酸顺序的测定 109

蛋白质活性的调节 109

最终产物抑制 109

多亚基蛋白质的调节--变构 110

变构调节的两种机制 110

一种变构酶：天冬氨酸转氨甲酰酶 112

一种复合蛋白质：免疫球蛋白G 113

酶 115

酶-底物复合物 116

酶-底物复合物的形成理论 116

酶-底物复合物的分子细节 117

酶-底物复合物的解离：转换 119

酶活性的检测 119

酶活性的光学检测 119

酶的放射性检测 120

粗提液中酶活性的检测 120

放射性蛋白质的制备 121

参考文献 121

第六章 大分子的相互作用和复合聚集物的结构 123

胶原蛋白--蛋白质的多重组装 123

胶原蛋白的氨基酸组成和顺序 124

原胶原蛋白--三股螺旋的单位 125

原胶原蛋白单位间相互作用形成纤维 126

DNA的复合结构：大肠杆菌染色体 127

DNA与支架蛋白的相互作用 128

DNA的多环结构 129

染色体和染色质 130

组蛋白和染色质 130

染色体的结构层次 131

核小体 132

核小体的组装：30纳米纤维和染色体结构的螺线管模型 134

DNA与能识别特定碱基顺序的蛋白质之间的相互作用 135

λ噬菌体的Cro蛋白和DNA的结合 135

生物膜 139

生物体系中膜的作用 139

膜的基本双层结构 140

囊泡 142

基本双层结构的调节：通透性和运输 142

细菌的细胞壁 144

细胞壁的多层结构 145

肽聚糖层 146

内膜和通透性 147

外膜：脂多糖、脂蛋白和微孔蛋白 147

周质空间 149

对渗透压敏感的细胞 149

复杂聚集物的自动装配 149

烟草花叶病毒的组装 149

参考文献 151

第七章 遗传物质 153

中心法则 153

遗传密码和插座假说 153

DNA是遗传物质的实验证据 154

转化实验 154

化学实验 158

捣碎实验 158

RNA作为遗传物质的问题 161

遗传物质的特性 161

DNA对遗传信息的贮存和传递 161

信息从亲本向子代的传递 162

DNA及其信息含量的化学稳定性 162

DNA的变化能力：突变作用 164

RNA作为遗传物质 165

参考文献 165

第八章 DNA的复制 166

DNA复制的基本规则 166

DNA复制的几何学 166

双链DNA的半保留复制 167

Meselson-Stahl实验 168

半保留复制的几何学 169

环状DNA分子的复制几何学 170

DNA促旋酶的作用机理 173

DNA复制的酶学 175

聚合反应和聚合酶 176

前体的来源 177

聚合酶Ⅰ和Ⅲ的性质 177

链延伸的方向 182

DNA连接酶 182

不连续复制 183

复制叉中的短片段 183

片段的检测 184

尿嘧啶片段 185

前体片段的RNA末端 187

前体片段的连接 188

在复制叉上发生的事件 189

复制叉的推进和螺旋的松开 189

单链模板上的复制起始：前体片段的起始 190

复制叉上发生事件的总结 192

前导链合成的起始 194

大肠杆菌的全程起始 194

D环 194

通过共价伸展的起始：滚环复制 195

双向复制 197

复制的终止 200

环状分子复制的终止 200

线状DNA分子T7噬菌体DNA的终止 201

DNA的甲基化及错配修复 203

细菌DNA合成的调节和部分复制的DNA分子的重新起始 203

真核生物染色体的复制 205

真核DNA中的多复制叉 205

染色质的复制 205

参考文献 208

第九章 修复 210

DNA分子的改变 210

修复作用的生物学迹象 212

胸腺嘧啶两聚体作为可修复初级损伤的证据 214

胸腺嘧啶两聚体修复的生物化学机制 214

光复活 214

切除修复 215

重组修复 216

SOS修复 218

胸腺嘧啶两聚体修复的总结 220

交联的修复 221

电离辐射损伤的修复 223

为什么受损伤的细胞会死亡？ 223

参考文献 224

第十章 突变形成、突变和突变体 225

术语 225

突变的类型及其表示法 226

突变体的分离 227

突变体的检测 227

突变体的富集 228

在双倍体细胞中检出突变体 229

突变体的生物化学基础 230

突变形成 231

碱基类似物诱变剂 232

化学诱变剂 233

紫外线辐射 235

嵌入剂引起的突变 235

嵌入DNA长片段(转座因子)引起的突变 236

增变基因 236

突变的热点 236

缺失、重复和重排 237

回复 238

回复子的检测 238

第二个位点的回复子 239

移码突变的第二个位点的回复子 240

诱变剂促进的突变位点回复 240

基因外回复 241

回复作为检测诱变剂和致癌物的手段 241

参考文献 242

第十一章 转录 243

RNA的酶促合成 243

RNA合成的基本特性 243

大肠杆菌RNA聚合酶 245

位点选择：Ⅰ.启动子 247

位点选择：Ⅱ.Prtbnow顺序 248

位点选择：Ⅲ.-35顺序 248

位点选择：Ⅳ.CAP部位 250

RNA链的起始 251

链的延伸 251

终止和新合成RNA的释放 253

RNA分子的种类 256

信使RNA的结构 256

mRNA的寿命 257

稳定的RNA：核糖体RNA和转移RNA 258

tRNA分子的加工 259

大肠杆菌中核糖体RNA的加工 261

原核生物中加工过程的小结 263

真核生物中的转录 263

真核生物的RNA聚合酶 264

真核生物inRNA分子的5’和3’末端的结构：“帽子”和“尾巴” 264

RNA剪接 265

转录单位的概念 270

真核生物的rRNA基因 270

真核生物tRNA分子的形成 271

研究细胞内RNA的方法 273

RNA分子的分离 273

DNA-RNA杂交法 274

检测X噬菌体的mRNA 274

用杂交竞争法区分两类mRMA 275

用DNA的特定片段杂交 278

用特定链进行杂交 278

Southern转移技术 280

参考文献 281

第十二章 翻译Ⅰ.信息问题 282

翻译概要 282

遗传密码 283

两类密码 283

三联体密码的遗传学证据 284

密码子碱基组成的阐明 286

密码子碱基顺序的阐明 288

终止密码子的确定 288

起始密码子的确定 289

密码的通用性 290

密码过剩 290

遗传学上证实密码子词汇 291

解码系统 291

tRNA和氨酰合成酶 291

tRNA的三叶草结构 292

tRNA的三维结构 293

氨基酸与tRNA分子间的连接 294

氨酰合成酶 296

tRNA分子被相应的合成酶识别 297

氨酰化中错误的校正 298

密码子-反密码子的相互作用 299

反密码子环中的次黄嘌呤核苷 299

过剩--一个反密码子对应于数个密码子：摆动假设 300

密码子-反应码子相互作用的稳定性 302

稀有tRNA分子 303

原核细胞起始tRNAfMet的特殊性质 303

tRNA基因 305

校正(抑制)基因 306

无义校正基因的遗传检验 306

无义校正tRNA 307

无义校正的生物化学特征 308

校正tRNA存在时的正常终止 309

错义突变的抑制 310

由反密码子变化引起的错义抑制 310

由突变tRNA错误携带氨基酸引起的错义抑制 311

起抑制基因作用的突变合成酶 311

移码抑制基因 311

温度敏感性(Ts)校正基因 312

促抑制基因的突变 313

酵母中的校正基因及其在动物细胞研究中的应用 313

遗传学在研究tRNA中的作用 313

正确选择AUG起始密码子 315

原核细胞mRNA的始起信号 315

多顺反子mRNA中的重复起始 317

多顺反子mRNA中不同顺反子有不同的起始温度 318

真核细胞中起始tRNA和核糖体结合位点 319

重叠基因 321

线粒体的遗传密码 322

参考文献 325

第十三章 翻译Ⅱ.蛋白质合成的机构和化学本质 326

核糖体 326

原核细胞核糖体的化学组成 326

真核细胞核糖体的化学组成 327

大肠杆菌核糖体和真核细胞核糖体的比较 328

大肠杆菌核糖体的重建 329

原核细胞核糖体的物理结构 331

真核细胞核糖体的物理结构 335

蛋白质的生物合成 336

多肽链生长的方向 336

mRNA翻译的方向 337

蛋白质合成的概观 337

原核细胞中的起始 340

原核细胞中链的延伸 341

链的终止 343

GTP的作用 343

蛋白质的翻译后修饰 344

复杂的翻译单元 345

多核糖体 345

转录与翻译的偶联 346

蛋白质合成的一些参数 347

蛋白质合成的抑制剂和效应物 348

影响蛋白质合成的抗生素 348

真核细胞中蛋白质合成的抑制剂 349

链霉素诱导的错读和链霉素依赖性 350

真核细胞中的蛋白质合成 351

真核细胞和原核细胞中蛋白质合成的差别 351

线粒体和叶绿体中的蛋白质合成 352

真核细胞中的结合核糖体：内质网 353

为什么蛋白质合成如此复杂？ 355

无核糖体的多肽合成 356

参考文献 357