![基于随机游走模型的蛋白质网络研究](https://cover.qianqiantushu.cc/99/s6a75bc1.jpg)
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基于随机游走模型的蛋白质网络研究PDF电子书下载
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- 作 者:彭玮
- 出 版 社:昆明:云南大学出版社
- 出版年份:2017
- ISBN:9787548230052
- 页数:123 页
第一章 绪论 1
1.1 蛋白质相互作用网络及随机游走模型 1
1.1.1 蛋白质间的相互作用 1
1.1.2 蛋白质相互作用网络的研究内容 2
1.1.3 随机游走模型 15
1.2 本书的研究意义 19
1.3 本书的主要研究内容 21
1.4 本书的结构 23
第二章 基于加权的随机游走模型预测关键蛋白质 24
2.1 问题来源 24
2.2 加权的随机游走模型及相关定义 26
2.2.1 实验数据和分析 26
2.2.2 直系同源得分 28
2.2.3 边加权 28
2.2.4 计算排序得分 29
2.2.5 ION算法 30
2.3 结果与讨论 33
2.3.1 参数α对ION性能的影响 33
2.3.2 与8种中心性方法的比较 34
2.3.3 基于Precision-Recall曲线比较实验结果 35
2.3.4 基于Jackknife方法比较实验结果 36
2.3.5 ION与其他8种中心性方法的不同 37
2.3.6 ION识别的蛋白质的模块性、直系同源性和关键性 40
2.3.7 直系同源得分 42
2.3.8 基于大肠杆菌数据集验证ION的性能 44
2.4 本章小结 46
第三章 基于加权的PageRank-Nibble算法预测蛋白质复合物 48
3.1 问题来源 48
3.2 WPNCA算法 49
3.2.1 加权的PageRank-Nibble算法 49
3.2.2 挖掘具有核心—附件结构的蛋白质复合物 52
3.3 实验结果 55
3.3.1 实验数据和评价机制 56
3.3.2 参数对预测性能的影响 57
3.3.3 与已知蛋白质复合物的匹配 58
3.3.4 功能富集分析 61
3.3.5 基于Krogan蛋白质相互作用数据的实验结果 65
3.4 本章小结 67
第四章 基于不平衡的双随机游走算法预测蛋白质功能 68
4.1 问题来源 68
4.2 不平衡双随机游走算法及相关定义 69
4.2.1 实验数据 69
4.2.2 构建功能相似性网络 70
4.2.3 已知蛋白质和GO Term关联关系的统计与分析 71
4.2.4 不平衡双随机游走算法 72
4.2.5 评价指标 74
4.3 实验结果 75
4.3.1 基于Precision-Recall曲线下的面积验证性能 76
4.3.2 基于TP-FP曲线验证性能 76
4.3.3 参数对 UBiRW性能的影响 78
4.4 本章小结 79
第五章 基于划分一匹配策略的比对算法挖掘保守的蛋白质复合物 81
5.1 问题来源 81
5.2 方法 82
5.2.1 查找两个物种中蛋白质间潜在的映射关系 83
5.2.2 划分—匹配蛋白质相互作用网络 84
5.3 实验结果 88
5.3.1 实验数据 88
5.3.2 与已知蛋白质复合物匹配 89
5.3.3 保守的蛋白质复合物在生物上的相关性 93
5.3.4 基于AlignNemo的实验数据集验证各个方法 95
5.4 本章小结 97
第六章 总结 99
6.1 主要贡献和创新点 99
6.2 展望 101
参考文献 103
攻读博士学位期间的主要研究成果 121
后记 123
- 《红色旅游的社会效应研究》吴春焕著 2019
- 《汉语词汇知识与习得研究》邢红兵主编 2019
- 《生物质甘油共气化制氢基础研究》赵丽霞 2019
- 《东北民歌文化研究及艺术探析》(中国)杨清波 2019
- 《联吡啶基钌光敏染料的结构与性能的理论研究》李明霞 2019
- 《异质性条件下技术创新最优市场结构研究 以中国高技术产业为例》千慧雄 2019
- 《《国语》和《战国策》词汇比较研究》陈长书著 2017
- 《中国制造业绿色供应链发展研究报告》中国电子信息产业发展研究院 2019
- 《行政保留研究》门中敬著 2019
- 《新课标背景下英语教学理论与教学活动研究》应丽君 2018
- 《小中见大》彭玮歆著 2004
- 《中国对联集成 河南卷》彭玮主编 2001
- 《课程标准校本化实施 理科综合卷》彭玮,曾辉,赵桢楠等主编 2010
- 《课程标准校本化实施 中学语文卷》彭玮,曾辉,刘振庆主编 2010
- 《基于随机游走模型的蛋白质网络研究》彭玮 2017
- 《三农中国 第22辑》宋亚平主编;彭玮,王金华副主编 2014
- 《课程标准校本化实施 中学英语卷》彭玮,曾辉,叶娇著 2010
- 《中学学科技能体系的建构与应用》彭玮,曾辉主编;曾辉,高继红,刘振庆,陈勇宇等编写 2010
- 《课程标准校本化实施 中学数学卷》彭玮,曾辉,李丽荣等主编;李丽荣,夏繁军,曾辉等编写 2010
- 《三知斋诗词选集》彭玮著 2222
- 《大学计算机实验指导及习题解答》曹成志,宋长龙 2019
- 《大学生心理健康与人生发展》王琳责任编辑;(中国)肖宇 2019
- 《大学英语四级考试全真试题 标准模拟 四级》汪开虎主编 2012
- 《大学英语教学的跨文化交际视角研究与创新发展》许丽云,刘枫,尚利明著 2020
- 《复旦大学新闻学院教授学术丛书 新闻实务随想录》刘海贵 2019
- 《大学英语综合教程 1》王佃春,骆敏主编 2015
- 《大学物理简明教程 下 第2版》施卫主编 2020
- 《大学化学实验》李爱勤,侯学会主编 2016
- 《中国生态系统定位观测与研究数据集 森林生态系统卷 云南西双版纳》邓晓保·唐建维 2010
- 《中国十大出版家》王震,贺越明著 1991