新一代基因组测序 通往个性化医疗 典藏版PDF电子书下载
- 电子书积分:10 积分如何计算积分?
- 作 者:(德)M.贾尼特著;薛庆中译
- 出 版 社:北京:科学出版社
- 出版年份:2016
- ISBN:9787030474872
- 页数:228 页
第一部分Sanger DNA测序 3
1Sanger DNA测序 3
1.1Sanger测序的基础 3
1.2人类基因组计划的未来 6
1.3局限性以及未来的机会 7
1.4生物信息学是关键 8
1.5下一步将往哪里走 8
第二部分 新一代测序:通往个性化医疗 13
2Illumina基因组分析仪Ⅱ系统 13
2.1文库的制备 15
2.2簇的创建 15
2.3测序 16
2.4配对末端读序列 17
2.5数据分析 17
2.6应用 19
2.7结论 22
3应用系统生物公司(ABI)SOLiDTM系统:基于连接的测序 25
3.1引言 25
3.2SOLiDTM系统概述 26
3.3SOLiDTM系统应用 30
3.4结论 34
4新一代基因组测序:454/Roche GS FLX 37
4.1引言 37
4.2技术概述 38
4.3软件和生物信息学 40
4.4研究应用 42
5聚合酶克隆测序:历史、技术及应用 48
5.1介绍 48
5.2聚合酶克隆测序的历史 48
5.3聚合酶克隆测序 53
5.4应用 58
5.5结论 63
第三部分 瓶颈:序列数据分析 67
6新一代测序(NGS)数据分析 67
6.1为什么新一代序列分析有所不同? 67
6.2序列搜索策略 68
6.3什么是击中,为什么它对NGS十分重要? 69
6.4记分:为什么NGS的记分不同? 71
6.5NGS序列分析的策略 72
6.6后续数据分析 73
7DNASTAR的新一代软件 77
7.1个人基因组及个性化医疗 77
7.2新一代DNA测序——作为个性化基因组学的方法 77
7.3不同平台的优势 78
7.4计算机挑战 78
7.5DNASTAR的新一代软件解决方案 79
7.6结论 81
第四部分 新兴测序技术 85
8实时DNA测序 85
8.1全基因组分析 85
8.2个性化医疗和药物基因组学 85
8.3生物防御、法医、DNA测试和基础研究 86
8.4简单精巧:实时DNA测序 86
9使用Z型DNA分子替换的TEM直接测序 89
9.1引言 89
9.2方法的逻辑性 89
9.3优化改良核苷酸鉴定技术进行DNA序列单独聚合的TEM目力分辨率 91
9.4TEM基板和可视化 91
9.5利用聚合酶进行Z-标签核苷酸整合 93
9.6当前和新的测序技术 94
9.7精度 95
9.8ZS遗传学公司提出的DNA测序技术的优势 96
9.9更长读序列的优势 96
10单分子DNA条形码方法及其在DNA图谱和分子单体型中的应用 102
10.1引言 102
10.2单分子DNA条形码方法中的关键技术 103
10.3单分子DNA图谱 105
10.4分子单体型 108
10.5讨论 112
11光学测序:从图像化的单分子模板采集 116
11.1引言 116
11.2光学测序循环 117
11.3光学测序的展望 129
12基于微芯片的Sanger DNA测序 131
12.1基因组学分析的集成微流体装置 131
12.2Sanger测序微流体器件上网络聚合物的改进 133
12.3结论 136
第五部分 新一代测序:真实地整合基因组分析 143
13应用配对末端双标签多重测序进行转录组和基因组分析 143
13.1引言 143
13.2配对末端双标签(PET)分析的发展 144
13.3利用GIS-PET进行转录组分析 145
13.4利用ChIP-PET在全基因组上定位转录因子结合位点和表观遗传修饰 147
13.5利用ChIA-PET在全基因组上鉴定长距离互作 150
13.6展望 152
14利用454测序平台研究古基因组学 157
14.1引言 157
14.2DNA降解的挑战 158
14.3DNA降解对古基因组学研究的影响 158
14.4降解与测序的准确性 160
14.5样品污染 162
14.6解决DNA损伤的方法 164
14.7解决污染的方法 165
14.8还存在哪些基本问题,将来的前景如何 167
15ChIP-seq:蛋白质-DNA互作作图 171
15.1引言 171
15.2历史 171
15.3染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)方法 172
15.4基于双脱氧标签Sanger测序 173
15.5基于杂交的标签测序 174
15.6边合成边测序的应用 175
15.7ChIP-seq的医学应用 177
15.8挑战 178
15.9ChIP-seq方法的展望 179
16新一代测序技术在MicroRNA的发现和表达谱研究中的应用 184
16.1miRNA的背景介绍 184
16.2miRNA的鉴定 184
16.3实验方法 185
16.4验证 191
16.5展望 191
17基于标签的转录组学分析DeepSAGE,优于微阵列 195
17.1引言 195
17.2DeepSAGE 196
17.3数据分析 200
17.4基于标签的转录组表达谱的比较 202
17.5表达谱未来的展望 203
18新基因组学和个人基因组信息:伦理学问题 207
18.1新基因组学和个人基因组信息:伦理学问题 207
18.2新基因组学:它的特点是什么? 207
18.3伦理学的革新:为什么我们需要它? 208
18.4限制条款:全基因组学和本地伦理学观 208
18.5医学伦理学和希波克拉底保密性 208
18.6生物医学伦理学的原则 209
18.7临床研究和知后同意 209
18.8大规模研究伦理学:新观念 210
18.9个人基因组 210
18.10个人基因组计划:允许信息公开 212
英汉对照词汇 215
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