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第一章 核酸研究历史 1

§1.1 核酸研究起源 1

§1.2 核酸结构早期研究 2

§1.3 DNA结构的发现 6

§1.4 分子生物学研究进展 9

§1.5 化学与生物学的结合 11

§1.6 今后的发展趋势 13

第二章 核苷、核苷酸和核酸的结构 15

§2.1 概述 15

§2.2 核苷及核苷酸的物理性质 20

2.2.1 离子化 21

2.2.2 互变异构 23

2.2.3 氢键 24

§2.3 核苷及核苷酸的光谱性质 26

§2.4 核苷酸的形状 27

2.4.1 糖环的折迭 28

2.4.2 Syn-anti构象 30

§2.5 核酸的结构 32

2.5.1 核酸的一级结构 32

2.5.2 DNA的二级结构 36

2.5.3 RNA二级和三级结构 40

第三章 核苷的化学合成 45

§3.1 概述 45

3.1.1 具有抗病毒活性的核苷 45

3.1.2 核苷碱基的修饰 47

3.1.3 核糖部分的修饰 49

3.1.4 磷酸酯部分的修饰 54

§3.2 糖苷键的形成 56

3.2.1 碱基重金属盐缩合法 56

3.2.2 熔融合成法 57

3.2.3 季铵离子化法 58

3.2.4 碱基三甲基硅基衍生物法 59

3.2.5 糖苷键转移法 61

3.2.6 端基的立体化学控制 63

3.2.7 C-核苷 68

§3.3 糖环C-1位碱基形成法 69

3.3.1 碱基修饰核苷的合成 69

3.3.2 C-核苷 71

3.3.3 碳环核苷 72

§3.4 非环核苷的合成 75

第四章 核苷的化学反应 76

§4.1 核苷糖部分的反应 76

4.1.1 邻近基团反应 76

4.1.2 取代和消除反应 79

4.1.3 氧化反应 81

4.1.4 烷基化反应 84

§4.2 核苷碱基部分的反应 85

4.2.1 C-X键的形成 85

4.2.2 C-O键的形成 87

4.2.3 C-S键的形成 91

4.2.4 C-N键的形成 92

4.2.6 C-C键的形成 94

4.2.5 C-H键的形成 94

4.2.7 N-C键的形成 96

§4.3 包括糖和碱基的反应 97

4.3.1 环核苷的形成 97

4.3.2 糖苷的转移 108

第五章 核苷酸的生物合成 111

§5.1 嘌呤核苷酸的生物合成 112

5.1.1 从头合成途径 112

5.1.2 补救合成途径 120

§5.2 嘧啶核苷酸的生物合成 121

5.2.1 从头合成途径 121

5.2.2 补救合成途径 125

§5.3 脱氧核糖核苷酸的合成 127

§5.4 核苷酸的分解代谢 131

§5.5 核苷酸的聚合 134

5.5.1 DNA聚合酶 134

5.5.2 RNA聚合酶 135

§6.1 概述 137

第六章 糖环修饰核苷类似物的合成 137

§6.2 由核苷出发合成2’，3’-双脱氧核苷及其类似物 139

6.2.1 双脱氧核苷（包括不饱和类似物） 139

6.2.2 取代双脱氧核苷 143

6.2.3 氟代双脱氧核苷 150

§6.3 双脱氧核苷及其类似物的从头合成 153

6.3.1 双脱氧核苷和取代的双脱氧核苷 153

6.3.2 碳环核苷类似物 161

6.3.3 杂环类似物 169

6.3.4 无环双脱氧核苷类似物 172

§6.4 Oxetanocin及其类似物 175

6.4.1 Oxetanocin及其衍生物 175

6.4.2 Oxetanocin的碳环类似物 178

第七章 核酸的化学合成 182

§7.1 简介 182

§7.2 核酸合成中的保护基团 185

7.2.1 羟基保护基 186

7.2.2 氨基保护基 191

7.2.3 磷酸部分保护基 195

§7.3 寡核苷酸的组建 200

7.3.1 核苷磷酸的活化 200

7.3.2 磷酸二酯法 203

7.3.3 磷酸三酯法 205

7.3.4 亚磷酸三酯法 209

7.3.5 氢磷酸酯法 214

§7.4 固相合成 214

7.4.1 固相载体 216

7.4.2 固相亚磷酸三酯法 218

§7.5 固相合成的检测及方法 224

§7.6 多核苷酸的分离纯化 229

7.6.1 多核苷酸的分离纯化 229

7.6.2 合成多核苷酸结构测定 231

第八章 反义核酸 233

§8.1 反义寡核苷酸的化学改造 234

8.1.1 磷酸部分的改造 235

8.1.2 核糖部分的改造 240

§8.2 反义寡核苷酸的作用机制 241

8.1.3 杂环碱基的改造 241

8.2.1 抑制翻译机制 242

8.2.2 抑制转录机制 242

8.2.3 转录后过程抑制机制 243

8.2.4 非序列专一性抑制机制 243

8.2.5 RNase H机制 244

8.2.6 有相互作用基团的反义寡核苷酸作用机制 246

8.3.1 反义寡核苷酸透过细胞膜的能力 247

§8.3 反义寡核苷酸的性质 247

8.3.2 反义寡核苷酸的结合亲和性 251

8.3.3 反义寡核苷酸的杂交专一性 253

8.3.4 反义寡核苷酸的稳定性 254

§8.4 多肽核酸 256

8.4.1 多肽核酸的杂交性质 257

8.4.2 多肽核酸的分子生物学研究 258

8.4.3 多肽核酸的合成与改造 259

§8.5 反义寡核苷酸的应用前景 260

§8.6 酶性核酸 261

8.6.1 酶性核酸的类型 263

8.6.2 酶性核酸的改造 264

8.6.3 酶性核酸的转运 270

8.6.4 酶性核酸的应用前景 271

第九章 以DNA为靶点的抗癌药物 275

§9.1 以基因序列作为靶点 276

§9.2 DNA序列具有专一性所必须的条件 278

§9.3 DNA序列识别的分子结构方面的要求 280

§9.4 以小沟作为靶点 283

9.4.1 非共价复合物 284

9.4.2 共价复合物 292

§9.5 以大沟作为靶点 295

§9.6 嵌合及DNA切割试剂 298

§9.7 序列专一性和生物活性之间的关系 301

参考文献 305

缩写 307